Detailed information on CNT0011127


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q8L586|Y4958_ARATH, E-value = 2e-107

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
:
CNT0023603, E-value = 3e-23 (A. trichopoda)

Expression of CNT0011127

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (274 aa)
MKNRVSRSSSSPASLLLSMAAPRSLVVDTGRLLTRDEEMNLGLTPGAEDSPTGKRYKEGKFPLSRWEFAAALGVFVVFTVGLFSIYLTMPAAEYGKLKLP
RSLSDLRMLKDNIGTYAKVYPAKFILGYCSTYIFMQTFMIPGTIFMSLLAGALFGVFKGLILVVFNATAGASSCFFLSKLIGRPLVSWLWPEKLRFFQAE
IAKRRDKLLNYMLFLRITPTLPNLFINLASPIVDIPFHIFFSATLVGLIPAAYITVKVNFLQLVVVFPVMLVRI*

>peptide 2 (45 aa)
MENSSCLVPFPTSGCSRIILEHMPKCILRNSFWVTAQHTYSCRHL*

>peptide 3 (29 aa)
MQPLPHGRKEAISQLSNAHPNILKKSTRS*

>peptide 4 (37 aa)
MLCSLPTPYVLPSVSLLSDPQLPVVLFKVMSNVADRF*

>peptide 5 (41 aa)
MKRSSSAFSEIELKSCGLLTHSMSSKTVQVNNLAMHLSSCL*

>peptide 6 (51 aa)
MDVKRLFPNSLTPIQIFLKKVQEAEALFSLYMGKSVPGCHAWHQHRCCIKW*

>peptide 7 (35 aa)
ILIYIQKNKKLVDYFDFKSRFFLYFLVDFLGFDLI*

Sequence

>CNT0011127
ATTCTGATCTATATTCAAAAAAATAAGAAATTGGTTGATTACTTTGATTTCAAATCTCGATTTTTTCTGTATTTTTTGGTGGATTTTCTGGGATTTGATT
TGATTTGAATTTCCATTAATTTTGGGGTGATTATTTTTGGATTTTCTTTGTGGGTTTTGATTAAGGTGACAGATAATTCAAGATTTTGTTTTGGGGGTCT
GTTTCTTGGATTTTTTTGGTGGGGTTTGATTGAATTTTGTTATATAAATTCAAATGTATGAAGAATAGGGTGTCACGTTCATCATCATCACCAGCATCGT
TGTTGTTGTCAATGGCTGCGCCAAGGAGTTTGGTAGTGGATACGGGGCGGTTGCTGACAAGGGATGAGGAAATGAACTTAGGTTTGACGCCGGGAGCTGA
GGATTCACCGACTGGTAAAAGGTATAAGGAAGGGAAGTTTCCGTTGTCAAGATGGGAGTTTGCGGCAGCTTTAGGTGTATTTGTGGTGTTTACAGTAGGG
TTGTTTTCTATATACTTGACAATGCCAGCTGCTGAGTATGGAAAACTCAAGTTGCCTCGTTCCCTTTCCGACCTCCGGATGCTCAAGGATAATATTGGAA
CATATGCCAAAGTGTATCCTGCGAAATTCATTCTGGGTTACTGCTCAACATACATATTCATGCAGACATTTATGATTCCTGGGACAATATTCATGTCCCT
GCTTGCTGGAGCACTTTTTGGTGTTTTTAAAGGGCTTATCTTGGTTGTCTTTAATGCTACAGCTGGTGCATCGTCCTGCTTTTTTCTGTCTAAATTAATT
GGCAGGCCTTTAGTTAGCTGGTTGTGGCCTGAAAAATTGAGATTCTTCCAGGCAGAGATAGCCAAGCGTCGGGATAAGTTGCTCAACTATATGTTGTTTC
TGAGAATAACTCCAACATTGCCAAATCTTTTCATCAACTTGGCATCTCCAATCGTGGATATACCATTCCATATTTTCTTCTCGGCCACATTGGTTGGTCT
CATTCCAGCTGCATATATTACCGTCAAGGTAAACTTTCTTCAGCTGGTGGTGGTTTTTCCCGTCATGCTTGTCCGTATTTGATGTTCTTTCAACTGTATT
ACTCAATTTTGCTCTGAAATGATTGGTATAATGCATCTAGAGGACATGCTTTCTTAAAAAAGTAACTAGCTTCCTTTGTGTGGTGACTCTCTTACAACAA
CATACCCAGTGAAATCTCACAGGTGGGGTGTGGGAAGGGTAGAGCCAGGAGTGTATGCAGCCCCTACCTCATGGACGTAAAGAGGCTATTTCCCAACTCT
CTAACGCCCATCCAAATATTCTTAAAAAAAGTACAAGAAGCTGAAGCCTTATTCTCGTTATATATGGGTAAATCAGTTCCAGGATGTCATGCTTGGCACC
AACATAGATGTTGCATTAAATGGTAGAAGTATACGAACACAATCTAACGTTGGTAGCATTTAAGAGTTGGCCTCTACAGGTGATGTGGAGTCCCATAATG
TGATAGTGATGGTAAAGGTTCTCTGTGTGTTACTTCCATAAAAAGACGAAAGCTATACTGGTGCGTACATTAAATGAAAAGATCATCAAGCGCATTTTCT
GAAATCGAGTTAAAATCGTGTGGGCTGTTGACCCACAGCATGTCATCTAAAACTGTCCAAGTGAATAATTTGGCAATGCATCTCTCGTCTTGTCTATGAA
CTAAGATGATACATCTTTTGTTGAGGTTTGCAGTGCCAATGTCACTTGTGAGACCTGAGTGATCACTCCTTTATATTTTTGTAATCTCATATATGATGTT
TTATTTTAACTTGTCAGGCCGGCCTAGCTCTTGGTGAGCTTAAGTCTGTGAAAGATCTGTACGATCTCAAGACCTTGTCCGTGCTCTTCCTCATTGGTTT
TATCTCGATATTACCTACCATCTTGAAGAGGAAGAAAATATACGAATAAAGCTCCTCCCAGAAGGCCAATTTGGATCCTCTTGGAAAGTAACTTATAGAA
GATATAGTTTAATTTTATTTTCGGAGCAAGGCAAGACATAGCGAGACAAATCTATATTTTACATATGGAAATCTGAAATCTACATTTGACTGTCCAATCC
ATTGGTAGAATAGTGGAAAATGTTGTGTTCTTTACCAACTCCTTATGTTTTACCCTCAGTTAGTCTGTTATCTGACCCGCAGTTACCAGTAGTATTGTTT
AAGGTAATGTCAAATGTAGCAGACAGATTTTGATACTAATTCTGATTCAAGATTGATCTTATAGTCATTTCACTGTTCAGTATTTTCTTGTTTGATCTTA
TGGTCATCCCAACTGCC