mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGTGGCAGTTTCACC TTCTTCTTCTAATGGGTGCACCACTATCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTGCTTCCCTTTGTGAACAGAGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTGTTGGTAGCACAAGAAACCCTAAT GGGGGAACTTTAGCTGCAGAAGCAGCAGAAGAAGCAGCTCTGTTGTATGATGGAGTATAGGTCTCTCTTTTCCCCATGAGTCTACCCTACTAGGGAGTGCTCTTCTTCTTCTTCTAATGGGTGCACCACTATCAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTAAACTTGCTTCCCTTTGTGAACAGAGATCAGATCATGTGGCAGTTTCACCTGTTGTTGGTAGCACAAGAAACCCTAATCCTGAAATAAAAACCCTAAGTCCCACTTCTATGCTTACTTTCTCATCTGGG 1 1 5' arm Vitis_vinifera mirnest MIR167_1 2e-46 vvi-MIR167e 7e-46 -42.5 ......((((.....((((((((.((.(((.(((((((((((.((((((((...(((..(((.......)))..)))...))))))))))))))))))).))).)).)))).)))).))))........ (-42.5)