Detailed information on CNT0001368 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FT74|RQL1_ARATH, E-value = 2e-31

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0001368

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MQEIDQAQMEQLHKKIEDDLEVSRLAMHLERSGYQ*

>peptide 2 (61 aa)
MSKSIESYYQESGRAGRDNFSSVCIALHQKKDFSRVVCMIRNGQGYKKESFKTAMAHIYVL*

>peptide 3 (36 aa)
MTNEEKVKYYDIASEKRIEFDRAMAKFNNKMESGGV*

>peptide 4 (55 aa)
MLSFNVVNGGWRFIAESKKSVIKIWQIQGLGSLKLHFPDVPVMALTATATHAVRE*

>peptide 5 (35 aa)
MIIPTIIQIPSDHLIILFLSILPKCISWKYKPTAL*

>peptide 6 (35 aa)
MIKVGWDSVLDRYDIYVMTSDFRPGTEYNDGISKF*

>peptide 7 (29 aa)
YDKGESSQFLFKLCDAKFSGVTHLNFSFL*

>peptide 8 (41 aa)
MILPSFSLGCILQVFVLFQMLGSLGWFFENTLFLLMEFCIH*

>peptide 9 (59 aa)
MAKDIKRKVLRQQWLTSMYCEIKAECRRQTLLKHFGESFDRRDCKYGSSPCDNCLKTVL*

>peptide 10 (44 aa)
MGVSLNHSFGIFVLNCLPFGYIVWFCIVWFFFIQERTILCKNRY*

Sequence

>CNT0001368
TACGATAAAGGTGAGTCTAGTCAATTTCTTTTTAAACTCTGCGATGCTAAATTTAGCGGTGTCACTCACCTGAATTTCTCTTTTTTGTGATCTTTGGGGC
CTTTATCAATGCCACATCTCTTTCTTTCTCTCTTGATCTCATTTTGTGATCTTTGGGGCCTTTGTCAATGCCACACCTAAATTTAGCAATGTCACTCACC
TGAAATTAAGTGTGTATTCTTTCTTTTGCGAATTTTTTTTCAGAGTTGATTTGACGTAACCCAAAATCGTGTTTAATGTTTTGAGGCAATTTCTTTGTTT
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CTTTATTCAAGAACGCATCATCTTGTACAAGATTTGCACGAACTCAGAGCGAGAGCAACAGGAGGAATTGTCTACTTTCCGCAACCAGATATGTTCTGAA
GGGTAATCCCTAGGACCTGGAATGCAACTCACTTAGCAAGTCTTGCTTCAGTTAAAAACGGATAGTATATCTTTTTCCTAATCTGGTATTCTTGCTAGAG
TTAAAAACAGATAGTATATCTTTTGATTTTGTTTCCGGCAATGCAAGAAATCGATCAAGCACAAATGGAACAATTACACAAGAAAATTGAGGATGACTTA
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TCTTATGATTCTGCCGTCATTTTCTCTGGGTTGCATATTGCAAGTGTTTGTATTGTTTCAAATGCTGGGAAGCTTAGGGTGGTTCTTTGAGAATACTCTA
TTTCTTTTGATGGAGTTTTGCATCCATTGAGAAATTGGAATTTAACATTTAATTGTTCAAAAGTGGAGGGAAAAAGGGTAAATAGATGATAAAAGTTGGG
TGGGATTCTGTTCTTGATATTTATGTGATGGCTTTAGACTATAGACCAGGAACTGAATAATGGGTCTATAGGTTTATGTGATGTCCCAAAATTGTTTTTA
ATGTTTTGAGGCAATTTCTTTGTTTACATCAATGGGGGTTTCTTTAAACCATAGTTTTGGAATTTTCGTTTTAAATTGTTTGCCTTTTGGCTACATTGTT
TGGTTTTGCATTGTCTGGTTCTTCTTTATTCAAGAACGCACGATCTTGTGCAAGAATAGGTATTAGGGTATATATAAACCCTAAAAGGTTGACCCAGACC
ATGAAAACAGAAAAACACTGATGCTACGATGAGATGAATTCTTTATTCATCGCTTGAAGAAGGATGCTATCTTTCAATGTTGTTAATGGTGGATGGCGAT
TCATAGCGGAAAGTAAAAAATCCGTCATAAAAATATGGCAGATACAGGGATTGGGATCTCTTAAGCTACACTTTCCAGATGTACCTGTCATGGCATTGAC
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GAATTGTTTACTGCCTTTCAAAAAGTGAATGTGTTGAGCTCTCCAAATTATTGAGTGAGAAATGCAAGATCAAAACAGTGTATTATCATTCTGGCTTGTC
TGCCCACCAGAGAGTAGCCGTTAAAAAAAAAATGGTAATGATGGAGAGGTCCATATTGTATGTGCAACTATTGCTTTTGGAATGTGGATAGACAAACCTG
ATGTTGTAAGTTGTGCTACATCTTAAAATTATAATAATGCTGTTATCATTCACAATTTCATGATCAACTTTGTTTAGGAATTTTACACTTCAAGAAAGAA
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GCCACATCATTACCAAAAACCTTCCTCTCAACCTCTCTGAACTTTACACAGGAAGTTCTTTTCCAAGCCATTTTTTCTTGATTGGGTTAACTAAATTTCA
AATAAAAATGATAATTCCTACAATTATTCAAATCCCTAGTGATCATCTTATAATCTTATTCTTATCCATCCTTCCCAAGTGCATAAGTTGGAAGTATAAA
CCTACTGCCTTGTAAACTTAAATGTAATATGTATACGTTAGTGCAGAACTTGCTTGGCTAGGGAAAATGTAGACACTTTCAAATATAGGGATCAGTTCTA
ACAGCAAGAAATTCTTATTGGTATCCTAAATTTATAGATTTTGTTACTCAAATTTTCCTTTTTATTGTCATGTTTTCAGCGCTTTGTCATCCACAATACA
ATGTCAAAATCAATCGAAAGCTATTATCAAGAATCTGGAAGGGCTGGAAGAGATAATTTTTCTTCAGTTTGCATTGCTCTACACCAGAAGAAAGATTTTA
GTAGAGTTGTATGCATGATAAGAAATGGCCAAGGATATAAAAAGGAAAGTTTTAAGACAGCAATGGCTCACATCTATGTACTGTGAAATTAAGGCTGAAT
GCCGGAGACAAACTTTACTCAAACATTTTGGAGAATCTTTTGATAGAAGAGACTGCAAGTATGGATCTAGCCCCTGTGATAACTGTCTCAAGACTGTATT
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ATGATATTTATGTCATGACTTCAGACTTTAGACCAGGAACTGAATACAATGATGGAATTTCGAAGTTCTAATGGGTCTATAGGTTTATTCCTCAGGCTTC
AGGTGCTGTTTATTTGGGAAGG