mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGT ATACTTCTTTATATGCCCATA ACATACTTCTTTATATGCCCATATGAACCTGGCAAACTATGGAATGTAAAGAAGTATGT ACATACTTCTTTATATGCCCATATGAACCTGGCAAACTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTCAGGTATGGACCTTCACGCTGGTGCTAATGGAGGATGCAGGGTGGAAGAAAATAAAAGATGAAAGGTTCAGAGGAAGGTTCGCTTCTTCGCCTTCTTCTTCCCCCTCCTCCTTTCTTTTTTTTACTATTTAATGCTTGACATGGCAGACTGACTGGGGAGTCAATTGATGATCGTGTTCCAGTGCGTGTATTGTTCTGTCACTTTGCCTGTGTCAGCAGGTGGAAACGCTCATCAGGACATTAAATATTCAATATGCTGACTGCGGTATGGGCTTTGAAAGGCAATGGCAGAGAAAATCTCACTGTCCACTTCCATGGTTCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCTTTTGTTTTTTCTTCCTCTCTGTCTTTCTGCCAAAAGAAAGGGCCTCACTGCCTCCTTTCCCATTAAAATGAGAAAAAGGTGTCTTTATAGCAGATTGCATAATCCTGAAATTCTAGAGATAGAGCCAGCAGGAAGAAAAAAAGTACCCATGTGTGTGTATATATGGGTATGTGCCTAACGAGAATCGGAAAGGTTGTAACTAAATGCGCCTGGCTTATTAGAACTAATCTGAGTCTTAAAACTTCCTCTTCTTGATCTTTTACTGGGTTAACAAGTGATGCTTACAGGCAGGACAGAAATAAATTAAGATCAAAACCCAAGACTTTAAAGTGTCAGTGCTGTGGAATGAGAAAGTGATTTCTTCCAGCTAGAGTCTGAGATCATTTAGCTTCAGGTGCACTTTTAGAAGGCATGGAGCATACATGCATTTTTCAGGAT 1 1 3' arm Anolis_carolinensis mirnest mir-1 4e-24 gga-mir-1a-1 2e-25 -20.5 ((((((((((((((((..(((((((.......))...))))).)))))))))))))))) (-20.5)