mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATACTCCCTCCGTCCCAAAT TTGGGACGGAGGGAGTATAAC ACNNATTGTATACTCCCTCCGTCCCAAATTGTATGTCACTTAGGAAAAAATATTTGTCCCAAATTGTATGTTGCTTTACAATACCAATGAAAAATTAATGTTACTTTTCCTATTATATCCTTAACTATTTATTACTCTCTCTTCTTTCAATTCCTTCATTTATCTTTTTCATATCATTTATTGAGGACAATTTTGTAAAACAACTCATAATATCTCTTTCCCACACAATATTAATTACATTTCTTAATATGTGTGAAATGCCCAAAACGTCATACAATTTGGGACGGAGGGAGTATAACATTGG CGGCCGGGGCACTCTAATTGACNNATTGTATACTCCCTCCGTCCCAAATTGTATGTCACTTAGGAAAAAATATTTGTCCCAAATTGTATGTTGCTTTACAATACCAATGAAAAATTAATGTTACTTTTCCTATTATATCCTTAACTATTTATTACTCTCTCTTCTTTCAATTCCTTCATTTATCTTTTTCATATCATTTATTGAGGACAATTTTGTAAAACAACTCATAATATCTCTTTCCCACACAATATTAATTACATTTCTTAATATGTGTGAAATGCCCAAAACGTCATACAATTTGGGACGGAGGGAGTATAACATTGGTACCATTATGGTACACNAGTGTTATCTGTATATAACACATATCCTAGGGACTCACTAATGCAAGTACACACAGGGCCGTCCCTGTGAAATAGGAGGCTCGGCTCTCTTTTTAAAATAGACCCCTAGTAAAATAAAACGTAATTTTTGTGTAGTTAAATTTCATTAAAAAAAACATAATAAGAAGAACTTCTAAACATGAAAGGAATTAAAAAAAAAATAAGTGAAAGAGGTGAAATTTATCTAACGGTGTCGTTTGGATTTGTCACTCCTCTGTTGTGGAAAAGGGTAAAACGAATGGTTAATGCGAAGAAAAAAAATGATTGTTGTGATTCTTTCAATGAAATAGTTTTCCNAATTGACTGATTAAGTGATTATACAAATTANGGGTGATTTGATAGGATCTGATTTATGTACAAAAAGGAGAACTAGAGTCTAGAAAAGAACTCNAATGTGTACTAAAGAAAGAAAAGGATATAACATATATATATTTTTATTTAAGTGGGGGGTGGGTACTAAATTTAATTTTTCGTTAGAGACCCGTANCATTTANAGGNCCNGNCTGATTGANTACCTTGCACANCTTCNNGGNCNGGCCTGANTGTATCTATCTATATATATATATNGNANGCNNNGTCNCNCNNTAGNC 0 0 5' arm Medicago_truncatula mirnest MIR806 0.0003 tae-MIR1122 0.0002 -61.427 ........(((((((((((((((((((((((((((.((.((.(((((..(((((..........((...((((.(((((((..((.((((((((..((((........................................................))))....)))))))).(((.....)))))......))))))).)))).)).)))))...)))))((((((.((((((.........)))))))))))))).))..........)))))))))))))))))))))))))))....... (-61.427)