mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGATGCAGCGGTTCATCGATC TGGGTTTGAGTTGGGGTTGGTTTGAAGTCACTGGATGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAAATTGTTGTGAAAAAAGCAGATCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGTTCACTCCCTCTCTCTTATTCTCTCTT GCGGGGGGAGAGAAGGGAGAGAGAGAGGGAGAAAAACGTACGGCAATGGTGACCCTTCAGATTCCTGGTTCACGCTGTTACTCTTTCTACTCTCTCTCTCTAAACTGTTTTCTTTTCTTCTTTCTTTTATTTTTCTAAGTTCATTTGGTCAGATCTGTGGTTTTTGATTTTGTGTTTTTGAAAACATAGTTTTGCTTTCGTTTAGTGAATGGGGTTGTTTTTATGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGTTTTCTGCTTCTGGTGTTGCGAAATTGAGTGGGTTTGAGTTGGGGTTGGTTTGAAGTCACTGGATGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAAATTGTTGTGAAAAAAGCAGATCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGTTCACTCCCTCTCTCTTATTCTCTCTTTCAGAATTTAGTGTTTGTTTTATGTTCTGCTCTGTTTTTTTTTTAATGATTGGGGTTGTCTGTATGATTATGGACCCGTTTGGCTGCTGGGAAAGCGTGGGAAAACAGTTGAAACTCAGGAACCTTCTTAATTACATCATGAAGTGGGACGGGCTGTTGCATGATTCCGGGTTTCCTTCCTTTTTCCTATGATTTCTTGGCAAGCAAATAGACCATGTTCACAAATAGTCTTGTAAAGCTGTAACAGCCTGAAAATGCTGTTCTTGGAATTAGAATCGATTATTATTTAAAAAATTTCAACGAATTGTAGTTTATTGCAGGGAAGGAGATCCGCCCTGTGTTCTTCTGTGTTTCGAACAGACTCTGGTAGCATCACAACGCCAAATTCTTGCTGAATGTAGTAATTTCCAGTAAATTTTAATTATCTGTAACTTATGTGTATTCTTTTATAATTTTCCATTATTATGTATTATGATTTGAATTCATTTTAGGTGCCTGTAGCCTTGATTTAGACCCTTTTTTTAGTTTGATTTTATAATTATTGTTGTATTTGTAATTAACTATGTTTCTACTTTCTACTGACAAAAAAAAA 2 0 3' arm Vitis_vinifera mirnest MIR162_2 2e-43 vvi-MIR162 1e-53 -47.9 .(((...((((.((((..((..((((....((((((((((.((((.(((((((..(((.(((..(((((........))))).))).)))..))))))).)))).))))))))))..))))...))...)))).)))).))).. (-47.9)