Detailed information on CNT0012184


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FV52|MAP1B_ARATH, E-value = 2e-69

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
:
CNT0000735, E-value = 2e-06 (G. max)

Expression of CNT0012184

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (60 aa)
MGTAVVVLAGLVASLKLLGWSLVEHTFLFFGAGEAGTGIAEIIALAISKKTNAPVEEARK*

>peptide 2 (37 aa)
MPNHGEPATVSLPRLVISQSIKNIVVQILWYNLIFMR*

>peptide 3 (43 aa)
MDWNKMKMCYECSIPIHKNGILFFIEFINSFETPITCKYMFFS*

>peptide 4 (29 aa)
MNGLDAGAILGNSQCYFQSSTSASGLSLI*

>peptide 5 (36 aa)
KKSFMKTSPAPSLLLYISLIASSPFLRHFSTTSSTM*

>peptide 6 (29 aa)
MDMIHSTSSTPISISSHFRALTIKFNLIW*

>peptide 7 (36 aa)
MLKNLVMVLLIVLLDMVLGQYFTLNHSYFITPGDVP*

>peptide 8 (41 aa)
MGGFRRVCAYPSMSECVMEYLTHSSCRVIMAIRQRPFSVVT*

>peptide 9 (55 aa)
KIIYENFTSSFTSPLHFSHRFITISPSFLHHFFNYVNFIYFTRFGIEIAILSVYR*

>peptide 10 (45 aa)
MKVVKQIYGEKVLVQYEDFANHDAFELLVKYGDSCCGTCGACCIA*

>peptide 11 (97 aa)
MCHGIPDSQQLQGYHGDTSKTFFCGDVSESIKRLVKVTEECLHYGSAVCRDGALYRKIGKRISEHAEKFGYGVVDRFVGHGIGTVFHSEPLIFHHPR*

Sequence

>CNT0012184
AAAAAATCATTTATGAAAACTTCACCAGCTCCTTCACTTCTCCTCTACATTTCTCTCATCGCTTCATCACCATTTCTCCGTCATTTCTCCACCACTTCTT
CAACTATGTAAACTTCATCTACTTTACGAGATTCGGAATCGAGATAGCCATTTTAAGTGTGTACCGATAACCATTGATGTGGGAACAAATAATGAGCAAC
TATTGAAAGACAAGTTCTACATTGGACTCAGACAAAAAAGAGCTACTGGCGAGGAATACTACAACTTTCTTGAAGAATTCATGAAGGTTGTGAAGCAAAT
CTACGGCGAAAAAGTTCTTGTACAGTATGAAGATTTTGCGAATCATGACGCTTTTGAGTTGTTGGTGAAATATGGGGACAGCTGTTGTGGTACTTGCGGG
GCTTGTTGCATCGCTTAAGCTGCTTGGATGGTCCTTAGTTGAGCATACGTTCTTGTTCTTTGGTGCTGGAGAAGCTGGAACTGGTATAGCTGAAATCATA
GCACTTGCAATTTCAAAAAAGACAAACGCCCCTGTGGAGGAAGCGCGTAAATAACTATTGATCTCACACTTTGCTTGAATATGTGATGCCTAACCATGGG
GAGCCAGCTACAGTGTCATTACCCAGATTGGTTATCTCCCAGTCCATTAAGAACATAGTTGTTCAGATACTGTGGTACAACCTCATTTTTATGAGGTAAC
TACTTTGCCTGTCAATCTGGGAAAGGGTCTTGCTTGCTTAAAACTACAACTTTGCTTTTGTGAGCAAAGTAACCTTTGACAAGGTTCTTATGTATCAAAA
TGGACATGATACACTCCACCTCATCAACACCCATATCAATCTCAAGCCACTTTAGAGCTCTAACAATTAAGTTTAACTTGATTTGGTGAGCTTTATTCTG
AGCTTTATTCTGATCTTTCTGCTTCTGGATAATAGAGATCTTTTTTAGTAACCTCTGGTAAACTTGGAGCTCTAGCTTGTCCAGGACAAGATAAAGGCCA
GACCTAAAAAACTGGACTTCATGTTCCTGCAGAGCACGTCGAAGAAGTCGTAGATAATGGGAAACTTGACCTGTATGTAGCACATAATGGGTAGATTTGG
CTCTCTTATCTAAAAGAAGCAGCTGGTAATGAATGGGCTTGACGCAGGTGCTATTTTAGGAAACTCACAATGTTATTTTCAGTCAAGTACAAGTGCATCT
GGGTTGAGCTTAATCTAAAAGTATTATATGTCCCTGTAACTTTCTTTTTGCACTAGAAGGAAATCTCCAGACAAGCAGCATTTTAGCAATAGAAACAAAA
AAAAAAGTTGACTAAGTAGGAGTTGAATCCTCATATGTAGATGTTTTTTTGATGTTCAATTGAAATATGAGGTGGGTTCTCATAAAATGTTTCCTTCAAA
ACCTCTATGGATTGGAACAAAATGAAGATGTGCTATGAATGTTCGATCCCTATTCACAAGAATGGTATCTTATTTTTCATCGAGTTTATTAATTCCTTTG
AAACCCCTATAACATGTAAATACATGTTTTTTTCTTGAATCTATAAGCCTTCAGTAACAACAAATGAAATTGACAAAGTTGTGCATCAAATGATAATCAA
TGCTGGCGCTTATCCATCTCCCTTAGGCTATGGGGGGTTTCCGAAGAGTGTGTGCATATCCGTCAATGAGTGAATGTGTCATGGAATACCTGACTCACAG
CAGCTGCAGGGTTATCATGGCGATACGTCAAAGACCTTTTTCTGTGGTGACGTGAGTGAATCCATAAAGCGGCTTGTAAAGGTGACTGAGGAGTGCTTGC
ACTATGGAAGTGCTGTTTGCAGAGATGGTGCTCTTTATAGGAAGATAGGAAAGAGGATCAGTGAACATGCTGAAAAATTTGGTTATGGTGTTGTTGATCG
TTTTGTTGGACATGGTATTGGGACAGTATTTCACTCTGAACCACTCATATTTCATCACCCCAGGTGATGTTCCATGAACTGTTGCAAGTCCTTTCTTGAG
TTTGGATGCTAGTGAAGACTTTTCATCAATAAAAGCAAGATTAACCAACAGTTTTCGTAGTGATTTCAAGTTCCTTTTAATCGTAATGGTTGGGGTGAAT
AAATTATTTCAATATAGCTTGTAAAACGAATAGTACACTTAATGATATATTTTTGTGTTTGAAATATGTTTTATTTCTTAATACTAATATGTCCTTTTAG
GTTTGGACTATGATGTACATGTTAATTAGTCATTAATATTTAAAATTGAA