Detailed information on CNT0001605 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|O82702|VATG1_TOBAC, E-value = 9e-23

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001605

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (48 aa)
MLQKMVFPIFVSLYPFGIGLFIFIYGSQLLFYEGYGLALCPHACESKF*

>peptide 2 (56 aa)
MASNRGQGGIQQLLAAEQEAQRIVNAAKNGISYFCLPLSLWHWSFHFHIWVSVIVL*

>peptide 3 (30 aa)
MVYSFVNTILFSYQIMAFVCLISCWRKFYN*

Sequence

>CNT0001605
ATATGGTTTGTGAGTAAAATTAAATTATATATGTGTGATTTATTTATTATTAAAGAAATAGGTGGGTTGTGTTGATTTGATTGGGCGAAGACGAAAAGCA
AATCAGCGAAGCAGTCCTCCAGTTTTCGTTAGAGACACTGTGTCTTGTTTTCTCTGAATCTAACACAGACCCGATTGCTACGAATGGCATCCAACAGGGG
TCAAGGTGGAATTCAACAGTTGCTGGCTGCTGAACAAGAAGCGCAAAGAATTGTCAATGCTGCAAAAAATGGTATTTCCTATTTTTGTCTCCCTTTATCC
CTTTGGCATTGGTCTTTTCATTTTCATATATGGGTCTCAGTTATTGTTTTATGAGGGGTATGGGCTTGCTTTGTGTCCTCATGCATGTGAGAGCAAATTC
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GCTCAGTTGGAGTACGAGTTTCAAAAGAAAGTGTCACAGAGTAGTGGAGATTCTGGTGCTAATGTGAAGAGACTTGAGCAAGAGACAGAAGAAAAGATTC
ATCACCTGAAAACTGAGGCTGAGAGGATATCAGGGGATGTTGTCTCCATGCTCCTCAAGCATGTAACAAGTGTGAAGAATTAGAGAAATATTGGTGCTGG
GGAACTCTTAAGTTATGCAGAACAGTATATCTCATTTATATTGTGTTTATTGTTGATTCTAGATCCTGGCGCTGATAGATTCTTGCTTTTTTGTTGGCTA
TAATACGTGGTACCTTGCTGCCATGTATTAAAAATAATTTCTGAGTTTTTAAAAATAAACAGTTAAGAATTCATAGGCATGCCTATATGTATCACCGTTT
CAATAGAGGTCTGAGGATCACTTTGTCAGTGTATATTGAGTAAAGCCGGGACGAATGGTTTATTCTTTTGTAAACACCATCTTATTCTCCTACCAAATCA
TGGCTTTTGTATGTTTAATTTCATGTTGGAGAAAATTTTACAATTGATTGTGGGTTAAAATAATTTTAAGTAATTTCAGTATTAAAT