mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGTAATCCCAGCACTTTGG AAAAATTGGGAAATGGGCT TCTCTGCCCTTTTTAATGTTTCTGTTTTGTCTCTTAACCTTTAAAAATTGGGAAATGGGCTGGGTGCAGTGACTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGGGGCTGAAGCAGGTTGATTGCTTGATGTCAGGAGTTCA ACGGCCGGGGAGGGCACTCTTGCCNACATGCTGGTACAGTTCTCTGCCCTTTTTAATGTTTCTGTTTTGTCTCTTAACCTTTAAAAATTGGGAAATGGGCTGGGTGCAGTGACTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGGGGCTGAAGCAGGTTGATTGCTTGATGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATAATGAAACCCTCTCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGATGAGATCATGCCATTGNACTCCACCCTGGGCGACAGAGTAAGACTCTGTCTC 3 2 3' arm Medicago_truncatula mirnest Metazoa_SRP 4e-20 hsa-mir-619 0.0000000004 -35.1 .((((.......((((.((.((...(((((.((....((((((((..((((((.(((((((((((......))))).))))))..))))))...))))))))...)).)))))..))..)))))).....)))).... (-35.1)