Detailed information on CNT0001756 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LUD7|CALS8_ARATH, E-value = 3e-06

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0001756

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (57 aa)
MMRTFHFQERSSLLRRLDTFNDLEVTLRNSGDNHLEEPISITSLETFSLSYNVFSSP*

>peptide 2 (38 aa)
MSFLLHKFLRVSCICIVNALFLVLVSGALATVYSVITI*

>peptide 3 (44 aa)
MMILLYIALVREVKSECLIQEKYSGKAFTSIIILIYFGNLSKLQ*

>peptide 4 (51 aa)
MKYPSIYPKYYFLLVNLIFQFPILILTGTYILVMWFSFSIFLFSSLLFTLF*

>peptide 5 (38 aa)
MHEFRLETPHMPPKLLNPECKSSKQLKALVCKIEVKTQ*

>peptide 6 (31 aa)
MWGLLGVYQARRTSIMQFLLPIPAILLVLPT*

>peptide 7 (30 aa)
MLYMFIYDMVFSSMYSRFPKFRISDLLVIQ*

>peptide 8 (37 aa)
MSHMVIFFFFFSLPSVIPILVITRCYTLCYNGQIKKT*

>peptide 9 (74 aa)
MQRLFNLIVRKFVVANVGPTGCIPSQKDINNAVLITNSCNSLSVTNLNMINSPKSHIHVNGFEGNIFYKTLWRS*

>peptide 10 (83 aa)
MLYFWFWFQVHWPLSIVLSPYNGQELVLDLLVSPPPYLAPFTIGPIVLKGVNYASGGGGIFVTIMISKLIVQLTIIFLSIIIL*

>peptide 11 (36 aa)
MLDTGKIQWKSIHKHYNTYLFWKSFQVTMIPTNHNS*

Sequence

>CNT0001756
ATCTTAATTAACTTGCATCTGAAAATTCATGCTATATATGTTCATATATGACATGGTCTTCTCATCCATGTATTCTAGATTTCCAAAATTCAGAATTTCA
GACTTATTGGTGATTCAATAATATTCATATTTTAGGCATATTTTAGGTTACAAGATCCTGTTCAAGAAACAATGATGTAGTGGAGCCCATGATAAAGCCC
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TGGAGACCCCACATATGCCTCCAAAGCTTTTAAATCCTGAATGTAAATCCTCAAAGCAACTGAAAGCTTTAGTTTGCAAGATTGAAGTGAAGACACAGTG
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AATGGAAATAGGAGACATTTTTTCAAATCAAACTCCCCCTTGTGTATCTGTATTGTATTTATGATCTTGTGTGCTGAAAAAACGCTTTTGCAAAATAGAA
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TTAGTCTTTAGTCCTTTTCTATCTCATTTTTGACTGACATTAAGGATTACAATGAATGACTACAAAGTCGGACTAAATAAGAATCTTAAAAAGTCAGACT
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CTCTTTGTTGTTTACTCTCTTCTAGACCTTGCATTACCACAACCTGTTTTGTGATAAGTAACCAATTCAGCTTGTAAGAAACTCTCAGAGTTGTAAACTT
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CTTGCATTTGCATCGTTAATGCTCTATTTTTGGTTCTGGTTTCAGGTGCACTGGCCACTGTCTATAGTGTTATCACCATATAATGGTCAGGAATTGGTAC
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TGTGACCATCATGATATCGAAACTCATAGTTCAGCTCACTATAATATTTCTCAGCATTATAATTTTATAAAGTCCTTTGTTTTGTTTATAAATATTTCTC
CTACAAATTTTGGTGTTATGGTTACTAACTTACTATTATATTAACATTCAACCACATGCAGAGGTTATTCAACCTCATAGTTAGAAAATTTGTTGTGGCA
AATGTGGGGCCTACTGGGTGTATACCAAGCCAGAAGGACATCAATAATGCAGTTCTTATTACCAATTCCTGCAATTCTCTTAGTGTTACCAACCTGAACA
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TTTTCTCTTTGCCATCTGTAATACCTATTTTGGTTATTACAAGGTGTTATACATTGTGCTACAATGGACAAATTAAAAAGACTTAAGGAAAAGGAAGG