mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGATTATGTGATAAGTGT GAATTGGATATATGATTACGTGA TATGGNNNNNTATGTGATTATGTGATAAGTGTTTATTGATTATGTTACGTTGTTCATAATGAATTGGATATATGATTACGTGATAACTGTT ATTTGCAATTAAATAATGNNNNAAATATGGNNNNNTATGTGATTATGTGATAAGTGTTTATTGATTATGTTACGTTGTTCATAATGAATTGGATATATGATTACGTGATAACTGTTTAGCATTTATGCAAAGTTAATAATGGAATGATTATGATGTTAAATTATGATTCGCAATTATATTGGTTAATGTTATTTTATTATGAAATCTCACCCCTTCTTCTTGAAAATGTTGCCCTTCGTATGAGTAACTTGCAGGTGATCGTGCTTAGTGTGCAGTTGCCGTCGTGAGTGGCCTTGCCTTCACTGTGTCGTCTANGTCGTTCTGATACGTAACGGGATGGGGTTTTATGCTATANCCTGCTTCATTCTCTTACGTGAACTGCCATGAATATTTACTGNTTTGATTAACTCTTTTGAGATACTTGTTGGGNCCTGCGTGCC 2 2 5' arm Medicago_truncatula mirnest 100 mtr-MIR2607 0.00000000000002 -15.3 ..........((((((((((((((.(((.((((...(((..(((...)))...))).))))..)))..))))))))))))))......... (-15.3)