Detailed information on CNT0000606 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P33627|TBA6_MAIZE, E-value = 9e-08

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0000606

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (52 aa)
TSCAPPSSISKPPSSTKSAAAPAANSSIPNKEDAANNFARDHYTGNYLPGGA*

>peptide 2 (51 aa)
MLQPVKMMEDFRRLALENTRKNSETCGVLAGSLERDVVICVLPSSRKSLGW*

>peptide 3 (53 aa)
MSFTLVFFGAKRQWKIILKKTNLNDFFANLRTNEGFFFKKIRTKMPHLYNIEN*

>peptide 4 (33 aa)
MVIDESCIIGNYWYPRRFLNILVEMLLQSPMLL*

>peptide 5 (77 aa)
RPARRLRRSRSHRHRRSPLLLPPPTLPSRTRKMPPTTSPEITTPATIYREEHNVVDLYIILLRFLRDHELCWMSLNL*

>peptide 6 (54 aa)
HVLRAAFVDLEATVIDEVRCCSRRQLFHPEQGRCRQQLRQRSLHRQLSTGRSIM*

>peptide 7 (38 aa)
MVILTVICACNLGGSRKKGISYHNTYNPKQESTSDSVR*

Sequence

>CNT0000606
CACGTCCTGCGCGCCGCCTTCGTCGATCTCGAAGCCACCGTCATCGACGAAGTCCGCTGCTGCTCCCGCCGCCAACTCTTCCATCCCGAACAAGGAAGAT
GCCGCCAACAACTTCGCCAGAGATCACTACACCGGCAACTATCTACCGGGAGGAGCATAATGTAGTTGACTTGTACATCATTCTCCTTAGATTTTTAAGA
GATCACGAGCTGTGTTGGATGAGCTTGAATCTTTGAAGCCCAAATTTAAACATCGGGTGGAAAAAATGAATGACTAGCATGTAAAAGCTCCATTGCCTGA
AGAAAATGGTTTCAATAAAGCTTTGCAAAGTTGAGTGAATTCATTATTGCAATGGCCGACTGTCAATAAACAGATCTGTTAGTCTACCCCCTCCAAATAA
GGAGAGTTTGACCAAACATGCATTTTTAAGACCAAATGGCCTTTGGGGCCAATGGCTTGGACCTAGTGCAGAAATAAAGGTTCAATATCGAAGGCCAGGA
CCAGCTAAATCGTCTCATGATTCTGGACTTGATGCAACTACGTATCAACACCTACATATAGTAAACCTTTTCTAGTTTTCTAATTGAAGTGCGTGACATA
TATCTTGGATTTTCTAAGTCATTTATTGTCACTTGTTCTTATATGTGTTGGCTCTTTGAGTTCTTAACTTCTTATACTGGTTAAAAGTTATTATAATTTC
ACTTTATGTTGCAGCCTGTCAAAATGATGGAAGATTTTAGGAGATTAGCTTTGGAAAACACAAGGAAGAACTCGGAGACATGTGGTGTTCTTGCAGGGTC
CCTAGAAAGAGATGTTGTAATTTGTGTGCTTCCAAGTTCTAGAAAATCTCTTGGATGGTGATTTTAACAGTTATTTGTGCTTGCAATTTGGGTGGCTCTA
GAAAAAAAGGTATTTCATATCACAACACTTATAACCCAAAGCAAGAATCAACTTCAGACTCGGTAAGATAATGTCATATTTTTCTTTTTTAATTTTACAA
GCTATCATACTCTGTCTCAGTGTGTCTATTCCTTTGTTATTCCATGATTAAACAGCTTCATTTTTTACATAATCTTATTCCAACTATATCTTGACTGACA
AAATAAAACATTAGTATTGCTTTGAGGTCGTGGTGCATAGCTATGGTGATTGATGAATCTTGTATAATTGGTAATTATTGGTATCCGAGAAGATTTCTTA
ACATTTTAGTGGAAATGCTGCTTCAATCTCCAATGTTACTGTAAATTAAAATTATGAGCAATTATTTTTATAGCCAACTGCTTCTTTAGTCAATTTTAGT
GGAGTTATCCTTGGAAATTTTAATGATTGTGATGTTATAGATTTCTTGGTACTGACTACTCCAAATTAGTCCTTGAGATCTTATGTGTTTGGTGTTTCAG
TCCTCGAGATTTTAAAAATCCTTCATTAGTTTGACTTTGCAAAATGTCATTCACTTTAGTCTTCTTTGGTGCAAAACGACAATGGAAAATAATATTGAAA
AAGACTAATTTGAATGACTTTTTTGCAAACTTAAGGACCAACGAAGGTTTTTTTTTTAAAAAAATTAGAACTAAAATGCCCCATCTATACAATATTGAGA
ACTAATTTACAAGCTTACTCATATATTAATAGAATTAGCACATTATGAAGTACTCATTGGATTTAGGAGTTCAAAGGATTGTAATTTCCCATGGTTCATT
GATGTTTTTTTCTTCTACTGTCTGATGTTATTTTTTCATTTAGCAATAGTGCATCTAATTGAATTTTAATATCCAGTGTCAAACAAAACATTGAACGAAG
AAGAAATATTTGAAGTTCAAGACAGCTTATCACTTTTTCCTTTTGGTTGGATACATAATTCGAGACTTATATGGCATTCACGAATCACAAATCACAAATG
TTGATTTTTGGGACTACAATCAAATAAAATTTGTATATTCTTGTATTTATATCAAATTACTATTTAAGAAATGTATGTAAATTGTTAACATGTTAT