mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAAGTAATTGTGGGCTTTG AAAACTGCAATTACTTTTGCA GGAAGCACCAAACTGAAGGTATTCGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGCTTTGCCATTTCTTTAAATGGCAAAAACTGCAATTACTTTTGCAGCAACCTAACAGTTTTGGGCTCCACCACA ATCTAGAGGATCCCGTATTATCGCCCAACACTTCTAAAAGTAATCATATTCACAACAGTGGCAGGTAGCATCTAGGGACCATTTGACAACACTGATAAAAGGTCAACTGAGGCAGAATAAGATGCATAAAGAGTTAGTTTGAGCAAACAGTGATTTATGAAATCAGGAAGCACCAAACTGAAGGTATTCGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGGCTTTGCCATTTCTTTAAATGGCAAAAACTGCAATTACTTTTGCAGCAACCTAACAGTTTTGGGCTCCACCACAGGGATGGAAGGGGAAAGCTTTATGGGGTGAACACAGACGCAAGGCAAAGGAGACACTTGGTTGGTTACAATGATGTGGTCGCCGTACTGGCTTATCCCATTGGAAAGTCCCTAGTTGAAGTTAATTGACAGCTTCTGATTGACTAAGCTCGTGTTTCATTTTTCTTTAATATAGACATTTATCAGAAATAGCTCAAGTTAGGTTTCACTCAGGTGTTGCACATCCAGCAAGGCTGAGGTCACTTATGAAGTCTGACTGGCTTTGCTTAGGATTCTTCAGGCCTGTTTTCCTTTTTAATTTAACAATATAAAACAATTCATGTGACTCCAAAATATGTATGTACATAAGTCTACACAGAATGTGTATAAAAGCAAGCTGAGTGCG 2 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 8e-21 hsa-mir-548aa-2 3e-17 -49.4 (((.((.((((((((....((...(((((.(((((((((((((((((..((((((((((....))))))))))..))))))))))))))))).))))))).))).))))))))))...... (-49.4)