Detailed information on CNT0000680 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P29677|MPPA_SOLTU, E-value = 3e-21

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0000680

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MAVTQVQLDLAKLSTKSAVLMNLESRVCSL*

>peptide 2 (33 aa)
MVSVTLQSLVHIICHNLHKLVFLSTTFSFFFLL*

>peptide 3 (71 aa)
MIASEDIGRQVLTYGERKPLEQFLNAVDGITLNDITKISQKIISSPLTMASYGDVFNVPCYESVSRKFHAK*

>peptide 4 (30 aa)
MCQIKYIGFLQWQLHRYNLTLPSYPLSLQF*

>peptide 5 (109 aa)
MLSLTLTGSLNDMEFLSFTLPSVPELKIMCLSCIFASFYIMIYLDFSTRFVTSRKGNWVGLISYSTSCVSKLIAFADDCIRGYRKASIDLWRKEATGAVL
KCSRWNHFE*

>peptide 6 (61 aa)
MISLKFLRRLFPHLSLWHHMGMFSMFPVTNPLAGSSMQNEIAFSFSPSQNKSQRIFIADMR*

Sequence

>CNT0000680
GGATTAGTGTGTCTAGAAAAATAAGTTTCGTTATATGATCTATTGCTAACGCAACACAAGATACTTAAAATGTACTTCTGAGTTGAGGTTGCCTTCAACA
TTGATCCGACTATAAATTTAATTGTAGAATTTTGCATGGTGTCAGTGACCCTTCAATCTCTTGTTCATATAATTTGTCATAATTTGCACAAACTAGTTTT
CCTATCGACTACTTTTTCTTTCTTTTTCCTCCTTTGAAGCTCTTTGGAATTTTTTACAGTAATAGTTACTGCTTTATTTATCAAATTTGAGCACTTTTTC
TTATGCATCAATATAGGGCTCTGATTTTGTGGCAAAAGCTGTGGATTTAGCAGCCAGAGAATTAATAGCAATTGCATCACCGGGACAAGGTTTAATCTGC
CTTGCTTTTTGTCTCTTGCTGTGAATCCTGATATGTGCCAAATTAAATATATAGGCTTCCTGCAATGGCAGTTACACAGGTACAACTTGACCTTGCCAAG
TTATCCACTAAGTCTGCAGTTCTAATGAATTTAGAGTCCAGAGTATGCTCTCTCTAACTCTCACTGGTAGTTTGAATGATATGGAATTTCTTTCATTTAC
TCTTCCCTCCGTACCTGAATTAAAAATAATGTGTCTCTCTTGCATCTTTGCTTCCTTCTATATTATGATCTATTTGGATTTCTCTACACGCTTTGTCACA
TCTAGAAAGGGGAATTGGGTTGGTTTGATTTCATATAGTACATCATGTGTTTCAAAACTCATTGCTTTTGCAGATGATTGCATCAGAGGATATAGGAAGG
CAAGTATTGACTTATGGAGAAAGGAAGCCACTGGAGCAGTTCTTAAATGCAGTAGATGGAATCACTTTGAATGATATCACTAAAATTTCTCAGAAGATTA
TTTCCTCACCTCTCACTATGGCATCATATGGGGATGTTTTCAATGTTCCCTGTTACGAATCCGTTAGCAGGAAGTTCCATGCAAAATGAAATTGCTTTTT
CATTCTCACCAAGCCAAAATAAATCCCAGAGAATTTTTATTGCGGATATGAGATGAACCTTTTTACTTTTGTTTTTAGTCATTCCCTTTGAAATATAGGT
GTATGATCTCACGACATTTTCCTTCTTTTTGTCAACTAATTAATTTTCTGTATTTCTTTTATTAGTTCTTTTCAGAAATAATTGATTTGGTTTCTACTTC
TGTAAGAAATAAGAAAAATGATTTATCTGTCTTCTTTTGAGAAAAAAATAAATATATCTATTTATTAGTCA