Detailed information on CNT0007831


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q41745|LPAT_MAIZE, E-value = 6e-70

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
:
CNT0000721, E-value = 9e-07 (G. max)

Expression of CNT0007831

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (59 aa)
TFLVGCFCRRNSLHTYKAFSSSRICCFCRKTYPKECFDSSNQGFCCISKPFAFHYSGNL*

>peptide 2 (216 aa)
QPFWLAVFVEGTRFTHTKLLAAQEYAVSVGKPIPRNVLIPRTKGFVASVSHLRSIIPAIYDITLAIPKDKPRPTLLRMLRGCSSVVHVRVERRLMQELPE
DESGIAQWCRDVFVVKDALLDRHLATGTFGDQECQDIGRPKKSLMVVICWSCFLFFSAIKFFEWCPFSWGGVVFCAVFLVLVLVLMQILIVSSKSEKSTA
PKVPPPNTLKENLLPA*

>peptide 3 (38 aa)
MVSILLGRSCILCSFLGLGSSLDADSHCLFQVRKIYCS*

>peptide 4 (29 aa)
MSRYWKTKKILNGCYLLVMFPFLQCYKVF*

Sequence

>CNT0007831
CAACCTTTTTGGTTGGCTGTTTTTGTAGAAGGAACTCGCTTCACACATACAAAGCTTTTAGCAGCTCAAGAATATGCTGTTTCTGTAGGAAAACCTATCC
CAAGGAATGTTTTGATTCCTCGAACCAAGGGTTTTGTTGCATCAGTAAGCCATTTGCGTTCCATTATTCCGGCAATTTATGATATAACACTTGCAATTCC
TAAAGATAAGCCTCGACCGACATTGCTAAGAATGCTTAGGGGATGTTCTTCTGTGGTCCATGTGCGTGTTGAGCGCCGTTTGATGCAGGAATTACCAGAA
GATGAGAGTGGTATTGCACAATGGTGCAGAGATGTTTTTGTTGTAAAGGATGCTTTATTGGACCGGCATCTTGCTACGGGTACATTTGGTGACCAAGAAT
GTCAAGATATTGGAAGACCAAAAAAATCCTTAATGGTTGTTATCTGTTGGTCATGTTTCCTTTTCTTCAGTGCTATAAAGTTTTTTGAATGGTGTCCATT
CTCTTGGGGAGGAGTTGTATTTTGTGCAGTTTTCTTGGTCTTGGTTCTAGTCTTGATGCAGATTCTCATTGTCTCTTCCAAGTCAGAAAAATCTACTGCT
CCTAAAGTACCTCCTCCAAATACATTGAAAGAAAACCTACTTCCTGCATGATGATATAATGCAGATTAAGATGGTTTATATAGGGGTAAGTTGAGCATCT
AAATTAGAGGAGAAGACTAAGAAGGGCTGGTTTTTACAAGAAATGTTTGAAGATCAAGATTCATTCATGATACTTTGGTGGCTCTAGCTTTCTCATTTTT
TGTCTTTTGGCTTGTTATTCATGATTGGTCTCTTATGAAACTATCAGCAATATGTTTAGGTAAACTTTAGTATATAAATTATCCAAATGTATTCTTTATT
TTTGTTCCATTGTATGTAAAAAGTTGCTATGTTTTATTTCAAAGTAAGAGGATAGGGTTGTAATAGTCAATTCGTAAGGTTAGCATTTGGAGGGAAAGTT
AGTTATGATTCAATTAGCTTGACTAACAACCATTCCAGTGTACTTACTGTAAGGGATCCTTGTAATTGGTTAATGTTGATATGAAATAAATAATGTATGC
ATTAGCTTTATGTATCAGCAGTACCTTGCTTGGTACACTTTCAACCTATGCATAACTAATTAATGATACCATGGTATTATTAATGCAAGGACTTTTAAAG
CATGCATTAGCGGTCAA