| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0002240 |
| Located between position 10015916 and 10016002 on chromosome scaffold_10 strand - |
| mature miRNAs for MI0002240: |
| ptc-miR167f (MIMAT0001946): TGAAGCTGCCAGCATGATCTT |
| References |
| [1]Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, Bohlmann J, Grigoriev I, Hellsten U, Putnam N, Ralph S, Rombauts S, Salamov A, Schein J, Sterck L, Aerts A, Bhalerao RR, Bhalerao RP, Blaudez D, Boerjan W, Brun A, Brunner A, Busov V, Campbell M, Carlson J, Chalot M, Chapm, Science. 313:1596-1604(2006)., "The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TAGCTAGGGTCTAAAATATATATATGGCAACAACTAGTTCAACAAATATAGGCTTATTATGTAATTCATCGATCCTTGGC
AGTCTTGATCATCGAGAAGTTGGGTGAAGATATGTGGCAGACCTTTATTAACCGATACTAAGGTAATTTAAATCTCAAAT
GGGAATCTTTGAGATTTTGTGAGGGGCATGTGCATGGCCACTGCATCAAATCATGATTCTTGCATGAAACTCCTTGAATC
CGTGCTTCATATGTTGTGGTTTAGCGTGGCAACCATTTATTTTGGAATAGATGCTATACTGGATTTTAAAACTATATATC
TTATTCTCTAATCCAGTTTCTATTAAATAATAAATTACTATATGTTTGATTGAATGCAACGTGATATAATATAATTGAAT
GTGTAATATTGTAATGAAAAAGAATATAATATAACGAAATGGGATGGTTTATTATATTCATTTGTTTGGTTCCAATGTAA
CGAGTGCGCGTACAAAGTTTTATTTCAATTCTTGCAGGTTTTGAAAATAGTTATTGTAGTCCTTTATAATAGTTTTTTTA
ACAATCATGTCCTTGTAACATTACTCTTCGTCATATAATAGTTTATTACATGATTTTTTATATAATGCTTGAGATGTAAT
AAGTCATTATATGTAATTGTAATGATCTATTACATTATAATTTTAAAAATCACATCATCAAACATAAGAATATAAGAAGT
CATGATCGTATTTTATAGTCCCTTAATTATATCTAATTATCAAACGTGTAATTAGTTTACACAGTATTTTAGGACGAAAT
ATATATTTTAATTCGTAGGCTACTGACAATTCATTGATTTTAGAAAGTATTCAGCAACCAGGCAGATCAATTATTGGCAC
AAGGCAATGTCAGGTATGCTAAAATGGAGAGAGGGGCTGCATAAAAGCCAAATCAAGAGATGGTTACAAGCATGTCAGTA
TATTATCTGGAACATTTACGTACAAACCATATGTAGATATCAGATATGATCCTGCATAGATACCGAAAGAAATGCCCATC
TCTCTCCTGCAAACCTTTCAGTAAAACCGCACTTAGATTGCTTTCTTATTCTAAGAGAGAGAGACATTTGTTTAAAATTT
GCAACGCTATATATATATATACACAGAGAGAGAGAGGGAGTCGGAGGAGATTAAAAAAGAAAAAGATGCTTTATATACAA
GAAACAAAAGCAATCTACAGATTACCAAATAAAAAAAATTAACTGTATTTTAATTATTTGCCTCGCATTGTCTCGATCGT
AGCCGATTGTACAAATTTCATATGTAAGCAATCTAAACCAGAGTGTTGCGCATATATAACATCGTATACAACTACTACTT
AACTGCAATGTCATATATATATATATATATATCTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGTAATGATCACACAAGCTTAATTAAGTT
ATTTGAATTGTTAGTTTCTGGTTAATTAGTTAAGGGTTTTGTCGTCAGGCATGAACTTTTTTTTGGGTGCAGAGGCATGA
AGAATGAGATTCAATCAAGTTATTATTCCAAGCTTGATAAATTAATGAAGTAATTCATCAATACAATATTAATTTGTATA
GTTAACTAATAAAATCGTTGGGCACCTAGTATCTAAGATATGTAGATATGCGCAGAATATATATATATATATATATATTA
GCTATAAAACCCTAGATGAAGGGAGATAACCTATAGTATGGGGTTTAATATTGAAGTGTTGAGTGTTTATAATTGGCCCA
CATCAGCGTAGGTACAGTTAACTTGCTTATGATAGAATGCATCCATATCGCAGGAAGAATATAACAGCCAAAGGGAATCT
ATTCCAAGAAAGAGAGGGGATTTTGAAAGCAATGATCATCTATTGGATATATAAAATAGATATGTTGAAATCAGAAAAAG
GGATTCATTTGGAATCTTGAAATCGGTAAATGATATCTCAAAAGGCCAAGGCAAATCTAATCAGGGTCTGGGAACACAGA
TCGATCAGCCATATGTTAGGTTATAATTGAATCGCAACATCCATGAAACTTTTTTCTCGAGAATGGCTCATGGCGTTGCT
AGCTAGCTTATGCACTTGGTTCCATCATCACACCAGGTGCAAAAGGGCTTCTAAAACAAAAGAAAAACCTAAACAAACAA
GTCGTTTTCCTGATTTTCTAGATCAGATATATGTTTATAATTAATTAACAACTACACGCAGCAGCTGGCACCAACCAGGT
GTAGGATCGGCAAGTATCCAAGATATGGCAAGTTTGCAAAGAAAAGGGTTATCATCAGCGAACAAAGAAAAGATGCTTAT
ATGGAATTGGGATAAATACACATCACATTATCGTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAAGCAGCAATGAGAG
ATTCACAAATTAAATTTCCTTTCTTCCTAGTTTATGTGTGAACCTTATGCAAACCATGCAAGATTTAAGTAGATATGGTC
CCCTCATATGCTCTCCTAGCACTCGTACACCCACCCCTTTTGGCTCATGGGTTTGATGCTTTACTCCTCACAGTCAGAGA
GATAGTCCCCCACTCTCCCAGGGCCCAGCCTAAGAAAGTATTTAATGCTCCTACAATATATATGGAAACACTCACTAACT
TGTCTGCAAAACTGCATGGTTCTCTTCTTGGCGTGACAATATTCAATTTGCATCATCAGGGACCACTCCTTACATTTTCC
ATATATAAATTTTGTTTTTATTTATTTTTTCCCTGTAGCCCGCTTTCTCAATCTTCACAGTCCTCCTATATTCCATCAAC
AACAAAAAATAAAAATCAAATTAATGATAAAATAATCCTGATAATTCATAACTCCCCTTCAATCCCCTCCTCATCCTTCT
ATTTATACCTCCTTCATCCTCTCACCCTCTTCATACCCTCTCATCTCCTGCTGTTCTTAAAGTACTAGCTATAACATATG
CTAGCTAGCTCTTCTGACTGTGCATCTTCTTATCGTGCAC