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Detailed information on CNT0015973


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q944A6|SNF4_ARATH, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0002298, E-value = 1e-13 (G. max)

Expression of CNT0015973

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
LFPFFFLLKKIFFLLNSPYSDFLLQSFHISRVFIP*

>peptide 2 (104 aa)
FFLFFFCLKKYFFYSILHIPIFSFKVFTFLGFSFPDQVPFPSYSFKIEALFTILSENSKFLFVISSINLGICLKFCLLGKGVGFLLFYLEWALCCLIFIE
FRFC*

>peptide 3 (486 aa)
MYPSAMDYARDGGTALIPTRFVWPYGGRSVYLSGTFTGWSQWPMAPVEGCPTVFQTVCSVPPGYHQYKFIVDGEWRHDENQPFVSGSLGTVNTVLLARES
DYLPAVLSAQIPPSSNMDVDNQAFQRLVRVSDVALPDDASKISQSDLDISRHRISAVLSTHSAYELLPGSTKVIALDVDLPVKQAFHILHEQGIPMAPLW
DFSRAQFVGVLSALDFILIMRELGNHGSNLTEEELETHTISAWKEAKSYLSRQANELGKSAPRQLVWSGPDNSLKDVALEILQNGVATVPIIHSPALDGS
YPQLLYLASLSEILKHICRYFKHSPESLPILQLPIGAIPLGTWVPKIGEPNRQPLAMLRPTASLNAALNLLVQAQVSAIPIVDDNDSLLDIYSRSDITAL
AKDKIYTHINLEEMSIHQALQLAEEPYATYGLSSQKCHMCLRSDSLHEVMERLSRPGVRRVVVVEAGSKRVEGIISVGDIFKFLLG*

>peptide 4 (50 aa)
MLPCQMMLPRYRSQIWIFPATAYLQSYQHIQLMSCFQGRPRSLLWMLTYP*

>peptide 5 (29 aa)
MAWSFRMLGSKELRHVNFHNCFPPFYYSY*

>peptide 6 (34 aa)
MGSENWRAKSTTPGNAEAYCFSECSIEFVSASSS*

Sequence

>CNT0015973
CTTTTTCCTTTTTTTTTTTTGCTTAAAAAAATATTTTTTTTACTCAATTCTCCATATTCCGATTTTCTCCTTCAAAGTTTTCACATTTCTAGGGTTTTCA
TTCCCTGATCAAGTTCCCTTTCCTTCATATAGTTTCAAGATCGAAGCTCTTTTCACAATTCTATCGGAAAATTCAAAATTTTTGTTTGTCATTTCATCCA
TTAATTTGGGTATTTGCTTAAAATTTTGTTTGCTGGGTAAAGGTGTTGGCTTTCTTCTTTTTTACCTTGAGTGGGCTTTGTGCTGTTTAATTTTCATTGA
ATTTAGGTTTTGCTGAATTTCAGCATTTTAGAGTTGTTTGCTGTTTGGGGTTGTGTTTGGTTGAATTGGAAAGTGAATGTATCCTTCTGCAATGGATTAT
GCACGGGATGGTGGCACGGCTTTGATTCCTACCCGCTTTGTTTGGCCTTATGGAGGAAGAAGTGTATATCTGAGTGGCACGTTTACTGGGTGGTCTCAAT
GGCCGATGGCTCCTGTTGAAGGATGTCCAACTGTGTTTCAGACTGTTTGCAGTGTTCCACCTGGTTACCACCAGTACAAGTTCATTGTTGATGGTGAATG
GCGACACGATGAGAACCAACCTTTTGTAAGTGGAAGCCTTGGAACAGTCAATACTGTCCTCTTGGCCAGAGAGTCTGACTACCTTCCAGCAGTACTAAGT
GCACAAATACCTCCTAGCTCTAACATGGATGTGGATAATCAGGCCTTTCAGCGTTTGGTAAGAGTGTCGGATGTTGCCTTGCCAGATGATGCTTCCAAGA
TATCGCAGTCAGATTTGGATATTTCCCGCCACCGCATATCTGCAGTCCTATCAACACATTCAGCTTATGAGTTGCTTCCAGGGTCGACCAAGGTCATTGC
TTTGGATGTTGACTTACCCGTAAAGCAAGCATTTCATATTCTTCATGAGCAGGGTATTCCTATGGCTCCTTTATGGGATTTCAGCAGGGCACAATTTGTT
GGAGTCCTTAGTGCTTTGGATTTTATTTTAATCATGAGAGAGCTTGGGAATCATGGTTCCAATCTGACTGAGGAAGAGCTTGAGACACATACTATATCTG
CATGGAAAGAGGCAAAATCTTACTTGAGCAGACAAGCCAATGAGCTTGGTAAATCAGCTCCACGGCAACTTGTTTGGTCAGGGCCAGATAACAGCTTGAA
GGATGTGGCATTGGAAATTTTGCAAAATGGGGTCGCTACAGTACCTATAATTCATTCACCAGCTCTGGATGGATCATATCCCCAGCTATTATATCTTGCT
TCTCTTTCTGAAATACTAAAACATATTTGCAGGTATTTCAAGCATTCTCCAGAGTCTTTACCAATACTTCAGTTGCCAATTGGTGCAATTCCTTTGGGCA
CATGGGTTCCGAAAATTGGAGAGCCAAATCGACAACCCCTGGCAATGCTGAGGCCTACTGCTTCTCTGAATGCAGCATTGAATTTGTTAGTGCAAGCTCA
AGTTAGTGCAATTCCCATTGTTGACGATAACGACTCCTTGTTGGATATATACTCCCGAAGTGATATTACAGCTTTGGCCAAGGACAAGATCTACACGCAC
ATCAATCTTGAGGAAATGAGTATTCATCAGGCATTGCAACTTGCAGAAGAACCATATGCAACTTATGGGTTGAGCAGTCAAAAATGTCACATGTGTTTAC
GGTCTGATTCATTGCATGAAGTGATGGAAAGATTGTCCAGACCTGGGGTTAGGCGGGTTGTTGTTGTGGAAGCGGGAAGCAAACGTGTAGAAGGTATCAT
ATCAGTGGGTGACATTTTCAAGTTCTTGCTTGGGTAGATGAATCAAAGAATTGACAATAGACGTGATTTTGATGGTGGTTGCCTAATCTGTGTTTGCTCA
TAGCTCATGGTGCACCCCATTATTCATGGGGATTTGAAACCCGATTCTTTCGTGTATACAATTGATTGGCCCCAAGTATAATGGCCTGGTCTTTTAGGAT
GTTAGGCTCTAAAGAATTGAGGCATGTAAATTTTCATAATTGTTTCCCTCCTTTTTATTACAGTTACTAAAGGATTAAAGATCAGTTGTCTATCTTTTCC
TTAATAAGTATGATTAGTCAGGTT