Detailed information on CNT0000139 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q869L3|MDN1_DICDI, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

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:
CNT0005163, E-value = 8e-84 (V. vinifera)
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CNT0024955, E-value = 6e-17 (O. sativa)

Expression of CNT0000139

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (58 aa)
MLFWTTELRCLYQSWVILINAHHHLEFLLVRIHHIKVVAEKAFQSHFLIDLPRCMLTS*

>peptide 2 (47 aa)
MTTESFMFLNCKKELKQIQTLCFLPLKIHLHFMEAAKCCPGHFVIVL*

>peptide 3 (48 aa)
NNSRELSRRRRLRLASEDHHTHTTHSVANGGVDLNCDEHSIKTITFSN*

>peptide 4 (31 aa)
MGCLDTSRHIQQTSINLGGSFSFLGTFHIYC*

>peptide 5 (50 aa)
MCQLVIEWLLSCFWIILRSQLWISRKRLLRVDRRKFSSTWIPFHFPTTLF*

>peptide 6 (86 aa)
MHLNIRKKELMYLVMFQKITMRCRVRWKMKMLMSMAMFLNLKREQLRLWDLQHLSKLIETLIVISLIKNVLLEKMQNCSLRRKNLK*

>peptide 7 (67 aa)
MIEVGTMMRMLNSKMLGGFLFYRVFRLLNWLIQWLEPTLMLKIKVQSLMSTLLILNSHIGFTCFCSF*

>peptide 8 (5411 aa)
MAIDGSFSLHSSLRRFLDRCPKLQCFPPLESLERMGDLVTEEEVVNVLVGVFLHPSYTIPLMGCFRPIARHIVDKAVALLRLVPNLRSIPDDTAAEDDRD
RVLDGVVNVIEFYSWGQGRGLDLHELACLAFCRALDMGPFLLSSVLSYFNFAPSPFARFSVKQVTVETRELHVAQISYRLLLMEPEIFSKLWDWSCFLDL
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LGTGLSKRDAAELRERCLSILLQKLGVDESNSELSRIGNYGWGEFGTDMDVSHSDDLFGIDPFYINKGIGICEDGGFEFKAPTTCRNALRVLRAMQLPKP
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AARCVERQWLCILTGPSCSGKTSLIRLLANLTGNVLNEVNLSSATDISELLGSFEQYDALRNFSKVVAQFECYVNEYISLQLETSNEAIFRETDFYIRWM
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TYAKNKGSELNEHITYLELSHWVHLFLQLLKNGCCPIWSLKISWEHIYLSSLGVEGEKIIDFAKTKYLSATNLAGYDDLTACPLALPGGWPLPLSVRDYV
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QLTAATAFDKQLKCFRECVSTLGKLFSLSSSTDNNINHMCSIIPKQFASYKCLWQQKQLFDTLCSTSQEELLLLRILENSHLNTCHRARPLARQMIASIE
EFLPLFCKSKESLDCYLIGRTKAVTAVTYSSHLCIVTQEIEQLVSENFKTIRDFKDRFLELQEHDLDRSTARKVLIQHFQEIADKAKLVEEEFTMAIKGN
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NRDEETCSPDEVMEEANTEVDVNSGKDDQENADLNSTEPKKDVSRLSELNNEQVSPAELASQSKVDWQTSGSENVAAESNVSNSHHDFDSTLLGGLPSSS
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KARLPSGHNPLQQLVLIIADGRFVEKKKLKQCVRDVSTGNRMVAFLLLDNSQESIMDLKEASVEGGQTKIFKYMDSFPFPYYIVLRNIEALPRTLANLLR
QWMELMQHSTG*

>peptide 9 (40 aa)
MKISCWEHGNSKMKSKMTLMKCQAVIIQGLRWNRILRLMQ*

>peptide 10 (75 aa)
MQIYVTPRFLIGLTHWWNLVDQSRSMSVESLMETHWLFIHTLISAYSSQLIPTMVKFLEQCVIGELKYLCCSRIG*

>peptide 11 (32 aa)
MVRRSYLQHYAIALQRYGFPLLMIYMSFGTLL*

>peptide 12 (40 aa)
MNIFSPIFYVYKTIQLLSVSSLFHSSYFHFFSFISSKHNV*

>peptide 13 (35 aa)
MPGSMKPLCLLVSILQLYCRIYVCQAIFLWLTSPW*

>peptide 14 (32 aa)
KQQQRAFSETETETRLGRPSHTHHSLSCERWS*

>peptide 15 (56 aa)
MCIQSVGLCFEIFIEFLIKASTNVFATPKDIVDPECMGISGFSKFENCKLYSGDVV*

>peptide 16 (49 aa)
MTPCVIFPKLLLNLSAMLMSTSVCNWRLQMKQFSGKQIFISDGWLSFLG*

>peptide 17 (34 aa)
MFWSALLALSSIMNLSSWLEKPVLGRLQLFKIWL*

>peptide 18 (61 aa)
MKVIQSFQELEIMVGVNLAPIWMCHIVMIYLALIHSISIKVLAFVRMVGLNSRRLLLAGML*

>peptide 19 (60 aa)
MMILMVKMRNLSLKWDLLDQTVKQWVRKFVMRMKMKPPMIQEKSMNLDLRSRTEMEGIES*

>peptide 20 (47 aa)
MYITLKKLLSNRTVCIWNSWELRLRLINIELLVRGTQQLVCRLPVIM*

>peptide 21 (36 aa)
MLSLCMCPFMASFCLSLPRHFLKRIMMALLLECKII*

>peptide 22 (38 aa)
MYTKQSNFYLFHLSFTPHTFISFHSSLPNTMYKTILDT*

>peptide 23 (79 aa)
MLSRSFGCNVSSLELPRSICGIVLIMEHICLIFFYLLLAVFSSRLFMHIENLLRRINLLESNIFFFLRRMYLRKKALIC*

>peptide 24 (31 aa)
MVPLVLENLLSLPSWLRIVETKFYLSRWMIK*

>peptide 25 (32 aa)
MVAYQKINVFVCIKRLLTYLHPFHLQLKTVCQ*

>peptide 26 (44 aa)
MIHIVCQRMAVVTLLLRHWLQYVVLFRNWKWAAWLLLVLERRET*

>peptide 27 (29 aa)
MKNRSSWKSLSHSSAMWFSFTIGYLDLVI*

>peptide 28 (65 aa)
MCLIVIMTLTLLCWEACLLAVCLIWMLRCPTHQIVGDLEKINPNLIIHGPIIHLFRRSILILVEV*

Sequence

>CNT0000139
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GAAGTGAAAGCAAAAACTAGCTCTCTTAGGTCGATAGTATTTTTTTCCTTCAATATATTTTGCTTTTTATATATACAATACTCTTTCACTGTTCAGCTTA
TAGACAAGAAGTGTTTCAGCTTCAAATGGCGATTGACGGTAGTTTCAGCCTTCATTCTTCGCTTCGGAGGTTCCTCGATCGTTGCCCGAAGCTCCAGTGT
TTTCCGCCGCTTGAATCGCTCGAACGAATGGGAGACTTGGTGACAGAAGAGGAAGTTGTTAATGTGTTAGTAGGGGTGTTTCTGCACCCCAGTTATACAA
TTCCGTTGATGGGGTGTTTCCGACCTATTGCTCGACATATTGTAGATAAAGCTGTTGCTTTGCTTCGTCTTGTGCCAAATTTGAGGTCTATTCCTGATGA
TACTGCTGCTGAAGATGATCGTGACAGAGTTTTGGATGGAGTTGTGAATGTCATAGAGTTTTATAGTTGGGGGCAGGGAAGGGGTCTGGATCTTCATGAG
CTTGCTTGCCTAGCCTTCTGTCGGGCTCTTGACATGGGTCCTTTTCTGCTGAGTTCTGTATTAAGCTATTTCAATTTTGCTCCTTCTCCATTTGCAAGGT
TTTCAGTGAAACAAGTTACGGTCGAGACCCGTGAACTTCATGTTGCCCAAATATCATACCGCCTCCTTCTAATGGAACCTGAAATTTTCTCAAAGCTCTG
GGACTGGTCTTGTTTTTTAGATCTTGTAAAAGACCCACACAAACCAGATCTTACATGGTGTGTGGTGCAGACATTAAGAGTTCTGCTCAAATTAGGTTAT
AAAGCCACTGAAAACTTGAATATTGGAGCCGAGGAGGCATTTTCTTGTCTATTGCGTTGGGAAGAGTTCTGTCAGGACACGTCACTTGAGAAAGCTGGTT
GGTATGTTGATCCAAATCCAGTAGCAGACTATGTGTCTGGTTCTCCAGATAGAAGAATGGATTTCAAGAATGAGAACTGTTTAAAATCATTTGGCTTGAA
TAATCAGCCTGTTAGTTCACCAAAGCTGCATGAGTTGCAACCACATTTTAAGAGTCAACGGCTTACAACTAGGGATGATGTATCAGTAAGTAATACATTC
GTATTTACCTCAGCTGTGAAAAGAAGTTATGATAGAGTTCTTTTGGCAGTGAGTCAAAAGTGGCCTGTTCTTTTATATGGTCCCTCTGGTTCTGGAAAAT
CTGCTCTCATTGCCAAGCTGGCTCAGGATTGTGGAAACCAAGTTCTATCTATCCAGATGGATGATCAAATAGATGGTAGAACATTAGTTGGGGCTTATGT
CAGTGCAGATAGGCCTGGGGAGTTTAGATGGCAACCTGGGTCACTTACCCAGGCTGTGCAGAATGGTTTGTGGATAGTTTTTGAGGATATCAACAAAGCA
CCATCTGATTTACACTCCATATTAATGCCTTTATTGGAAGGGGCTGTTTCATTTGCAACAGGACATGGGGAGGTAGTAAGGGTGGCTGAAAGTTTTAGAA
TGTTTTCAACTATTGCTGTTTCTAAGTTTGACACATCTGAGAGTGCAGGTCAAAATTCACATAGTGTCCTTTGGAGAAGAGTGATGATTCCGCCACTGAA
TAATAAAGACTTGCAAGAGATAATCAAAGTGAGGCATCCGGATTTGGAGCTTCATGTTGGCAAACTAATAGAAACCTTTGAAAGGGTTAACTCTATTTCC
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CAGGTTTAGGTTTTTGCTTTGATGGTAGCTTATCAGAAAATCAATGTTTTTGTGTGTATAAAGAGGCTGTTGACGTATTTGCATCCTTTTCATCTTCAAT
TAAAAACCGTTTGTCAGTAATGAAAGAGATAGCAGGGTTGTGGAAAGTACCAGTTTCTGCAGCTGAGACCTTGTATCCCTGTGACAAACCTATAATTCAG
GATTCTTTTACAGATTTAAGAATAGGCCGAGTTTCCCTCCAGTACTCTAAACCACATTTGCAACAACATAAAAGACCTTTTGTCGAGATCCGCAGTTCTA
TGCATGTTTTGGAGCGCATTGCTTGCTCTGTCAAGTATAATGAACCTGTCCTCTTGGTTGGAGAAACCGGTACTGGGAAGACTACAATTGTTCAAAATTT
GGCTTTAAGGCTTGATCAAAAGCTTACTGTTTTGAACCTGAGTCAGCAAAGTGATGTTGCTGACTTACTAGGGGGTTTTAAGCCTATGGATGCTCAGTCT
GTGTATGTGTCCCTTTATGGCGAGTTTCTGTCTCTCTTTACCAAGACATTTCCTAAAGAGAATAATGATGGCTTTATTACTAGAATGCAAAATTATTTAG
AAGATCATCGACAAAAGTTTTTAATTGATAAGAATGGGGAAGCTCTGCTGAAAAGATTGCAAATAGCAGTTGGGAAGTCAGTTAAGCTTATACAACCTGG
ATCTTCCAAAAAGCGTAAAAGGCCATTAGAAGAAAAATTAATCCAAGAGTGGGAGAGATTTTGTATTAAATTGCATAGTGTCTGTCAAAGTAATCGTTCT
TCAGCGATGATGTTTTCTTTTGTAGAAGGAAGTTTTGTGACCGCTCTTAGAAATGGTGACTGGGTTTTGCTTGATGAGGTGAATTTGGCTCCTCCGGAAA
CCTTGCAAAGAATTATTGGTGTTCTAGAAGGGGAACATGGTGTGCTGTGTTTAGCTGAAAGAGGTGATATGGATTATATACATCGTCATCCAAAATTCCG
TATATTTGCTTGCATGAATCCAGCAACAGATGCAGGGAAGAGGGATTTGCCCTTTTCTTTGAGGAGTAGATTTACTGAGTATTTTGTTGATGATGTTTTG
GATGATGACGATTTAAGTCTGTTTATTAGTCAGTTCATTAGTAGTGCCTATATGGATCAGCAGTTGGTGAATAAAATTGTGTGTTTCTATAAAGAAGCGA
AAAAGGAATCTGAAGAGAGATTGCAGGATGGTACTAACCAGAAGCCTCAATACAGTTTAAGGTCCCTTTATCGTGCTCTGGAGTATACACGGAAGGCAGA
GAGAAAATTTAAAATTCAGAAGGCATTATATGATGGGTTTAGTATGTTTTTTGTTTCATTGTTGGATGGATCCAGTGCTGAAATAATGAGGCAAAAAATA
TCATCTCTTTTGTTAGAAGGGAAGATGCCTCCACATGTACATTTTTCCCACTATTTAGATACCTCCAAATCTAATGGATATTCCGGGAATTATGTTCAAA
CTAAGTCTGTGCAGGAGCATCTTGGCAATTTGGCACGAGCTGTTCTAATGAGATATCCTGTCCTCTTACAGGGACCCACGTCTAGTGGAAAAACTAGCCT
TGTTCGATATCTTGCTGCAATAACTGGTCATGATTTTGTAAGAATAAATAATCATGAATACACTGACTTGCAAGAGTATCTAGGTTCTTATATAACTGAC
ACTAGTGGAAAGCTTGTTTTTAATGAAGGCGTTTTAGTTAAAGCTGTAAGAAATGGTTATTGGATTGTACTGGACGAGCTTAATTTGGCTCCATCTGATG
TGCTGGAGGCGTTGAACCGATTACTTGATGACAACAGAGAGCTTTATGTTCCTGAACTGCAAGAAAGAATTAAAGCAGATCCAAACTTTATGCTTTTTGC
CACTCAAAATCCACCTACACTTTATGGAGGCCGCAAAATGTTGTCCCGGGCATTTCGTAATCGTTTTGTAGAGATTCATGTTGGTGAAATTCCAGATGGT
GAGCTCAGCACAATATTGTCTGAGAGATGTCAAATCTACATAGGTCATGCCGAGAAAATGGTTGAAGTGATGAAGGATCTTCGGTTGCACAGACAGAGTA
GCAGAGTCTTTGCTGGTAAACATGGATTTATGACACCTCGAGACTTGTTTCGCTGGGCTGATCGTTTTCAGAGATTTGGTAACTCTTATGAAGATTTGGC
CAAAGATGGCTATTATCTTTTGGCAGAAAGGCTACGGAATGAGGATGAAAAGTCCGTTGTTCAAAAAGTTCTGAAGAAGCATCTTGGGGTTACACTAAAC
AAAAAAAATTTACATGATCAGATATCATTTAGAGGTCACTCTTCTTGCAATTTCAATGTTGGTTTAGGTGGTTCAGAGAGTCTTGAAAGTGTGCTCTTGA
CCAAAAGTATGCAGAGGTTATATTTCCTTGTGGAACGCTGTTATAATTTACGTGAGCCTGTACTGCTTGTTGGGGAAACAGGTGGAGGGAAGACTACTGT
GTGTCAGTTATTAAGTGCTTGTTTGCAGTTAAAATTACATACTTTGAATTGCCATCAATATACAGAAACATCTGATTTTATTGGGGGATTCCGTCCTATT
CGAGAGCGATCTACACTGATTTCTAATTACAAAGAAATTGTTGAAAAGTTGAAGAAACTAAAGGCTTATACATACTTTTCTAAGGACTTTTCCGTTTCTT
CTGACATAAATCATGCTTCTTCAACTCTTGATCTGCTGAATGGTATGATAAGGAATTGTAAAGAAGGTCAAGTTTTTAGTCCGGATGTCAGTGGAGAAGA
TCTTAATGTTCTTGAGCAAATAAAATTGGACCTCAATGGCTTGCATCAAAAGTGGCAGAGCATATTTGTGTGGCAGGATGGTCCTCTTATAAAAGCAATG
AGAGATGGTGACCTTTTTCTTGTGGATGAAATATCCTTGGCTGATGATAGTGTACTTGAGAGATTGAATAGTGTGTTGGAGCCAGAAAGGATGCTATCTT
TGGCTGAGAAAGGAGGGTCTGATCTGGAGAAGGTTACTGCACATTCAAATTTTTTTGTTATTGCAACAATGAACCCTGGTGGTGATTATGGTAAGAAGGA
GTTATCTCCAGCACTACGCAATCGCTTTACAGAGATATGGGTTTCCCCTGTTAATGATCTACATGAGCTTCGGGACATTGCTCTAAAAAGAATTTCCAAG
TTTAAAGTTGTAGGCAACTCAGGCCCCACGAATGAAGAAAGACTCTCACTTGTTAATGCCATGATAAGTTTTTTTGAGTGGTACAATAAATTGCATCCAG
GGAGAATGCTTACGGTGAGAGATCTCATTTCTTGGGTTGACTTTTTGATTGCAATGGAAGAAAGCTTAGGACCTAAACGTGCACTTCTTCATGGAGTCTT
TCTTGTTTTGCTCGATGGGTTAAATCTAGGGACAGGACTTTCAAAAAGGGATGCTGCTGAGCTAAGGGAGAGATGTTTATCCATCCTTCTACAAAAGCTA
GGGGTTGATGAAAGTAATTCAGAGCTTTCAAGAATTGGAAATTATGGTTGGGGTGAATTTGGCACCGATATGGATGTGTCACATAGTGATGATTTATTTG
GCATTGATCCATTCTATATCAATAAAGGTATTGGCATTTGTGAGGATGGTGGGTTTGAATTCAAGGCGCCTACTACTTGCAGGAATGCTCTGAGAGTTTT
GCGGGCTATGCAGCTTCCAAAACCTGTTTTACTGGAAGGTAGCCCAGGTGTTGGGAAAACTAGTTTAATCATTGCCTTGGGAAAACGTTCTGGGCATAGA
GTCGTACGAATAAATTTTTCTGAGCAGACTGATATGATGGATCTGTTAGGGTCTGATTTACCTGTTGAAAGTGATGAGGGAATGAAGTTTTCTTGGTCTG
ATGGGATACTATTGCAGGCCCTGAAGGAAGGCTGCTGGGTTTTGCTGGATGAGATTAATCTTGCTCCACAATCTGTTTTAGAAGGTTTGAATGCTATTCT
GGACCACAGAGCTGAGGTGTTTATACCAGAGTTGGGTAATACTTATAAATGCCCACCATCATTTAGAGTTTTTGCTTGTCAGAATCCATCACATCAAGGT
GGTGGCCGAAAAGGCCTTCCAAAGTCATTTCTTAATAGATTTACCAAGGTGTATGTTGACGAGTTAGTTGAGGAAGACTACCTATCCATTTGTGAATCAA
AATTTTCGACTATACCTAGAACTTTACTCACAAAGTTACTCTTATTCAATAAAAGGATGCATGAAGACACCACAGTAAATCAAAAGTTTGCCAAAGATGG
CTTCCCATGGGAGTTCAATCTTCGTGATGTATTTCGGTCTTGTGAGATAATTGAAGGTGCACCAAAGTACTCTGGATTATACTCCTTCTTGAACATTGTT
TATATTCAGAGAATGCGTTTGGCAGCTGATCGAAAGGAAGTCTTACGAGTTTTCAAGGAGGTATTTGAGGTGACACCGTTTATAAATCCATATCCTCGCA
TTCAACTCAATTCACACCATTTAATTGTGGGGAATGTTACTATCAAGAGGAATCACGTCCAATTAACTACGTCCTCAAGCAAACAGCTCCTGATGCTTCC
TGAAATCCGTCAAAGTTTGGAATCTGCTGCTCGATGTGTTGAGCGTCAATGGTTATGTATCTTGACTGGGCCATCATGCTCTGGAAAAACTTCATTGATA
AGATTACTTGCTAACCTAACGGGCAATGTGCTAAATGAAGTAAATCTTTCATCTGCAACTGATATATCTGAATTATTAGGATCTTTTGAACAGTATGACG
CCTTGCGTAATTTTTCCAAAGTTGTTGCTCAATTTGAGTGCTATGTTAATGAGTACATCAGTTTGCAACTGGAGACTTCAAATGAAGCAATTTTCAGGGA
AACAGATTTTTATATCAGATGGATGGCTTTCCTTTCTGGGTTGAAATTTGACTGCTTGTCATCTTCAGCTGCAAATTGTTTTGAAAATCTATGTTTTCTC
ATTGGACAACTAAAGTTGCAGATACAAAAGAATTCTGTACCTGTATCTTACTCATTCCATGAACTTGATTTGGCCATGAAGACAGTTTTGAAGATGAAAG
CAGATGTTGTTTCAACCAAATTTGAATGGGTTACAGGATTGTTGATCAAGGCTATTGAGCAAGGGGAATGGATAGTCTTGGAGAATGCAAATCTATGTAA
CCCCACGGTTCTTGATAGGATTAACTCATTGGTGGAACCTTGTGGATCAATCACGGTCAATGAGCGTGGAATCGTTGATGGAAACCCATTGGTTATTCAT
CCACACCCTAATTTCCGCATATTCCTCACAGTTAATCCCCACTATGGTGAAGTTTCTCGAGCAATGCGTAATAGGGGAGTTGAAATATTTATGCTGCAGC
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AACTTTGTCATACTGATAGAACAGATGATCAAGCATCCTATTTGGGAGTATATTTCATGCCGTGACAAACTAGATGCTGATTTGAAGTTAATGCCCTTGC
TGTCACTTGATTTAGTTGATTTGGCTCCATCAAATAGCAAAATTAAGTATCTTTGTAATGCCATTAGTTGCTTTGATCCACTAAGATTAACTTACCAGCA
ACGGAATATTGAGAGCCAGCATAATTTTGATGAAGAAGTCAGTATTGAGAGCCAGCACAGTTTTGGTGAAAAAACCAGTTGCTTCATTCGACTTTTGAAG
TCTCTTTACTTTTTGCAAGATGAAATACTTAACAAATTTGTCATTTCAACTCCAAAGCTAATAGAGGACCAATCATTTGACTATAAACTACAGTTATACT
CTAACCTTATTGAGGACCATGCTTTATTTTGGCATTACTTCATTTCTTCAGAGTTTGATCACATGATGATTTCTTGGCATTGTTTGGTGAAGGATGCTCG
GAAGTTTATAGATATGTGTCCAGAAGCTGTAGATAATTTTTTGATGGAGAGCCAAAAAATTGAGGAGTTTTCTTTTTCAGTAAATTCAGAAAAATCTTTG
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AGACAGGATCCTGTTATCAAGGAATTTTGAGCAGCCATCTTACTGATGTTGTTGCATCATTTGATCATGATCTTCGCTTCCTCGTGACACAAGATGTCTC
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