Detailed information on CNT0000592 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0042278, E-value = 4e-06 (A. thaliana)

Expression of CNT0000592

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MNCASHSFVLSILLSSPFSLPVSLPLYTNC*

>peptide 2 (40 aa)
MYACPIYCIHEQNQRLKTCNQIGHGPRNNVQYKFKKLKNQ*

>peptide 3 (32 aa)
MKGFKFNFCASAIHSVPIPLVQKLAFDLLHCL*

>peptide 4 (33 aa)
MMAIINLCILQLDVHCRCGCWTLQICLLMVRGG*

>peptide 5 (66 aa)
MYCNLLLGRRTTCNWKLWQGDCEENIWGPNSKLTMTYCRTYIYILNCSVFFQVNTPHSVLFTDLQW*

Sequence

>CNT0000592
CCATGTATGTAAGTTAAGTAAGGGGTGTGAGATTAAAATCTATGTGCATGCATATTTGACAAGTGGATTAACGTGGAGTACGTGAATGGGTTGTTAAGTT
ACATATATAAGGTGTCCTTTTTAGAGGGTGTTTTATCTCGTGAGAAGCGGTTACAACAAAATGAAGAGTACATGGAAAGTGTCATTGCATTTGTACTAGC
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GAGCTGGAATTCATATATAAATTAGTTTAATAAGCATGCTCATGCGTGTATAATATGATGTTCACAGGTTTTAAAAAAACTGTGAGTCCATGACTGCATC
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TGTGGCTGTTGGACACTACAAATCTGTTTGTTGATGGTACGAGGAGGTTAGAATGAAAGGGTTTAAGTTTAACTTTTGCGCAAGTGCAATTCATTCCGTA
CCGATACCTCTTGTTCAAAAGCTTGCATTTGATTTGCTACACTGCCTCTGAGATATAATTAGAGAGTGATCATAGACTCGTTATCATGATCACAATATGA
TTCTTAACAAGAAGAATGTACTGTAACTTGCTTCTTGGAAGAAGGACCACATGCAATTGGAAGTTGTGGCAAGGGGATTGTGAAGAAAATATATGGGGTC
CAAATTCCAAACTGACCATGACATATTGTAGGACATATATATATATACTTAATTGCTCAGTATTCTTTCAAGTCAATACCCCACACTCAGTCTTGTTCAC
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TGCATGTCCTATTTACTGTATTCACGAACAAAACCAAAGGTTAAAAACATGTAATCAAATTGGTCATGGTCCAAGAAACAATGTTCAATATAAATTTAAA
AAACTAAAAAATCAATGATACTTTGACTTAGAGCAAGACAAAA