mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGATCATGTGGCAGTTTCACC TGAAGCTGCCAGCATGATCTAA TCTTCTTCTAATGGGTGCACCACTATCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTGCTTCCCTTTGTGAACAGAGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTGTTGGTAGCACAAGAAACCCTAA GGGGGAACTTTAGCTGCAGAAGCAGCAGAAGAAGCAGCTCTGTTGTATGATGGAGTATAGGTCTCTCTTTTCCCCATGAGTCTACCCTACTAGGGAGTGCTCTTCTTCTTCTTCTAATGGGTGCACCACTATCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTGCTTCCCTTTGTGAACAGAGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTGTTGGTAGCACAAGAAACCCTAATCCTGAAATAAAAACCCTAAGTCCCACTTCTATGCTTACTTTCTCATCTGGG 1 1 3' arm Vitis_vinifera mirnest MIR167_1 2e-46 vvi-MIR167e 7e-46 -42.5 .....((((.....((((((((.((.(((.(((((((((((.((((((((...(((..(((.......)))..)))...))))))))))))))))))).))).)).)))).)))).))))....... (-42.5)