Detailed information on CNT0000692 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0000692

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (103 aa)
VRLGSAGNFSSSCCFFLISAYNRFIISIVSFSRQIHILFLSSSSSPLSLPLPCLRVKDHNSTVTDFQGFLVLLVYYTCLHLHVLVRCACVGNSPSFSLFP
TFL*

>peptide 2 (38 aa)
MSGFINMICRCYGLVYANFHIGRRKNVTPKILLIGRIA*

>peptide 3 (40 aa)
MPLLWIGICQLSYRKKKECDTKNPVNWKNCIGFIQLERGL*

>peptide 4 (48 aa)
MHYGHCNVGPIVYMIDEDYCSMFICLELILTVFNAGDDCYSAEGWFLQ*

>peptide 5 (112 aa)
MSIDSIARMQDFLPFALASLRAGKNLLSLNLFFLILNCRPLLGTMDLLKTGFVHFLYNYTQLSCLWFVKRVYCNWILGCALIVDIPVKGNFFYMESHCIN
FELFLLNILIPI*

>peptide 6 (119 aa)
KIGQCREFLLLLLFLSYFCVQPLYYFHCLLLTTNSHSLSLFIIFPSLSSFALSPCERSQLHRHRFPRFLGAAGVLYMLTSACAGEMCLRWKFSFILSIPH
FSLAIYPSRIFSSIFWLWK*

>peptide 7 (30 aa)
MLVLSVTGNLGNDVALTIFYCYSSKWALGC*

Sequence

>CNT0000692
GTAAGATTGGGCAGTGCAGGGAATTTCTCCTCCTCTTGTTGTTTCTTTCTTATTTCTGCGTACAACCGCTTTATTATTTCCATTGTCTCCTTCTCACGAC
AAATTCACATTCTCTTTCTCTCTTCATCATCTTCCCCTCTCTCTCTTCCTTTGCCTTGTCTCCGTGTGAAAGATCACAACTCCACCGTCACCGATTTCCA
AGGTTTCTTGGTGCTGCTGGTGTATTATACATGCTTACATCTGCATGTGCTGGTGAGATGTGCTTGCGTTGGAAATTCTCCTTCATTCTCTCTATTCCCC
ACTTTTCTTTAGCAATTTACCCTTCACGGATCTTTTCAAGCATTTTTTGGTTATGGAAGTGAATGAATTCCTTCATTTGGTTTCTTCAATTATGTTGTCT
GAATCACAGATGACGTATCAGGAATTTTGAGTCTTGGGTTAATGGGGTGACTATAGAAATGATGACTTTGTCATGAGCATTTATGTCAGGATTTATTAAC
ATGATATGCCGCTGTTATGGATTGGTATATGCCAACTTTCATATAGGAAGAAGAAAGAATGTGACACCAAAAATCCTGTTAATTGGAAGAATTGCATAGG
CTTTATTCAACTAGAACGTGGCCTTTAGATCAAGCTCGTCCATCTACTGGGACTGGGTGCCTTTTTGGTATGAAATGTCCTAGCAGTTATGCTGAGGATG
TTGTTGCAATAACTCTGTCACATTCCAATGTTTGGTGAAGCAAAATGTTGGTGTTGAGTGTTACTGGCAATCTAGGGAATGATGTGGCACTTACCATATT
TTATTGTTATAGTTCTAAATGGGCTCTGGGGTGCTGAGATAAGATTCTTGTAAACCTTGATACTATTTGCCCCAGTGACTTGTAAATGCCTAGTCAAATT
CGTCTCATTCTTAGTTTTGAATTTGACATTATGTTTCCTGTTGTGGTGATCTTACTTCGTGGGGCTGTATAATGAGTGTAACAGTGCAGTAACAGTATTC
ATATAAAGAATTCACTGTAAATTGGTATGCACTATGGACACTGCAATGTTGGACCAATAGTGTATATGATTGATGAAGACTACTGTTCAATGTTCATTTG
CCTTGAATTGATATTAACTGTCTTTAATGCTGGTGATGATTGTTATTCTGCCGAAGGTTGGTTTTTGCAATAGTACACCTACTCATTACTGGGAGTCGTG
TAGTGCTGGATGATGCTTTATTTGGATATGAACCTGTAGGTTTGCTGACAGAGAAGCTGTTTGATTACCACAAATTGGTTATCTTCTCCCATGGTCCTAA
ATTGGATACTAGTGCCATGAGTATCGATAGCATAGCCAGAATGCAGGACTTTCTCCCTTTTGCATTAGCTAGTTTGAGAGCTGGAAAAAATCTTCTTAGT
TTGAACTTATTCTTCCTAATTTTAAATTGCCGTCCCTTGTTGGGGACAATGGACCTTCTTAAGACAGGCTTCGTTCACTTTTTATACAATTATACACAAC
TCTCCTGTCTCTGGTTTGTGAAGAGAGTTTATTGCAATTGGATATTGGGATGTGCTTTGATTGTTGATATTCCGGTAAAAGGCAATTTTTTTTATATGGA
AAGTCATTGCATTAACTTTGAACTTTTTCTTTTAAATATTCTTATTCCTATTTAATGCAAAGCCAATAAGCCACGTG