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Detailed information on CNT0021643


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q70Y15|RR16_AMBTC, E-value = 4e-43

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

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Expression of CNT0021643

ERR364329: 166.932 RPKM

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MMNIKMKRSDKNIKIQADSQTVIHVKIDRPIIRILELN*

>peptide 2 (41 aa)
MNREIEKRRMVKKQLNKARYWSLFYEFHLINSKLFKYLRLL*

>peptide 3 (34 aa)
MKICRVIHGCDMLFFPFIPFQDQSWSYKPYQWYG*

>peptide 4 (49 aa)
CYSYKRWCISNPLFWQPNRSSDFGMNILYQYTVSYTHLSLLQQLMENSE*

>peptide 5 (34 aa)
MRHALFSIHSLSGSVVVLQTLPMVWMNPLLHPNV*

>peptide 6 (42 aa)
MDATCSFFHSFPFRISRGLTNPTNGMDESVASSKCVKDHSRT*

Sequence

>CNT0021643
ATGCTATAGTTACAAGAGATGGTGTATTAGCAATCCTTTATTTTGGCAACCTAATCGCTCTTCTGATTTTGGAATGAATATTCTTTATCAGTACACTGTT
TCTTATACACATTTGTCTCTACTCCAGCAGCTTATGGAAAATAGTGAATAGTTAGGATTCGTTTTTGAAAAAAAAAAGAATTGACGATCCACTCACAGGA
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TTCTATTACTTAATAGACCTTTTCTATTTATTTAATTGATAATTGAATATTTTCATTCTTTTATTTTAATTCTTTTAATTTATATACCTTTAAACCCCGA
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ATTCTATAGAAAAATAGAATTCTATAGAAAAATACAAATTTCTTACAAAATCCAAAACATACAAAACAAATATTTACAAATACAAATACTGTACAAATAT
TCAAATTCATATTTCATATTCATTAATAAGAAATTAATAATAAATAAGAATTTACTGAACATTCATAATAAATGTACTGAATATTTTCATTAACAATTAA
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GAAAAAACAATTGAACAAAGCTAGATACTGGTCACTCTTTTATGAATTTCATTTGATTAACTCCAAGTTATTTAAATACCTCCGCCTTCTTTGAAATATC
ATGAACAGTTACTGTAGGCTGAGCTCCTTTTTCAAGGAAATATAGAATAGCAGGAACGTTTGAATAAGTTTGATTCTTTATTGGATCGTAAAAACCCACT
TTCCGAAGAGCTCTTCCGTCTCTTCGGGATCTAACATCAATTGCAACGATTCGATAAATGACTCGTTGCTTTCTACCACATCGTTTCAAACGAAGTTTTA
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GTACATAGTACATAGTTTTTATTACACCCACCTAATTTATCCATAGACATGGATAGGTACCTATCTGGAAGTATCAGCAAGGATCCAATTTGACCCGATT
CTATCGTATGAAGGAAATCTATTCTATAAAATAAAAAAAAAAAAGAAATCAAAGACATTTATGATATGAGATAAACAAGTTGCTTAACACTTATTTTTTA
CCAGATTCCGTTCGGGACAATCAGTCATGAAGGGTTCGATTCTTTCTAGAACGACGAACGATTGAATTGGATTCCCAATACCGGAACAGAAGGAGTCATT
AACTGAATAAGCTAAGCTATTCCAGTTATCCGGAAGGAAAGAAAGGCT