Detailed information on CNT0001633 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|F4KFG5|TPPI_ARATH, E-value = 7e-21

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0017067, E-value = 3e-07 (S. tuberosum)

Expression of CNT0001633

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (48 aa)
MVHAYHCYCLQPPHKSVCNGPYLCTKHVRCHRCGSNVPGNGLSVRYEF*

>peptide 2 (58 aa)
MPIGMLQEECLVSFMVKTYTPGRNQAKMFRWICINYYLYFICYSCISSTFAMKLQYAQ*

>peptide 3 (62 aa)
MTFTYTLYIVGKTYSDKQLAVIICPLKVDRRNVCRTKSIIHLPMDFLFIVTVFVRRYRSFFL*

>peptide 4 (43 aa)
MKKGRDILQINHPVGPFGTKPYNCKKNPRLYLLLITNHIIVEN*

Sequence

>CNT0001633
CGCATTGTATGGACTATAATTGCTTTATCACCCTTCAGCTCTGAACACCTTTGAACAGATAGTATATAGTGCCAAAGGAAAGCAAATTGTAGTTTTTCTT
GACTACGATGGAACTCTCTCTCCAATTGTTGTAGATCCAGATAAGGCTTTCATGACTAGAAAGATGAGAGCCACACTAAAGGGTATAGCAAGACATTTTT
CCACAGCAATCGTGACCGGAAGGGAGCATAGCTAGAAGATTTATTATTATTATTATATGATTTTTACCTACAGTTGAAGATGATATGTACATATTAAAGA
CTTTTACCTACAGTTAGGAGATGTAAGTAGAAGTTAATGACTTTTACCTACACACTATACATAGTAGGTAAAACCTATAGTGACAAACAATTAGCCGTCA
TTATATGCCCCCTCAAAGTTGACAGAAGAAACGTCTGTAGGACAAAGTCTATCATACATTTACCTATGGATTTTTTATTTATAGTGACAGTTTTTGTCCG
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GATTCTTTCCTTATCTTTTAACCATGATCCCAACCTAATTGATATGGTGACTCCATAGTTTCTAATTAGTAATTGCATATTATATGAAAACGCTAGTTCA
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TTAAAAGTTGTAATTGGCAGGTGGTATGATACATGCAGGAGCCATGCTCATGTGGGATCTGCATATATATGTGATGGTTGGTACTTGGTGATATAGATAC
TGCATTGGACTATGAAGAAGGGAAGGGATATTCTTCAAATAAACCATCCCGTCGGCCCTTTTGGCACAAAGCCATATAATTGCAAAAAAAACCCAAGGCT
TTACCTCCTCCTTATCACAAACCATATTATAGTGGAGAATTGAAGCAAAAGGTGTGATGGTGCATGCTTACCACTGTTATTGTCTTCAACCTCCACACAA
GAGTGTTTGTAATGGGCCTTATTTGTGCACAAAACACGTAAGATGTCACAGATGTGGATCCAATGTCCCTGGAAATGGACTAAGTGTGAGGTATGAATTC
TGAATAATTTAGCTTTGGTTTGATGTCTGGTGTTGGTGTGCCTAGTGTTGATGCCCATAGGAATGTTGCAAGAGGAATGCTTAGTTAGTTTTATGGTCAA
AACATATACCCCTGGTAGAAACCAAGCAAAAATGTTTCGCTGGATTTGTATCAATTATTACCTTTATTTTATATGTTATAGTTGTATATCATCAACATTT
GCCATGAAATTGCAATATGCTCAATGAGTTTCGAAAATG