mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCA GATTCAGCGGTTCATCGATC TTATTGTCATTTGTGTTCGGTAGAGGATCACTGGATTCAGCGGTTCATCGATCTGTTCCATAATCCTAATGATTGAATTTCATACGACGATTGAGAGAGAGATACGGGAAAAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTTCTTCCTGCTCAGCACGATCTTGTTT GAGCACAAAAAATGTATGATTTTGATATTTTCGGTTTTAATGTTTTTATCATTTCTATGTACATACTTTCATTTGTAGATCTAGTATCTTACTTTTGTTTGTTATGTTTATTGTCATTTGTGTTCGGTAGAGGATCACTGGATTCAGCGGTTCATCGATCTGTTCCATAATCCTAATGATTGAATTTCATACGACGATTGAGAGAGAGATACGGGAAAAGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAGTGTTCTTCCTGCTCAGCACGATCTTGTTTGTGATTCATAAAAATATAAATGGGGAAATCCAGTGCACAAGGCTCTTGCATGCACTGGTCGAGTCGGGTGAACTTGGGTCTAATACGTAGTGACAGACTCAAGATGTTTTTTTTTCACCGGGTTGGTTCTTTTTACGGACATATGAATTTTTGGTTCAAATCAGACCGGGTCACATAAATAATGAAATATTTGTCTTTATTACGATACGATGCAACTAAAAGCTAAAATCGAAAATAAAAAAAGTTATGTGTCATTTAGAAATAATCAGTGAATTAGTTGATCCAATTATTACTCTTTTTCATTGCTTTTCAATTTGTAAATTGTTTTATTTTCTTTTTGTGGTTTCATAAATCCATGTATATAGTCTCGTAATTTGATATCTATGACATATTTAAAGGTTGATTATTAAAAA 3 0 3' arm Helianthus_tuberosus mirnest MIR162_2 0.00000001 osa-MIR162a 0.0000000006 -57.1 .......((.(((((((.(((((((((.((((((((.(((.((((.(((((((.(((((....((((....(((...(((((.........)))))....)))..))))...))))).))))))).)))).))).)))))))).)))).))))).)))))))...))... (-57.1)