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Detailed information on CNT0035597


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P05724|YCX3_CHLRE, E-value = 9e-63

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0003759, E-value = 8e-09 (V. vinifera)
CNT0001940, E-value = 2e-06 (G. max)
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Expression of CNT0035597

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (117 aa)
MYWSLTACSAVLFCLRDSLIFLADDVNPERGNEGVAVGTGGIPGRGIPPLITANGIGLYTFTSIGLLVPFTLGLKTQNQQIKIVVKSKISETNKLVIFCC
LKHIISRKARSWLNDSR*

>peptide 2 (32 aa)
EGDVPKGKGKEVDRGFFWFSVSTGSIELSVMS*

Sequence

>CNT0035597
GAAGGGGACGTCCCGAAGGGGAAGGGGAAGGAGGTTGATAGAGGGTTTTTTTGGTTTAGTGTCTCTACCGGCAGTATAGAATTGTCTGTGATGTCATAAA
TGACAAAATAATAAAGAGCGTTTTTCAGTTTTTGTTTTTTAGTAAACTCGTACCAAAATTGACTTGTTAAACGTTTTTTTGACGTTCGACCTAACAAGGT
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TGAATTAAATTAAATTAATTTAATTTAATTTAAGAGAACCAATTACTGGTATAATTTGGAAAATAAAATACATTTAATCTGGTAATTTATTTGGTAATTT
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TTGTTGCCTGCCAACTGCCGATATTTATATACTAGGACGTCCCCTTCCCCTTACGGGATATTTATATACTCCGAA