mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGGTGCAGGTGCAAGTGC ATTTGCACCTGCATCTTATTG TATGCATGCCAATATGTTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTATTGCGGTTGTATTGTTTTTGACTCCACAAACAAAATCAAGTTCTGTCGATACAGTATGTGGGACAATTAGATATGGAAACTAATAAGCTTAGTTGAGGTGCAGGTGCAAGTGCAGGTGAATGCCATTTTGGTAATGTTTT CTACTAGTTATAGAGAGTGAGTGACAACTAGTAGCTAGCAGTTGTTGGATATAATATGATAAACAGGCTGCAGGTCATACAGGCAATATTATGCATGCCAATATGTTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTATTGCGGTTGTATTGTTTTTGACTCCACAAACAAAATCAAGTTCTGTCGATACAGTATGTGGGACAATTAGATATGGAAACTAATAAGCTTAGTTGAGGTGCAGGTGCAAGTGCAGGTGAATGCCATTTTGGTAATGTTTTCACTCCCATATATACACAGCAGTGCTGCCTCTTTTCTTTTCATCTGTCTGTGGTTCATTTGCAGTTTCATGGTGGCAGAAATATTGTACTGGTAATCATCAA 1 0 3' arm Populus_trichocarpa mirnest MIR530 2e-84 ptc-MIR530b 1e-85 -63.4 ...(((((((((.(((..((.(((((((((((((((((((((((((((..((..(((((((....(((..((((((.((...(((..........)))...)).)))))).)))...)))))))..........)).....))))))))))))))))))))))))))).))))).))))).))))... (-63.4)