Detailed information on CNT0000151 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0000151

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MQGIRRMDAALDAMRPLGFRTQLILRTVNELLDVG*

>peptide 2 (52 aa)
MVLGMPRTAITLNKKIYLCWQSHGVWIHWFADSTSIQFTISLSIAGDLNVTT*

>peptide 3 (38 aa)
MSSGKSSVTSFQGSPVPAGLMEGGLIDVQQFSLKALLL*

>peptide 4 (80 aa)
MIVVHALFMMQCSMEIGLSVWIWAKFLVRIACLMSLCLPDYFYTIGWREKKLVNTKGMLRAAGMVSIWLKVFWNITRKGS*

>peptide 5 (49 aa)
PSLLLCFLHVSDFPDSTCSPVLDTCFAFFFSTATRVLLFFQNNNTSSLS*

>peptide 6 (40 aa)
MFKLPIYKIAAKRKCILKFVFHYGTNFTPSSADHFIANVT*

>peptide 7 (56 aa)
MFAKFLFLFCFNVFVSFLTFFPSLMVFYFVCRTRCRVSGAWMLPWTQCVHLDLGHN*

>peptide 8 (74 aa)
PVSCFAFYMCLIFQTPLAHLFWIPVLLFFFQQQHVFCFFSKTTTRLLFLKALKQLLIPSFHTFVHFLPPILLPS*

Sequence

>CNT0000151
TCCCAGTCTCCTGCTTTGCTTTTTACATGTGTCTGATTTTCCAGACTCCACTTGCTCACCTGTTTTGGATACCTGTTTTGCTTTTTTTTTTTCAACAGCA
ACACGTGTTTTGCTTTTTTTCCAAAACAACAACACGTCTTCTCTTTCTTAAAGCACTAAAACAGCTTTTAATTCCTTCATTTCACACTTTCGTGCACTTT
CTCCCCCCTATTTTGTTACCCTCTTGAGTTTCTTCCTCATTCACTGAACTTTTTATGAATATTTTTGCATTTTTATCGTATTATGTTTGCCAAGTTTTTG
TTTTTGTTTTGTTTTAACGTGTTTGTGAGTTTTCTAACATTTTTCCCTTCCTTAATGGTGTTTTATTTTGTCTGCAGAACAAGATGCAGGGTATCAGGCG
CATGGATGCTGCCCTGGACGCAATGCGTCCACTTGGATTTAGGACACAACTGATTCTACGAACGGTTAATGAGCTTCTCGATGTTGGTTAAGTCTTTTCT
TAATTCATTGTGATTTTAAGTTAATTTCTGTTGTTAGGGATTGAGGGACCAAAAAGCCTAGGTTTGCATACTCTATATGATTGTCGTGCATGCACTATTT
ATGATGCAATGTTCTATGGAAATTGGATTAAGTGTGTGGATTTGGGCAAAGTTTTTGGTTAGAATCGCGTGTTTGATGAGCTTATGTTTACCTGATTATT
TTTATACCATAGGGTGGAGGGAAAAAAAACTAGTCAATACTAAAGGCATGTTAAGGGCTGCAGGTATGGTATCAATCTGGCTAAAGGTATTCTGGAACAT
CACTCGAAAGGGATCCTAGATTTTGACAAACCAAGGAAATTGCTCGCAGATTTTCGAATTGGCAAGCTCATCACAGGCATGTCATCAGGAAAAAGTTCAG
TGACAAGTTTCCAGGGATCACCTGTACCTGCAGGACTAATGGAGGGTGGTCTGATTGATGTTCAACAATTTTCACTCAAAGCTTTGCTTCTATAAGAATT
CCGACAAGAAATAATTCACTCTCATAATATCCGGCTGCACCAACGGGGAAGGACATGCAGCAATGGTTCTTGGCATGCCAAGAACAGCAATCACTTTAAA
CAAAAAAATATATTTGTGCTGGCAATCACATGGAGTTTGGATACATTGGTTTGCAGATTCCACATCAATACAATTCACAATTTCATTGTCCATAGCTGGA
GATTTAAATGTAACCACATGATGTTAAAAGCTGTGCATGCACAATAGTACACTAATTTGTTTAAAATGTGGTATATATTGAATCAAATAAACAATTATTT
CAGCATACTAGCATTATAGATTCTGCAGTATGTTCAAGTTACCCATTTATAAAATTGCAGCAAAAAGAAAATGTATTTTGAAGTTTGTATTTCATTATGG
TACAAACTTTACACCTTCGAGTGCTGATCATTTCATAGCAAATGTTACATAGATCGAGAATAGAGTATGTGATTCAATGTATGATTCGGTGATCCAAGAA
GGAAGCAATAGATAGGCCAATGTTAGTATCAGCAAAAATGTTAAACACAAAATACAACATTCTTGGTCAGCAGATCTTTTGAAAGTGGGAGT