mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGTGACAGCCTCACT AGAAGTTCGCAAAGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTAGAGAGAGCAGAAGAGTGCTAACCCTGACTAGGTCATGCTGTGACAGCCTCACTCCTTCCTGTTTGGGGACC TTGCTATATAACTTAGTTAATGCATCCAGTTAACTTCTTCTCATTCATCTATACTCTTCAGAATTTTTGTTCTGTCCACTTGCTTTTGTATATGCAAGTGTGTGATCAAATCAGTCCTTTTAGGTGGTGGTCTATATATCTTTTTGTGGTTCCAGAAGAGTATTGTGATGTTTTTTTCTCTTCTTTTAAGTGTTTCTCATATATGCACCCGCAGAGAGTGGAGTTGAGCCGTTACATACACAGTTGGGATTAGAAGTTCGCAAAGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTAGAGAGAGCAGAAGAGTGCTAACCCTGACTAGGTCATGCTGTGACAGCCTCACTCCTTCCTGTTTGGGGACCCAGTAGATTCTTCAACATCTGAAAGACACACAAGGCTTAAAAGCAAAAGTTCTTAGCTGCATCAAATACTGAAATCTATTCTAAGACGAGGTTGAGGTCGAAAGCTGTGATGCTGAGCCAGAGGAACACTCTTTTTCTTTAGGTTCTGAAGATTCTGGTTACTTAATATGCTGGATTTGCTTTTATATTATGGGGTTTTACATTTTGTTATATATTGCTGG 2 2 5' arm Phaseolus_vulgaris mirnest MIR167_1 3e-23 gma-MIR167a 3e-48 -44.3 ....((((.((((((((..(((((.((((.(((((((((((((.((.((((((.....((......)).))))))..)))))))))))))))...)))).)))))..)))))..))).)))). (-44.3)