Detailed information on CNT0001627 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001627

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MIIESSFSTYGRILTSHRSRLHLDTLEAD*

>peptide 2 (36 aa)
CKQILTIRGNGFFNYPFLPVLRVPAISYRTMAEWIS*

>peptide 3 (44 aa)
VNRYSLSEETDFLTIHFYLSSGYPLYPIARWQSGYHNTLIYITS*

>peptide 4 (33 aa)
MEPERVLPDKPIVIYIWDIIRAARKLGLIARGR*

>peptide 5 (59 aa)
MTAAPRKGPRTTSSSHNLVITAAPHTSNTVTNLLTTSTHMYISIQFLFSSTMSFALLIL*

>peptide 6 (48 aa)
MAQLQCPTGHSLTLSPHRHKALPPGNAPPQSIAALHPILRHCQHSTPS*

Sequence

>CNT0001627
TGTAAACAGATACTCACTATCCGAGGAAACGGATTTTTTAACTATCCATTTTTACCTGTCCTCCGGGTACCCGCTATATCCTATCGCACGATGGCAGAGT
GGATATCATAATACCCTCATATATATAACGAGTTAGGCTTTGGAAAAAACCGTACTCTTTTCACTCACACTTTGCGCATGGCGCAGCTCCAGTGCCCCAC
AGGCCACAGCCTCACTCTCTCACCGCACCGCCACAAAGCACTGCCACCCGGCAACGCACCGCCGCAAAGCATCGCCGCTCTGCACCCCATACTTCGACAC
TGCCAACACTCAACACCGTCATGACCGCTGCACCGCGCAAAGGGCCGAGGACAACCTCCTCTTCTCACAACCTCGTCATCACCGCCGCACCCCACACTTC
CAACACCGTCACCAATCTTCTCACAACCTCGACGCACATGTACATCTCCATTCAATTTCTATTTTCTTCTACAATGTCCTTCGCCCTCCTAATACTATGA
TTTGGGGGATTTGAAACTTGGTTCTGGTGTGGATGAGGTAATTAGCAATTTAGCATTTAGAATTTGAAACTTGGGGGATTTGGGAATTTTAGGGCTAAAG
TTTCGAATTTTGGATTGGCAAGAGCTGTGGAGGATCACTGGGATAATGGTGGTTTCAATTGACAAGGCATTCTGACTAATAAAAAAAAAGTACACATCAA
CGTGGCATCTCCGCAATTTTTCTGATATTAATTAATTTCTCATTTGTTCTTAATAGATTAAAAACGTAAAAAGTACTCAACTGTAGTATTGACTCGTAAA
ATGTATGTTATGTAATCCTTACATTTTAATGAGAAATATACTTCATTGTATATAATTATATTATATATACTTGCACATGTTAAAAATTAACCAACACCAG
CACACAACACCTTAAATCATGAATTAATGCAGAAAGAAGGCACTGTACAAAAAGGGGGAATGGAAAAGAAAGCAATCTATTTCCCCTAAATGGAACCTGA
AAGGGTCTTGCCTGATAAGCCTATCGTGATATACATTTGGGATATTATCAGGGCCGCCAGAAAGTTGGGATTGATAGCTAGGGGTAGATGAGTATAGCTA
GCAACTTCTCAATGACTTGCACTTAAGTTCAGATTCTGAACAACCAGAAATGGTTCACATATACAACTGACAGGAGATGAAAGGGAAAATGAAATGAACA
ACAAAGGCATTGCTTTTCCTGATTTCTGCTAAGAGTGTGCTTGAGCATGCTTAGGTTTCTGATGGCCAAATCTCCTATAGCTGATAGATAGATGATGATT
AGATGATCATTATGGTATTGCTCAATTGCTTCGATGGAACAAGATATTCTTTTTTAATCTTGTAATTGCTGAGTTTTCTTTTGGCCTCTTTTTTAATCCT
CTACTACAAATGTTAAATTTTCATGTTTCTCCTGTATAGCTTTCATTTTTATATTTACCTCTTATGAATTATTATACTATTGAAATGAAGTAGTCCATGA
CCTTAGGTTGATGGTTTCATTCACGGAAATGGGTCAAATTTATAATGATTATTGAGTCTTCATTTAGTACATATGGTCGTATTCTTACTTCACATCGTAG
TAGATTACATCTAGATACTTTGGAGGCAGATTGACTTTGGACCGACATGGAAGGCTCAACTAAATCAAAGGTGGACAAAATGTTACTCCAAAAAGTGTTT
GAGGAAATAGTTGATGATTGACCAAAGTGAGGTTGTTGAAGAGTAAAGTTGAAGTTGTTTAGATTTAAGGAATTGAAGTTGAACTTCTTTTATTGGACTT
ATGTTGTAGATAGATTAATTTTATTTGAACCAATGTTTTAA