Detailed information on CNT0028154


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
:
CNT0006229, E-value = 5e-10 (V. vinifera)
CNT0042615, E-value = 5e-10 (A. thaliana)
CNT0034911, E-value = 5e-10 (P. patens)
CNT0019015, E-value = 1e-10 (Z. mays)
CNT0002871, E-value = 5e-10 (G. max)
CNT0024167, E-value = 1e-10 (A. trichopoda)
CNT0008755, E-value = 3e-11 (S. tuberosum)
CNT0038248, E-value = 5e-10 (S. moellendorffii)

Expression of CNT0028154

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (63 aa)
MYYAYDTFWRSNFVVRLNLNIFMLGHRVRAKVLHYNDAYLFAVLAVIKKSEEHCGVISYITEN*

>peptide 2 (31 aa)
MLQIIKLSNNCLFIVSKSCIPYKLLHLYDHL*

>peptide 3 (59 aa)
MVFCHICIFFVFIKKTYFVKFWYATYWFYFCVYNEGAAINLVLIHLLLVHLVVTSECIV*

>peptide 4 (100 aa)
KQLLRLLLYHTVTVRVLPRAEREREREREREGGGEWMRLVFMATSSNRRRRAAWPRRRRRILRRKVPLTLPSPAEQHCSQGVAICFVREARIALPGWSDR
*

>peptide 5 (98 aa)
TTTPSSSVPHGHSACAPQSGERERERERERGRRGMDAPSVHGDEQQSAATRCVAATPSTYSPAEGAPDLALSGRTALQPGSCDLFCQGGKDSSSRVVG*

>peptide 6 (57 aa)
MLGEFFHVVNMPIHSNPTDIPYNIEFNLKNYIAHTIYIQLPLRFFLFSSLSQISTEI*

>peptide 7 (38 aa)
NNYSVFFCTTRSQCVCSPERREREREREREREEGNGCA*

>peptide 8 (40 aa)
MKSRLPFCFCFCVSFCLCYIFIILVHINHFIAYLGHSLTT*

>peptide 9 (29 aa)
MPLFSCHKNLSIITSMFLSETVLYRIILIR

Sequence

>CNT0028154
AAACAACTACTCCGTCTTCTTCTGTACCACACGGTCACAGTGCGTGTGCTCCCCAGAGCGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGAG
GGGAATGGATGCGCCTAGTGTTCATGGCGACGAGCAGCAATCGGCGGCGACGCGCTGCGTGGCCGCGACGCCGTCGACGTATTCTCCGGCGGAAGGTGCC
CCTGACCTTGCCCTCTCCGGCAGAACAGCACTGCAGCCAGGGAGTTGCGATCTGTTTTGTCAGGGAGGCAAGGATAGCTCTTCCAGGGTGGTCGGATAGG
TAGTCTCGGCAGTTCTGACGGCTTCTACGGAGGCCTTTGTGAGGGGCGGCGAAGCAGCCCCTAGACTTCTTATTCCGGCTGGTGAGTGGCCAAGATTTGT
CTATTGGATCTCAGCTAGTCCACACAGTGAGCTGATGTTGTTGTTCTGATTTTGTTGCACATATGTTTACACGTGATTCGGTGGTGGAATATGTACATGT
GTTTCTTTAGCCTGTTTGTTCCCATCTAGGCATGCTATAATATATTATCAAGAGTAAATTACACCCACGGTACAACTACTTGCTAGGTGGGTGCGATATA
GTGCAAGAACTTGAGAATTGAACGTTCGAGTGTAACAACTTGACAAGTGGGTGCGTTCTAGTACAAGTACTTGACAATTTAGAATTTTGGTGAATCAATT
TGGCTAAGCATATGCTAGGTGAGTTTTTTCACGTTGTCAATATGCCAATACACAGTAATCCTACAGATATACCTTATAATATTGAATTTAATCTTAAGAA
TTATATTGCACATACAATTTACATCCAATTACCTTTAAGATTTTTTTTGTTTTCTTCACTTTCTCAAATATCAACCGAAATATAATAATTTCTACATCAA
GTTTAATTGACTTTCAGTCTTTGGTTATTAGGATATAAATATAAATATGTTTATACATATCCACACTAGTATATTATAAAAATAAGTACTTAAAAATTTG
AATTTATATAAAAAATGCTCCAAATAATTAAGTTGTCAAATAACTGCTTATTTATTGTATCAAAATCGTGCATACCTTATAAGTTGCTACATTTATACGA
TCACTTATAAAGTTCTTATACTAAATTGCACCTTCCTGCCAAGTTGTTGTCCTAGAACACTCAATTTGCAAGTTATTGCACCAAATTGCACCCACTTGTC
AAGTTGTTGCACCATGGGTGCAATTTACTCTATTATCAACTATAGAGATTTAAGTTTCTTTTTTTTTTGAAAAGCAGTGTTTATGTGATTAGTTAACATG
AGAAAGGATCTGTTAGAAACTAGAAGAAAAGAAACTAGAAGAAAAGAAGTATGACAGAAGAATGAATTATAGGAGCTCGAGAAAACATAGCAACAGTCCC
GAACCACATTTTCATTGATCTCATAGTTGGTTGTTCATGGGTTAAATTCTTTATCCATCGATCTACGATTGCATATTGCTCAGCTTTGTGGATATCATTG
TTCCTGTAGATGTTTTATGTACTATGCGTATGATACATTTTGGCGCTCAAATTTTGTAGTAAGACTGAATTTGAACATTTTCATGTTGGGGCATAGGGTC
AGGGCGAAGGTTTTGCATTATAATGATGCATATTTGTTTGCTGTGTTAGCTGTCATTAAAAAAAGTGAAGAGCATTGTGGAGTCATTTCATATATAACTG
AAAATTGAAAGCTTAGGTGCTAAGAATGGTGGCAGACGTATTATCATTTTGCTTGCTGGTACCTAGTTTTGACGCTTGACGACAAGCTTACAAATTCTGT
GCCTTTTTTAATTTTAGCTTTTATGCAGTTGGTGATAGCTTGCAGTAGGTGATTTTTGAACTTCTCAAAATAAGTGTTTTTGTCATATTTGTATTTTGTT
TTTGTCACTTTTTTGAACTTATAAACTAAATGGTTTTTTGTCATATTTGTATTTTTTTTGTTTTTATCAAAAAAACATATTTTGTCAAGTTCTGGTATGC
AACGTACTGGTTTTATTTTTGTGTGTACAATGAAGGTGCTGCTATAAACTTGGTGCTGATCCATCTTCTGTTAGTTCATTTAGTGGTCACCTCTGAATGC
ATAGTTTAGTGTCTATGAAAGAAAGGAAGTTTTGGATATGAGACCGCTTTTAAAATTTTAGTTTTCTGAAACCATAGAGGGGTGATATCCAAATTTGAAT
ATATCCATTATACATGTAGGATTAGTCAAGTTTTTTGAGTTGCAAGGTTATTTTTGCTAATGAAATCACGTCTTCCTTTTTGTTTTTGTTTTTGTGTTTC
TTTTTGTCTTTGTTATATTTTTATAATTTTGGTACATATTAATCATTTTATCGCTTATTTAGGTCATAGCCTAACCACTTAAAATCGTTCTTAATGCCGC
TATTTTCTTGCCATAAAAATCTCTCAATTATAACGTCCATGTTTTTGTCAGAAACAGTCTTATATCGAATAATACTTATAAGA