Detailed information on CNT0001712 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9M3G7|ATM_ARATH, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

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:
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Expression of CNT0001712

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MDFWTWMIIMQVLLLLIKSTFSAQIEFSCFW*

>peptide 2 (29 aa)
MGTSVFQKTKFSIHLIFLLMLLFTKKFPC*

>peptide 3 (52 aa)
MPHLLYTRPLIEVCEEVLLPSTKVAFIKSPGIAKEVTECRNLSKRWESRSFF*

>peptide 4 (38 aa)
MYGNFSFSKDQIQYPSYISSHVTFHEKIPMLTFEIFYI*

>peptide 5 (47 aa)
LPSIELFVYVMSSIVYRLGNWLFCYWDLVYVLIFISFAPYKNFYIAG*

>peptide 6 (62 aa)
MFHLHDALKNFLWFTTILMSLMLKMTLTSLKSLNTNVYLSFWIALWKFSQKLKRFLKLRLLK*

>peptide 7 (36 aa)
MAGYGVVLNFAKDTIAYEFARTIYSISTSSTSSFKF*

>peptide 8 (2628 aa)
MKGKWLWNAAFCSLTRNYHTRICKDLFLYWFEGICMSFDRILNSANVDRIYDGLLWTLRSLQELSSVLLLPNLGTEISSMPSSTLNEFIHGWQLLWSTVV
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HGQVQQLIQDAIDSERLCQMFPGWGAWL*

>peptide 9 (35 aa)
MSLNSFLLKPKGKAHPYIGLEGLKKQNFSVLKVKM*

>peptide 10 (43 aa)
MLQLRMPCKGNVRLIFILHTMLMLYLKAMKKDLTLMNGKLQCV*

>peptide 11 (29 aa)
MLRGNTLCYADKQRSIADNCGSFYPRSSL*

>peptide 12 (64 aa)
MNFVFVMLWKDFHLCHQRVKFPRIQGLQVIVLKPGPLLQRFIGSPSTTFLLPSWQLVVDHILLQ*

>peptide 13 (86 aa)
MMIWIQVWRNHNMIAKEIRMLHVHFSVSSKSLMVMKMAKCEASMGRYNNSSKMQLILSDCVKCFLVGELGYNCHPSLYPSTPNDLV*

>peptide 14 (62 aa)
MRGTSAKHSRKFAIISGLLCIIFSWRDFYSQLSGLKRDLLIPEVLLLVLWLVTLLALEIDMQ*

>peptide 15 (32 aa)
MRETGGRPWSIMTCKCNQMPQYRRMAVQKVCH*

>peptide 16 (85 aa)
MVIMKLCLQSGNLFTCVGQMMQVKFENWFQISFLGLVLETHILLFSIFLARLVIFVLVNLLISAVQWKSVLTWMHAYLKNFWLSF*

>peptide 17 (30 aa)
MILRCVEKYCIISVNILSGLLLENLLIWSM*

>peptide 18 (38 aa)
MQNLIISFNIVVHGYFLLFLSMKTVPISIGLPRSLVNL*

Sequence

>CNT0001712
TTCTGCCATCTATAGAGTTATTTGTGTATGTGATGTCCAGTATTGTTTATAGGTTGGGAAACTGGCTATTTTGTTATTGGGATTTAGTGTATGTACTAAT
TTTTATTTCTTTTGCCCCCTATAAGAATTTCTATATTGCTGGCTAATTTTCCCTAATTTTTATTCCTCAGGCATGCCTGAATACAACCAGATCCTCATTA
AGTGAAAAACGGGTTAAGAGGGAGCCTGCTGCTGTGATCCTGAGGGAGGCACTCATGAAAGGCAAATGGCTATGGAATGCTGCTTTTTGTTCTCTCACTC
GCAACTACCATACTCGCATTTGCAAGGATCTTTTTCTCTACTGGTTTGAAGGCATATGTATGAGCTTTGACAGAATCCTGAATTCTGCGAATGTTGATCG
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TCTACCTTAAATGAGTTCATCCATGGTTGGCAACTGTTATGGAGTACTGTTGTGCACGGGTTACCGATTTTTAGCAATATAAATGCTCTTGTGGATGCTG
CTTTGCTGCTGCTTAGTAATATAACCTCAAATGATTTTGTAAATACAAGTGTTATACCTCAAGATGTATGGGAACTTCAGTTTTTCAAAAGACCAAATTC
AGTATCCATCTTATATTTCTTCTCATGTTACTTTTCACGAAAAAATTCCCATGCTGACCTTCGAGATATTTTACATCTGAGGAAAAACCTTTTGAGAGCA
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ATGTCTACTTGAGTTTTTGGATTGCTCTGTGGAAGTTCTCACAGAAATTGAAAAGATTTCTAAAGTTGAGGCTTCTCAAGTGAAAATTTGTCCACATGTC
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GAGAATTGGTTTCAGATTTCATTTCTAGGGTTGGTGCTGGAGACCCATATTCTGTTGTTTTCCATCTTCCTGGCGAGACTAGTCATCTTCGTCTTGGTAA
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TGGAGGTTGATCTTCACAAATTAATCTGTCTGCAGTTGGAGGAGCATGTATTTACAGAGTCAAATAAGTTGATGAAATCCATTCAAGTGGTTTTGAATTG
TCTTAATGAACTTCGTATTCGTCATGTTATGGAAAGATTTTCATTTGTGCCATCAAAGAGTGAAGTTTCCAAGAATTCAAGGCCTTCAAGTTATAGTTCT
AAAACCCGGTCCACTCCTGCAAAGGTTTATTGGCTCTCCATCGACTACCTTCTTGTTGCCAAGCTGGCAGCTAGTTGTGGATCATATTTTACTTCAGTGA
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GATGCTCTATTTAAAAGCCATGAAGAAAGACTTAACTCTAATGAATGGCAAGCTGCAATGCGTTTAAGAAAGCATAAGACAGTAGAGTTGGAAGCACTCA
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CTTAAGACCCCAGAACGGGTTCCATTTAGGCTTACAAGAGACATAATTGATGGAATGGGGGTAACTGGTGTAGAGGGGGTTTTCCGAAGATGTTGCGAGG
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GGTAAGTTGATTTTGATAATATATTTTAGTTTGTTAGAATTAGTGATATGAAGTATAAAAATTCAAAGGATCACTCTATTTTGCAAGAATGCTCTAGCCA
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AG