Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002216 |
Located between position 12933923 and 12934077 on chromosome scaffold_16 strand + |
mature miRNAs for MI0002216: |
ptc-miR164e (MIMAT0001922): TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
AAATGACATGAATCACAAGTGATGATTTTTGTATCCAAATTAGACATTAATTTGGTGAGAAAAATTTCAGAGGGATTTGC
TAAATGTTGATGCCATAAAACTTGATCCTGACAAAAATAGAAAAAAACCAGAAACTTGAATAAACTTATTTCTCCGagga
ttgcttgaaaaataatgaagtcattgaaaaaaaaacccttctccaatcatcttcttggtgatgaggtcctgaaaaataac
ccggtgtgaatcaaatataactagacaacttaaagtttgagtgagttttccaatggaaagcaattggaaaggaaaataaa
gaacatatagaacctaagattctacattttcagaaaacaatttaatctttattttactcttaacaaaaacatgttttata
tttgcaatagatacataagttggaatagaaatgtttttcaaaattatataaactggtcacttTGTTTGTTATATGATTAG
GAGCACCCAAATCACCAACCCAAAAACTATGCTCAATACTAGCAACTAAAGCAGTTTTAAATGCAGTCAAAATACCTTTT
ATATGTTTTTATGATAGATGAGTACAGTTTTTCAAGAAACAAACAATCTTACCAAAAAGAGTTGTGGAATCATAATTTTC
AAAAATTGACAAAACATGATCACCCTTCTTCTGAAGACATGCAACAAAATCATTAAAAAAAGACAGTTAGATTGGTAGAA
AAAATTACCACATCACTAAAAGAAGAATCAATGGAGTGAGCAGCGACATGAGCTCTATGTTCATAGCCTTTTTGAAGTCC
TTTCTTTTTTTCAAACTTAGGTTTCAACTCCAGATGAAGGGTCTAGCATCGCCCAATTAAATGACCAAGATTATGACAGT
GCCGACACTTCAAATCTTGTCATTTCCCTCGATAAGTCTTATCTTTCCTTATTTATCTATTAACGACATAAGCATGGGTC
TCTAACATAGTGGTTTTTTGCTCTAGATTCATGACTTTCTTGCGAGTTTCTTCTCTTTGAATTGTAGCACATACACTTGC
AAAAGATGGAAGATCAGGATTCATAAGAAATCGACTGCGGAGATCTTTATAATCTGGATCAAGGCTAGATAAAAGCTGGA
ATATCTTGTCTTCTTCCTCTTATTTCTTTAATACTACAACATCAACACTATGAGGGTGATATAATGCGAGTTCACTCCAC
ATACCTTTTAGTATTCCAAGCAATTGCACACAAGTCTTGTTATTTTGATGAAGGTTAGTAAGATCTTTTTTATTTAAGAA
ACATGAGTCATATTGTTCTAATTTCCATACATTTCTTTCATAGCCTCTAGAGATCAAAAAAAGATTCTGAATGGCTAAAT
ATTTGCATTATCAAGCTTTATAGGTTTGTGAGGAAGGATCAAAAGGTTTAATATGGCAATTAACATAGCCAAGTTTGGAC
CTTCCACCAAGGGCAATTATCACAACCCTTTACCAAAGAAGATAGTTAAGTTCATTCAACAATATAGAGCCCAGACGCTA
ATTAGAATTTGGTTCTCCTTCTAAAATGTTAGAAGGTTTGTTTCCAGCATCAACACTATCAGATTTAGAAGTTTCTGTCA
TAATAATCTTAAACAAAAAATAAAACAATAAGAACCTACTCTAATACCATGAAGATTCTTAATCTGTTACTATCCACAAA
AAATAAAACAATAAGAACCTACTCTAATACCATGAAGATTCTTAATCTGTTACTATCATAATTAATTACATGTACATAAT
ACAAGTTTTAAATAGAAAGGATACTAAAAATCTTACTCTACAATCTTGGCATATCAATTCATATTCTTATCATATCTACA
ATAATGTGAATCCACAACAATTAATTTACATAACAAATAGCAATAATATCGGCAAAAATTTAGCTTTCCTTCAATACAAT
TATTATAGTGAACTAGAATATTAATGCACATCACTACTAACATATAAGGTTTTCTTTTCTTTTTATTATAGATGGAGATT
GACCTAGAAGTTTTACTTTCTTAATCTCTCTTAAATCTCACTAATTAAGTGCAGGCATATCATGCATAAATAGTTATTGT
TGCTAGATAAATTATTACACCTGATTTTAGATCTGATCACTAGACTGTGTTTAATAACTTTAGTATAAAGTTTTTTAAAT
GATTTTTTGAAAATCCAAACTTAATTATCTAATTCAAACTTCTAGATGATTCAATACTTTTTAAGTGGGATAAACAAGGT
GAGTGAGACATGATGTTTATTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTATGTAGACAAGAGACGGTGATGCATTTATCTCTCTAAAT
TTATCAATACATAAAAAGTTGAATCATTTAAAATTGCTAAGCATGTGAGCACTTCACATTGGACTCCTAATGAGTATGGG
ATCTAAAGCTAATGAATTGATAATATCTATTGTTAAATTTGTTTAACTATTGTGGCTTTCTTGCCTTGGAGACCAAATAA
AGTATAAACTTAAGATTAGAACATTTGAATAAACAATAGTGACATGCCATTTTGAAATGCACTTCGAACTATTGTTCAGG
TGCCACCAACAAAATAATGGGATTAATCTTTTTAGTTGTCTTGAATTAAGAATTGCAAGCCATAGCTAGGGCATAGAAGT
AAATCTATTTTGCGTTAGTGATGCTGTGGTCCAATGCTATTCATGATTGTTGTGACAAGCTGTGCTTCGAGGTAAATTGC
TTTGCAAACTCACTAGGTCCCACATCCAACTAAGCCTTTTCATTTCTTGCCTCACAACCACCTTGGAACACACATTCATT
TACCTCCTGTTATAAATTAGTGGACACCGCGTACTGAAAATTGCAGATAGGTGTCCCAAATTCACCATTTTAAGAAAACT
CCACTCCACCTCTCCCACCCCCTTTCTTTCTCACTCATTTTCTTATGTGAGAGAGGAGCTAGCTAGGCTGAGTTTCTAGC
TAGAGCTATATCAGCGATATCAAGTGAAGAGAAGGTGTGT