mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCCCTATATG TATAGGGACGGAGGGAGTAGT NTGAAAAACTTTGTCCTCATGTACTCCCTCCGTCCCTATATGTAACCCCCCGTTGCTTTTTTCACATTTCTTAAGAAAAGTTGTTAGTGTAGTTAATGTGTCTATTTTATGTGTTAATATTACTAAATTGTCCTTTGTTTGTATGTGTATTAAATTTGACTTTTTGTATTTTAAGACAAATTAGTAGGATTAATGAGGGGTATGTTTAGGAAAATAATAGTAAATGCATCTAGTAATTTGAAAAGGAGTTTACATTTAAGGACAAAAATAAAATCAAATGGGTGCTTACATATAGGGACGGAGGGAGTAGTATATANGGGAAAATGTTA TTACGGCCGGGGTCCNTGAAAAACTTTGTCCTCATGTACTCCCTCCGTCCCTATATGTAACCCCCCGTTGCTTTTTTCACATTTCTTAAGAAAAGTTGTTAGTGTAGTTAATGTGTCTATTTTATGTGTTAATATTACTAAATTGTCCTTTGTTTGTATGTGTATTAAATTTGACTTTTTGTATTTTAAGACAAATTAGTAGGATTAATGAGGGGTATGTTTAGGAAAATAATAGTAAATGCATCTAGTAATTTGAAAAGGAGTTTACATTTAAGGACAAAAATAAAATCAAATGGGTGCTTACATATAGGGACGGAGGGAGTAGTATATANGGGAAAATGTTAAGAATGCCTCTAAAAAATTCATTAAGAACTTTAAATAACAACTTTTGTAGATAATTTTGTTATTTAAAAATTTGTANATTAATTTTGAAATTTTTAATTTANAGTACTTAGAAAAAGTGTTTTGTAGATAATTTTGTTGAGTTTGTTTATCTTCTACTTTANAAGAGGGAGCTTGATTGAACCTTTCGAGCAGCTAGAATAGCCAAACCACATATAATGTTTTATTGTTGCTCAAGTCATATATTTCTTCCGTTCATATTTATAAGTAAAAAATAATTTTTTAAGTATAATCTCTTCGTTTCAAAATACATGTTCAATTTTTGCAATATGCACTATTCATCTGACTTACTTTGACCATACTTTTTAACTAATGTATAAATACAAATATTANCATGTAANACGTTGTTTGANTTGTCTCGAAAATATTTTTTAAATATTAAATTTTTATAATTTTTTACTTTANNNNATTAAANATATTAANGGNCAAAATNNNNNNTT 0 0 5' arm Medicago_truncatula mirnest MIR1122 0.00000008 100 -84.1 ......(((.((.((((.(((((((((((((((((((((((((((...((((((...((((..((.((((....)))).))..((((((..((((((...............))))))..)))))).((((((((.......(((((.(((...(((.(((.(((((........)))))..))).((((((...(((.((((..(((.........)))...)))).)))..))))))..)))..))).)))))..))))))))....))))...))))))...))))))))))))))))))))))))...)))..)))).)).))). (-84.1)