Detailed information on CNT0001135 (Glycine max)


BLAST search results

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BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0001135

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MFKKLHLNCFYLSLNYTKYHYQLFISFFSQ*

>peptide 2 (63 aa)
MVWPSTTPEYFLTTPLSFFPRCHSTLFLSFFFSLSAHKPWLCWWRKPHKWYRKMKNVLLGFQC*

>peptide 3 (52 aa)
QNAVPFCAETLTLNQHGLAFHDSRVFPHHSTLFLSSLPLHSFSFFLFLSLSA*

>peptide 4 (42 aa)
MFVDVAVMWIPRYWLVLRSRALIWHSWRSRSLILQLIGSAEY*

>peptide 5 (31 aa)
MTNILSHVQKVTFKLFLFIFELYKISLSIIY*

>peptide 6 (52 aa)
MEAALGSSKDYSLKQYIKFVDKLQRKAEVLFYTFQRGRMNACVLHFNIGRWE*

>peptide 7 (45 aa)
MSYNCWNRKFIFDRIPFFSSVVHHIFLSLSLNQIKGRTTITGEPY*

>peptide 8 (42 aa)
MERRVFYYVIFLLMCHFLCSGYGGSSWKLKRLFTEAIYKICG*

Sequence

>CNT0001135
AACAAAACGCGGTCCCCTTTTGCGCTGAAACGCTAACCCTCAATCAACATGGTTTGGCCTTCCACGACTCCAGAGTATTTCCTCACCACTCCACTCTCTT
TCTTTCCTCGCTGCCACTCCACTCTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCTCTCTCAGCGCATAAACCATGGCTTTGTTGGTGGAGAAAACCACACAAGTGGTA
CCGCAAGATGAAGAACGTCTTGTTGGGGTTTCAGTGTTAAAATTGTAACTGTAAATCATGTTTGTTGATGTTGCAGTGATGTGGATTCCACGATATTGGC
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AAGGGTTCGGTAAGAAGGTATTGGAATGTGGTAGGTAGGTGCTAAGAAGGTATTTGGTACTGGAATGGATTACTTTTAGAAGCCATGAAAGTATGGATAG
AAAACAAAAACTCTGTAATGCCATGTCAAAATTTATGTGAATGGAAAGATTGATAGCTATTTTTTTTTTATCAGCGGAAAGATTGATAGCTATGTTAATT
ACGTAGCTGTTTTTTCTAACAAACTTGAGAGCTCTTTTAATCCTTGGAGTTTATAACAATATCCCCCAATAACTGTTACAAAAGTTGGAAATGTAATAAT
TCATTTGAAGTTCCAATTATTACACTACTTGTTTGCAAAGCCAAGTTGGACCAAGTTGTATACTTATTTTTGTCTTTAAGTTGTCTACTTATATTGAATA
TCTCATTTGAATTTTTAATGAGCTATAACTGCTGGAATAGAAAATTTATTTTTGACCGTATTCCCTTTTTTTCCTCTGTAGTTCATCATATCTTCCTTTC
TCTTTCATTGAATCAAATTAAAGGAAGAACTACTATTACTGGGGAACCATATTGAAAAAGAAGTGAGAGAGGAGAAGCAAGTGCCATAGAAGAAGAAGCT
GAGTAGTGAGATTAAAGATGGAAAGGCGTGTATTTTACTATGTAATATTTCTCCTAATGTGTCATTTCCTCTGTTCAGGCTATGGAGGCAGCTCTTGGAA
GCTCAAAAGATTATTCACTGAAGCAATATATAAAATTTGTGGATAAGTTGCAGAGGAAAGCGGAGGTACTTTTCTATACCTTTCAACGTGGGAGGATGAA
TGCTTGTGTTTTACATTTTAATATAGGAAGATGGGAATAGGTTGATTGTAAATATTTCGTTGATTTAAAGAATGGAATTACTATGCTGATAAAAATAATT
TTTATTGATACAATTGAAATAAGTACTTTTGTTTCCAATGGAGGCTGTG