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Detailed information on CNT0008022


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FLG8|SPNS2_ARATH, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0002309, E-value = 1e-09 (G. max)

Expression of CNT0008022

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (67 aa)
MIQPLNLTRSQTHHQWLFLQNRHDQRFNFINVSSTTFLVHCQKVTSHILYNQLAKLCGSRCYSEQRC*

>peptide 2 (34 aa)
MPLSFFQWQHFLEQYFALLPFVLRACMPSSLYLQ*

>peptide 3 (503 aa)
MIRDSISSTLAPQPSWFTAKRLLAIFCIINLLNYVDRGAIASNGVNGKRSECTKSGTCSSGSGIQGDFDLNNFQDGVISSAFMVGLLLASPIFASLAKSV
NPFRLIGVGLTVWTFATAGCGLSINFWSITICRMMVGVGEASFISLAAPFIDDNAPVDQKTAWLGIFYMCIPTGIAVGYVYGGLVGSLLNWRWAFGIEAL
LMLPFAILGFVMKPLQLKGFSHTGSKRPSTSVQTSCTEAVTSPCQDGSSQTRNDSMDGSKSAPGILNQFTRFWMDMKVLLLDKVYVVNILGYIAYNFVIG
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CLHCVKPSMRPLSMAMSTVSIHIFGDVPSSPLVGVLQDHISNWRVTALILTSVLFLASGIWFIGIFLHSVDRFNEENDLQVSVTDRSNTIPLLGETTQSL
INL*

>peptide 4 (45 aa)
MTMPQLIRKQHGWEYFTCVYQLGLLLVMYMVDWLEVFLIGVGRSG*

Sequence

>CNT0008022
CAAAATTGTGGACTATTAGTGCTTCTTGTATAAGAAGCAGGATCATTTTGAGCCAAAGTTCAAAATAATGCCTTTTCCTCGAAAGAGTCAATTCCAAAGC
ATTTAGATGATCCAACCACTAAATTTGACTCGAAGCCAAACCCATCATCAGTGGCTGTTCCTGCAAAACAGACATGATCAGAGATTCAATTTCATCAACG
TTAGCTCCACAACCTTCCTGGTTCACTGCCAAAAGGTTACTAGCCATATTCTGTATAATCAACTTGCTAAATTATGTGGATCGCGGTGCTATAGCGAGCA
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TGTCATATCATCTGCTTTCATGGTTGGGCTTCTTTTGGCATCTCCAATATTTGCTTCCTTAGCCAAGAGTGTTAATCCATTTAGACTTATTGGAGTTGGA
CTGACAGTCTGGACCTTTGCTACTGCTGGTTGCGGCCTGTCAATTAATTTCTGGTCCATTACCATCTGCAGAATGATGGTGGGTGTTGGTGAGGCATCTT
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GAAGGTGCTTTTGCTTGACAAGGTCTACGTCGTGAATATCCTAGGATACATAGCATATAATTTTGTAATAGGTGCATACTCGTATTGGGGACCAAAGGCT
GGTTATTACATATACCACATGAACAATGCAGATCTGATGTTTGGAGGTGTTACTATCATATGTGGAATATTTGGAACCTTAGCAGGAGGTTTTATTCTGG
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AGACCATTGTCTATGGCTATGTCCACTGTTTCGATTCACATATTTGGTGATGTGCCTTCCTCTCCTCTTGTGGGGGTTCTCCAGGATCACATTAGTAATT
GGAGAGTTACTGCTCTAATCCTCACATCGGTTCTGTTTCTGGCGTCTGGAATATGGTTTATAGGGATCTTTCTTCATAGTGTTGATAGATTTAATGAAGA
AAATGACCTTCAAGTTAGTGTTACTGACAGATCAAACACAATTCCACTACTTGGGGAGACAACTCAGTCTTTGATAAATCTTTGATTTTCTCTTTTATCA
TTTTCTTTTGGGACTTGCAAAATTGCTATGTAATTTCTTTGATACTTATCTATCTTGTGTTTAGATTCTGTTTATGCATCAAGGGAAGCTTGTTGTCTCT
CTCTAGTGCAGTTAAACCAAACCTGGTGGCGAAAAGGACCACAATTTGGCTCAAATCTTTTCTACTTTGTTGAAGAAAAAAAAAT