Detailed information on CNT0000577 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0000577

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (48 aa)
MKLRQHLMLSASFLIILYQNESVFLDDCSISHLLQGPSKFSLATYRVN*

>peptide 2 (49 aa)
MTVWRHLGYDFKHVEWGVKVYLWEFSILQLWYHRLEPTYSYIKQLGGWD*

>peptide 3 (29 aa)
STVFQLFFLSLSLWRMNHSLPLRSETHHF*

>peptide 4 (50 aa)
MLVMNLNYIKLSHCILLNFEFSLCQYLIRILLLDVFTDYECSLLYISLII*

>peptide 5 (91 aa)
LNCLSTLFSLSLSLANEPFSSSPIRNPSLLTPADLPLSTSLHTLHQSLPNFPSLIIPFLLFLSSHLSAIASLGFLRGDGFSNCIRPFNWIE*

Sequence

>CNT0000577
CTCAACTGTCTTTCAACTCTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTTTGGCGAATGAACCATTCTCTTCCTCTCCGATCCGAAACCCATCACTTCTAACACCTGCAG
ATCTCCCTCTCTCAACCTCACTCCACACCTTACACCAAAGTCTCCCAAACTTTCCATCGCTTATTATTCCCTTTTTACTCTTTCTCTCTTCTCACCTTTC
TGCAATTGCTTCTCTAGGGTTTCTCCGAGGCGACGGATTTTCCAATTGTATCCGGCCTTTCAATTGGATTGAATGACTGTATGGCGGCACCTAGGCTATG
ACTTCAAGCATGTTGAGTGGGGAGTGAAGGTTTATCTTTGGGAGTTCTCAATCTTGCAATTGTGGTACCACAGGTTAGAACCCACTTACTCATATATTAA
ACAGCTTGGAGGTTGGGACTGACCTATTATGACGTTATCGTTCTCCAGAATACCTATTATGACGTTATCGTTCTCCAGAATATTAACAGCTTGAAAGTAC
AAAACCAAGAGTTTTAATTGTGAATTAAGAGGCATTTTTGCCTATTATTGTTGTTTGGTTGAGAAATAAAATTGATCATTTTTAAGATGTGCACTGCACA
ACTCATCATATAACTATAGGCTTTCCAATTTTCCCTGGTTCCTATTAGATCACTAAGCACGTGCTAGTCCTTCATAAGGTTTTTGGAAGCCATTATAAGA
ATTTTATAATCCTATCATATCATTACTAATGGCCTTAGCTGATGATAGATTCCATTTTTTGCTGGGTTTAATTAAAATACATTTAAACTAGTGTATTTTT
CCTTTCCTCTTGTACTATCCATAGTAATTTCTAAAATTAAATACATTCATTATGAAATATAAAAATGAAGTTGAGACAACATCTAATGCTTTCTGCCTCA
TTCCTTATTATTTTATATCAAAATGAATCAGTTTTTTTGGATGATTGTTCCATATCCCATTTATTGCAAGGACCTTCTAAATTTAGTTTAGCAACATATC
GAGTGAATTAGTGCCAATACATATTCCCTTCTAGCATTTAACTTGTTCATGTTAGATTGTGATATAGTAACATGTGCTATAATGTATCCTACAGCCAGTA
TTATATAGTAGGAGGAAAGTTTATAGGACTGGCTTAATTGTTTGGCAAAGGCAGATACGGAGAGGACACTTGAGGAAAAGATGTTGTGGCTGATAGAGAG
TCATGATCACGTAGTCAGGTGATGTGGATGGAACCGAGCACCATGTTGACAATGCTCAAGTTGATCATTGACTCTTGGCTATTGTTTTAGTTTGATTATG
TCATGTTAGTTATGAATTTAAACTATATTAAACTTTCACATTGCATTTTATTAAACTTTGAATTTTCACTTTGTCAATATTTAATTAGAATTTTGTTATT
AGATGTATTTACAGATTATGAATGTTCACTTTTATATATAAGTTTGATTATATAGTTTAATTAAAAATTATATTT