| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0002279 |
| Located between position 4686630 and 4686733 on chromosome scaffold_6 strand - |
| mature miRNAs for MI0002279: |
| ptc-miR171c (MIMAT0001985): AGATTGAGCCGCGCCAATATC |
| References |
| [1]Lu S, Sun YH, Shi R, Clark C, Li L, Chiang VL, Plant Cell. 17:2186-2203(2005)., "Novel and mechanical stress-responsive MicroRNAs in Populus trichocarpa that are absent from Arabidopsis" |
| [2]Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, Bohlmann J, Grigoriev I, Hellsten U, Putnam N, Ralph S, Rombauts S, Salamov A, Schein J, Sterck L, Aerts A, Bhalerao RR, Bhalerao RP, Blaudez D, Boerjan W, Brun A, Brunner A, Busov V, Campbell M, Carlson J, Chalot M, Chapm, Science. 313:1596-1604(2006)., "The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TTCCAAAGGAAACTTCTTTCTAGCAGACAATCTCTTCGCTGACATTCTGCACTCATGTTTCCAAGATTCTTATCTCTCTT
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