Detailed information on CNT0000247 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P68428|H32_WHEAT, E-value = 2e-13

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0000247

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (59 aa)
MKMIGGCGWCFCFSDSFFYSIDGVVREGRFSAGSSINWDIGKYCRVSVTVFSSFKKIGL*

>peptide 2 (34 aa)
MTHMSKNQLQANFLKGRKHSHGHLAVFACITING*

>peptide 3 (67 aa)
MGNTVKHLHSLTTLSIEKKKKRNLNNKNTTRSNPSSSSSSQPPPQARSPRILLASWISLGIMVTRLA*

>peptide 4 (36 aa)
MSKLSRFSASSVILYSNPLISKPRREVSLISTTNLA*

>peptide 5 (34 aa)
MYVLECFCFSFYLRDVAATLETVLDNIQLPSNLV*

Sequence

>CNT0000247
TGAAATTCAACAAAATTTGAAGCCAAAACCAACATAGGTAATTAAGTATTTATGAGCAAATTGAGTAGATTTTCTGCCAGTTCTGTAATACTATATTCAA
ATCCTCTCATTTCAAAACCAAGAAGGGAGGTCAGTTTAATTAGCACAACAAACTTAGCTTAAACGAGATTAGATGGCAACTGAATGTTGTCCAATACAAT
TCCAAAGTGACTACATCCCGTAGGTAAAAACTAAAAACAGAAACATTATGACACACATGTCCAAAAATCAATTACAAGCCAATTTTCTAAAAGGAAGAAA
ACACAGTCACGGACACTTGGCAGTATTTGCCTGTATCACAATTAATGGGTAATACCGTAAAACACCTACACTCCCTAACAACCCTATCCATTGAAAAAAA
AAAAAAAAGGAATCTGAACAACAAAAACACCACCCGCAGCAACCCATCTTCATCTTCATCTTCACAACCACCACCTCAAGCACGTTCACCGCGAATCCTT
CTTGCCAGCTGGATATCCTTGGGCATAATGGTTACCCGCTTAGCGTGAATGGCACACAGGTTAGTGTCCTCAAAGAGCCCAACAAGGTATGCCTCAGCAG
CTTCTTGCAATAAGGATTCGTGGTGAGCGTGCTTGAGTTGGTGGTTGGAAAGATGAAGATGATTGGTGGCTGCGGTTGGTGTTTTTGTTTTTCAGATTCC
TTTTTTTATTCAATAGATGGGGTTGTTAGGGAGGGTAGGTTTTCTGCTGGTAGTAGCATTAATTGGGATATAGGCAAATACTGCCGAGTGTCCGTGACTG
TGTTTTCTTCCTTTAAGAAAATTGGCTTGTAATTGATTTTTGGACATATGTATGTGTTAGAATGCTTCTGTTTTAGTTTTTACCTGCGGGATGTTGCAGC
CACTTTAGAAACTGTATTGGACAACATTCAGTTGCCATCTAATCTCGTTTAAGTTAGTTTGTTGGGTTGCCTCGTTCTTACTCGGGATTTCCATCCCAGT
TTGGTTACTGGGTTTCTTATTTATTGTTCACTGTACATTATTTATGGATTACCTCCATAAAAGAAAAGAGCGTTAATCGAAGCTGTCAGATTTAAAAGTT
AATATAATTTTTAGTTTAAATCTAAGTTTCTAGTTATGATTGTGTATATAGGCAGAGGAAGAAATATGTGCATGAAGAAAAAGTTAGAAAGATGATCTGG
TGAAGGATTGTCAGAAAGCTCAATGATAATTAGTGTCATGTTTCAGGTAGAATGATACTTTGATAAACCAAGTATAGGATGCTTTTGGGATTTGTATTGC
ATTTGATTAACTTTTTTATTAAT