mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAACCGTAATTACTTTTGCA CGAAAGTAATTGTGGTTTTGC ACAAAATCTATTTAGGTTGCTGCGAAAGTAATTGTGGTTTTGCCATTGAAAGTAATCACAAAAACCGTAATTACTTTTGCACTAATCTGATATCGTATTA GAACCGGATACCGGGACTATATTCCCCATGAATATACACACATGATCTCAACCAAACTTCAGCAAATAGAGATTTATCGGTATATAAAGAGAATTCTACACCAAGATCAAGTAAGATTTATTCCAGGAATCCAAGGCTGACATTTCAGAATTGTTAACAAAATCTATTTAGGTTGCTGCGAAAGTAATTGTGGTTTTGCCATTGAAAGTAATCACAAAAACCGTAATTACTTTTGCACTAATCTGATATCGTATTAACTGGCTGAAGAGCCATGTGGTCACATCAACAAGGCAGAACAGGCATTTAACAAAATTCAGAAAGTCAGCACCTT 0 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.0000000000004 hsa-mir-548h-2 1e-18 -29.4 ...........((((((((.(((((((((((((((((((((.....(((......)))..))))))))))))))))))))).)))))))).......... (-29.4)