Detailed information on CNT0000892 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LMX4|PPA1_ARATH, E-value = 6e-37

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
:
CNT0023666, E-value = 3e-11 (A. trichopoda)

Expression of CNT0000892

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MKDIVVLAGGGEGSVLAGSALWITFWSLGY*

>peptide 2 (32 aa)
MLRSCNWFDWDQNMSSEIHKLSLKLSEKVLTS*

>peptide 3 (31 aa)
MFKFCIANTEFDWRKGSEQYKLIENCLATVD*

>peptide 4 (32 aa)
MFNIAWTFFSICTRFIYFQEYQVLPISLNTHR*

>peptide 5 (31 aa)
MDSLKYIFQKIKLVTSFRNNMGNGFNIQNHT*

>peptide 6 (32 aa)
MFQVIKHKKPRKITQYWIHYTCCLSVCSILLI*

>peptide 7 (49 aa)
MEWTHLSIYFRKSNWLHHLETTWGMGSTYKTIPNLDNVSQTHINDLILL*

>peptide 8 (52 aa)
MLQKARLKNQWEGRTFNISNRSIRLTYQCMDMSITMKGLTLCIRYLLNFRDR*

Sequence

>CNT0000892
AGAAAAAATATGACATACTAACTAAAAAAATTAATTAATCATATTTAATTACACTAATTTTAATTAAAAAGTAATCATTTTAACTTATTTTTCATTAAAA
TTTGGTATCAAGATAAGAAAGAATCATTGAAACTGACATGTCAATAAAATGAAGGATATTGTAGTCCTCGCTGGTGGTGGTGAAGGGAGTGTCCTCGCTG
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TCAAACTCATATAAATGACTTAATCTTGCTTTAGATATAGAATTCCATTATCAATATTATGTTGCGTTCATGCAATTGGTTTGATTGGGATCAAAACATG
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CTCCATATTATTAATTTAATATTCTATAGTCTTGTATTATTGATGTAATTTTCACTTTGTTGCTTGTATAACACTAGACATACTCACCAAAGCCAACTTG
ATGATATTTTGCTATGTTTGCTTCTTGTGTTAACATTTAAACTACATGGATAGATGATTCTCCTTGTCAAAGTAAATTGACTTTGTTCACAATGTGATGG
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CTACGTGTTGTCTTTAGTCTTCTATGCATTTTTGACATTGGAAACAATAATCCATGCAGCTACACAGTTTAATTAGCAAAAAAAAAATATAATTATATTG
ATTTTTACAGGAAAACCATCTTAACCTACAGTCTTCTAAAAAGATTTTCTCGTCAAAACCATTTTAGAAAACTTTTTCTTTTAAGACAATTTTGGCAAAA
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