Detailed information on CNT0001755 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LUD7|CALS8_ARATH, E-value = 3e-06

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0001755

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MWGLLGVYQARRTSIMQFLLPIPAILLVLPT*

>peptide 2 (36 aa)
MLDTGKIQWKSIHKHYNTYLFWKSFQVTMIPTNHNS*

>peptide 3 (40 aa)
MVVSHCLRRPRVFRAPNLINLRFRRTVYRFLLSSYTICSF*

>peptide 4 (29 aa)
MHHYTSNVHKIVKFYALIHLLFLQVQVLI*

>peptide 5 (38 aa)
MSFLLHKFLRVSCICIVNALFLVLVSGALATVYSVITI*

>peptide 6 (51 aa)
MKYPSIYPKYYFLLVNLIFQFPILILTGTYILVMWFSFSIFLFSSLLFTLF*

>peptide 7 (57 aa)
MMRTFHFQERSSLLRRLDTFNDLEVTLRNSGDNHLEEPISITSLETFSLSYNVFSSP*

>peptide 8 (58 aa)
MLYFWFWFQVHWPLSIVLSPYNGQVVLDAPLHIKCPQNCQILCVNPLVVSTSSSAHLT*

>peptide 9 (44 aa)
MMILLYIALVREVKSECLIQEKYSGKAFTSIIILIYFGNLSKLQ*

>peptide 10 (74 aa)
MQRLFNLIVRKFVVANVGPTGCIPSQKDINNAVLITNSCNSLSVTNLNMINSPKSHIHVNGFEGNIFYKTLWRS*

>peptide 11 (134 aa)
MYIYVSETNCIINLYTRLHPVVIPLFASFKSRSSCDVVLYCQHCINDSSHNHSRIKLSIPCVVNEKGNISLLLGQELVLDLLVSPPPYLAPFTIGPIVLK
GVNYASGGGGIFVTIMISKLIVQLTIIFLSIIIL*

>peptide 12 (37 aa)
MSHMVIFFFFFSLPSVIPILVITRCYTLCYNGQIKKT*

Sequence

>CNT0001755
GTTAGATTAATCTTTATTAATATAACTTTTAACGAACAGAAATTAAATGGTCGGGTCATCATCTTTCCTAGTTTATTTTAATTTTAAATACTACTTACTA
TAGCTTATCATATAATAGCGGATGGATATTTTGATTACCAATGTGAGTTGCCTTCCCTATTAAGGCTTTGTTCGGCCATTGTATGGTATGGTTGTGAGCC
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CAAATCAAACTCCCCCTTGTGTATCTGTATTGTATTTATGATCTTGTGTGCTGAAAAAACGCTTTTGCAAAATAGAAGTCTTTGTTTTGAACTTCCTGAG
TTTTGGTAGTTTGATGATTTATTCATTGGAAGAAAATGTTCAGCTGATTTGATAAAGGAAATGTAATTGTATGAGTAAACCCTCAAATTAGTCCTTAAGA
TTGTATCCATCAATCACTTTAGTCCCTTTTGTTCCTTTTTAAAATTTACTCCCAACTTTTGTAAAAGGGCACTCTCCTTAGTCTTTAGTCCTTTTCTATC
TCATTTTTGACTGACATTAAGGATTACAATGAATGACTACAAAGTCGGACTAAATAAGAATCTTAAAAAGTCAGACTAAAGTGACTAACTCCAAAAACTA
ATTTAGGGGTTTACCCATACTTGTACAGATGCATATCAAAGACTAGTTTTCTTCTTGCTTGCAGAAATCAATTCCCAATAAGGTACACTTCATAAACACC
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AGTAGCTCTAGCAGGTGTGATCTTGTTTGATAACAAAGCTCCAAAAATATAATTTATCTGTGTGCATTTGGTAAGATATAATGTACATATATGTGTCAGA
AACTAATTGTATCATAAATTTATATACTAGGCTTCATCCTGTGGTGATTCCTCTGTTTGCTTCATTCAAGAGTAGATCCTCTTGTGATGTTGTCTTGTAC
TGTCAGCATTGCATTAATGATAGCTCGCACAATCATAGTAGGATAAAGCTTTCCATACCATGCGTTGTCAATGAGAAGGGAAATATTAGTCTACTACTAG
GTCAGGAATTGGTACTGGATCTACTGGTTTCACCCCCACCTTATTTGGCACCCTTCACAATTGGACCAATAGTTCTGAAGGGTGTAAACTATGCCTCTGG
TGGAGGTGGAATCTTTGTGACCATCATGATATCGAAACTCATAGTTCAGCTCACTATAATATTTCTCAGCATTATAATTTTATAAAGTCCTTTGTTTTGT
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TTACCAACCTGAACATGATTAATAGTCCAAAATCTCACATACACGTAAATGGTTTTGAAGGAAATATATTCTATAAAACTTTATGGAGATCCTAAGCTTG
GGAAGGAAAGCCTGAAAACCAAAACCATGCCATAGTTTTCACTCGTGGTGAAGCTGTTCAAATTATTGACATGAATCAGGTGAAGATATGTCTCATATGG
TCATTTTTTTTTTCTTTTTCTCTTTGCCATCTGTAATACCTATTTTGGTTATTACAAGGTGTTATACATTGTGCTACAATGGACAAATTAAAAAGACTTA
AGGAAAAGGAAGG