Detailed information on CNT0001769 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LNG5|PPP7L_ARATH, E-value = 2e-17

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0001769

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (45 aa)
MQVFDGGSGRASISTWRTKKGTVQNQHKVRPLELLIPRKELKLCL*

>peptide 2 (59 aa)
MALIFTFPHRRLNNFPICTLLIVAFLLSPPKVLTFPICTLLNVQIIRSSSDYLKKFKFE*

>peptide 3 (70 aa)
MESPVPLAISSCIRSSQSNWQVPSTARCSWGVGGGQGCSATGGAGAGRTRQSYWRFAEREDSPVQLTSCF*

>peptide 4 (41 aa)
MAKTGNLSPSFFSLSPPSWLLAAGSRLFATRPERCCTVFHV*

>peptide 5 (35 aa)
MGTFRACFVYKEMCIATDYKTKSIEGMCILIQMWI*

>peptide 6 (66 aa)
MKRYKFLWKPYTATVMSLLPSICLVGSVAWWRWYHSFVFMLSDTNPIECCDNLECNNLFLRVLRNH*

>peptide 7 (36 aa)
MQTQLHWYLFVFEYHIDMSASEHSFGGIAKTHSHFS*

>peptide 8 (53 aa)
MASRCRFTIVRNSARTMLYRIPRVRQHSMIAFPEMVLEESGAAKIESDTKLFI*

>peptide 9 (69 aa)
MRFNGKTLKIEFVGTCSATPVVAPLCQTNLMGRPNDVHLSLCKYLMVALVEHLFQLGEQKKELSRINIK*

>peptide 10 (92 aa)
LIEDRGISGVLKKQTKLFPQVSQTQRSNGKVAKRQSGCSMIQNGFDFHFSSSETQQFSDLHSIDCSISLITTKSPNFSDMHSIERANHSIFI*

>peptide 11 (90 aa)
MQQSIPEGPPQPLNIHGIMLKGKPDENWGQLLAPLISQWNNRAEFRVDVYPRQKGLLSFNFDYMVWYKQKMKMFVDLKNANTITLVFICF*

Sequence

>CNT0001769
TTTTGATTGAAGATCGTGGAATTTCAGGGGTTCTTAAAAAACAAACAAAACTCTTCCCCCAAGTTTCCCAAACTCAGAGAAGCAATGGCAAAGTGGCAAA
GCGGCAAAGCGGTTGTTCTATGATTCAAAATGGCTTTGATTTTCACTTTTCCTCATCGGAGACTCAACAATTTTCCGATCTGCACTCTATTGATTGTAGC
ATTTCTCTTATCACCACCAAAAGTCCTAACTTTTCCGATATGCACTCTATTGAACGTGCAAATCATTCGATCTTCATCTGACTATTTAAAGAAGTTTAAG
TTTGAGTGAGTGTGTGGGATGGCAAAAACAGGGAATCTGAGTCCCTCTTTCTTCTCCCTCTCACCACCGTCATGGCTTCTCGCTGCCGGTTCACGATTGT
TCGCAACTCGGCCAGAACGATGTTGTACCGTATTCCACGTGTAAGGCAACATAGCATGATTGCATTTCCGGAAATGGTTTTGGAGGAGTCAGGTGCAGCC
AAGATTGAAAGTGACACCAAACTCTTTATTTAACTTGGATCATGGAGTTGCCGACGATGATATCAAGATTGGGAGATCAAAGGGAACAACAGAAGTTGTG
TTCGTGAGGCACTATGATGCTTTAGCAGCCATCAAGAAATACAACAATGAGGTTTAATGGAAAGACATTGAAAATTGAGTTTGTTGGAACATGTTCCGCT
ACTCCGGTTGTCGCACCTCTTTGTCAAACTAACTTAATGGGAAGACCAAATGATGTCCATTTAAGTTTATGCAAGTATTTGATGGTGGCTCTGGTAGAGC
ATCTATTTCAACTTGGAGAACAAAAAAAGGAACTGTCCAGAATCAACATAAAGTGAGGCCTTTGGAGCTTCTGATTCCAAGAAAGGAACTAAAACTATGT
TTGTAGACCTTGGGTACCACAGATAAACGTCCTTAAGGGAATGTATTGCTAAAGCAAACTGCCAGTTCCATTGACGAGTTTGTTGTGTTCGTACATGTGG
CATGGAGTCGCCAGTCCCATTGGCGATTTCGTCATGCATTAGGAGTAGTCAGTCAAACTGGCAAGTTCCAAGCACAGCTAGGTGCAGCTGGGGCGTAGGG
GGAGGTCAAGGATGTAGTGCAACAGGCGGAGCAGGTGCAGGAAGGACTCGCCAGTCCTATTGGCGGTTTGCGGAGAGAGAGGACTCGCCAGTCCAACTAA
CGAGTTGCTTTTAAAAAAAATTCTCCCATTATAAAAGCTTGATCACTCCACAACTGCTCCCTTCCTTGCACTACATTGCTTTCTTCTTCTTCCTACTACG
TGCTTTCTCTTCTTGGACATTGCTTCCTTCCTTTTCTTACTACGTGGTTTCTCTCTTCTTGATAAGTGTTTCTTAACTGGACGTATGCATGGGGACATTT
CGTGCTTGTTTTGTATATAAAGAGATGTGCATCGCCACCGATTACAAAACTAAATCAATCGAAGGTATGTGCATCTTAATCCAAATGTGGATATGAGAAC
GATGCACGACTTTGGCTCCAAAGAGGACTCCTCTCGTAATAGAAAATAAATCACTCGGACACAGGTGGTTGCGACGTGAAAATCAACATATTGACAATGA
TGATCTGATAGTTTTTCGTCACAAATTGGATATCATGAAACGATATAAGTTTCTGTGGAAGCCTTACACAGCAACTGTTATGTCACTGTTGCCTTCAATT
TGTTTGGTTGGAAGTGTAGCGTGGTGGCGGTGGTACCACTCATTTGTTTTCATGTTGAGTGACACCAATCCGATAGAGTGTTGCGACAATTTGGAATGCA
ACAATCTATTCCTGAGGGTCCTCCGCAACCACTGAATATCCATGGCATAATGCTAAAAGGCAAACCAGATGAAAATTGGGGACAACTGTTGGCCCCACTG
ATCAGTCAATGGAACAATCGAGCTGAGTTCAGGGTCGACGTTTATCCTCGACAAAAGGGTTTATTGAGTTTTAACTTCGACTACATGGTCTGGTATAAGC
AAAAAATGAAGATGTTTGTTGACCTGAAGAATGCAAACACAATTACATTGGTATTTATTTGTTTTTGAATATCACATTGATATGTCTGCAAGCGAACATT
CATTTGGTGGTATTGCGAAAACACATTCTCATTTTTCATGACCGACTATGACTCTTTCACAGTAACATGATGTTCCAATTGCAACACCTAATGCCCCATT
AGGTCCGCAATGACATGTATCCGGAGCAATACCTGATATGTGTGACTTATTAGATGTTGATTTGCGTCACGAGTTTTCTGTTGAGACTGAGTAAGTAGAA
GCAAGGAGATATCGCGGCAGAAGAAATCCTGATCGTCAAGCGCGAAGATAGGATTGACCATGTGACACTTCCTCACGTCATCACAAACATCATAATGAAT
GATATTCATGTCTCTGTTTAAATTTGTTGTTGTATGTTTGTCATTTGAATTTGACACTTAATCTATCGTATCTCATTTATTAAGGCTTACTAATGGATAA
AGTTTAAAAAAAAATTGAAGTAGATAAACGAAAATAACTGATGGTACTAACTAACGATGAACACCAATGTCATATGTGCACTATGATCCAGATACTTCAT
TGGACTCCTCA