mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCAAAAACTGCAATTACTT GTAATTGTGGTTTTTGCCATTA CTTTAGGCAAGGTTATTGCAATGGTAATTGTGGTTTTTGCCATTAAAAGTAAAGCAAAAACTGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATAAAAC TAGAGGTAAACACTATAGAACCTGGTAATTGATTGGCTGTAGAAGATTAAGGCCAAAAGGGAGCATGTTTGCACGGACAGAGAGTTTGGACACTTTGAACGGAAGCACCTTAGGTAACATCAGTTCTGCCATGTAAGTTGGTGCAATGTTTTCTGTTTTAGATGAAGAAACATGTTTAGTCAGGTAACTTGTCCAAAGACAAACAGCTGGAAGATGGCAGAGTTAAAGCTGGATTTCATTTAGGTCTTACTCAAAAAACTTTGCACTTTTCCCATGAGTGGCTGGTCCTGGCACCCTCAGGGCATGTCCAGAACCCTCCTAGCATCTGCAGGGCTGAGGATGCCTAGGCTTCTCTCTCTACCACCGGGACACTCGGATCTGCCTCCTTTAGGCAAGGTTATTGCAATGGTAATTGTGGTTTTTGCCATTAAAAGTAAAGCAAAAACTGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATAAAACCACTGGGCTCAGTGCTTCTACATGCATCACTGGGTACCGAG 2 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 9e-17 hsa-mir-548aj-2 8e-20 -33.4 .........(((((..(((((.((((((((((((((((((..(((....))).)))))))))))))))))).)))))..)))))........ (-33.4)