mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACAAGTTCATCCAAGCACC TGCTTGGACGAATTTGCTAAG GCAGAAGAATTTTGATGATCTTCACAAGTTCATCCAAGCACCATCTAAAGCTCAAACAGGCCTACGATTTTCTTCAAAACTAGGCTTATTCATGATGGTGCTTGGACGAATTTGCTAAGAACATTAAGTTCTTGAAA CCTCATTCAAGGGGCATCTTCTTGAACTGAGGAGAAGAGAGGGGTGGTCGAGGTTGTGGTTGTGGTTGATGCAGAAGAATTTTGATGATCTTCACAAGTTCATCCAAGCACCATCTAAAGCTCAAACAGGCCTACGATTTTCTTCAAAACTAGGCTTATTCATGATGGTGCTTGGACGAATTTGCTAAGAACATTAAGTTCTTGAAAGTAAAGCCAAAGGGGCAGCTCAGTTCTGCAAGGTTTTTTCTTCTATGTTGATGGATCCACCATAACTTTGCATGGTAGGTAGGTAAATAACCTTCTCTTTTCCTTAAGTATGATTTTTTTTTCCTTTTTTTTGGGGGGTTTTTATTACTTTCTTTCTTTTCTTGCTTTGTTTCTTTTACTGAAGAGGATAAAAAGTACCTATGAAATCATAGTATTTGTGGTTTAGTTGCTTCTTGAAATAGAGGCCGGGAAGCTACCAGAGACACAGATCTCCACGCTGAATCCTTAAACCTGGAAGTTCTCTTTTGCTTCTTCAAACTATGGGGGTGCGGAAATCGACCTCCCACTTCTGACCTCTGTGTGAGCCAGTTTCACCGGCGACTGTCCGTTTCTTGTGGGGTTTCATAACACATATGACATGGTATTGGTAGCTTTTCTCTTGAGATCTCTTTTGCCCAGTCTTTATTAGTCTAGACCTTGTGTTTCTTGCAGCTTTCAGTTTGTATGGCAATCGGCCAACCCTAGTAGGTGGAGTGGAATCGAACCGATGTTAATCGGAAGGGTGGATGCAGGGTACTGCTTGACCGTTCGGATCTGCTAGGGATGAAACGGTGGGCTGTGCCGGCCTAAAATCATCATAAACATTATTGATGGTATTTTACTTGACATTTGATCATCGTCCCAATAAATTATCTATGTTTCCAC 3 0 5' arm Vitis_vinifera mirnest 100 vvi-MIR3623 9e-67 -44.9 ....((((((((.((((.((((..(((((((.(((((((((((((.........((.(((((((................))))))).))...))))))))))))).)))))))..)))).)))))))))))).... (-44.9)