Detailed information on CNT0001778 (Glycine max)


BLAST search results

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BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001778

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MNHMVFKQKKILVEQIMQQVHHLIKCYKEE*

>peptide 2 (93 aa)
MVGRMKMRRIYLIVACIYVGIKREWWIGRGNCSVPIYRVHYCYVLHFTPFFLSSVHKQGKRGNHLIKLLQYPHHGNQLVKREAQQIIVADSAI*

>peptide 3 (58 aa)
MLLLERVLTRALQSFLETMKVKLWQLQQSFIRVAEALALRCCIEDLLSLLSESSLDIS*

>peptide 4 (35 aa)
MVINAILTFGQISIVTGRIWWLHDNVWYGDIIKLD*

>peptide 5 (67 aa)
MVRWLINRELLLALTIPQNSKINILSKNITASCFRSTKGSANFCAQKGINRLNSKSTHHACSLVCHH*

Sequence

>CNT0001778
ATGATATCATGTGAATAAGATCAGATAGTGTATCAGAGGGATTTTGGAATTTGGATATTGTTCTCATTCTAAAAATATATTCATTTTGATCCATAGTCTG
GCATCTTCTTACTGTTTTAAACTAATTTGTAAATTTAGAATTCTACCTGATTTTTTTCTGGTTGAAAAAGAAGAAAGGGAACAAGCAAGCAAAATAAATT
ATAGATCGGAATAAAACATAGATGCCAAGAGCATGAAATCAAAAGGATGTGAAGAGACATTAATGAGATGAAAACTGAGAAGTATAAAATAGTACTATGG
GCGTTGAAGACAATCAAATTTTTTTCTTTTCTTAAAATATAAAAATGAGTCTTTTTTTCTTCTATTCATACCAGGTCAATTATGGGAACTTCATGCATGG
GCTGATGAGGGAGTATATCCAACTTTAACTGAAAGTTTCTGTCTGAGTATATCACCTATGAAGTTCTTCATGAGCATCATCTTCATCAAGTGATATGGGT
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GCAGGGTAATTAATACGGGAAAGGGGAATGGTAATTAATGCTATATTAACTTTTGGTCAAATTAGCATTGTTACAGGTCGAATATGGTGGTTACACGATA
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TATAGGGATTGGATTTGGATGGTTGGGCGCATGAAAATGAGGAGAATTTATTTGATCGTGGCATGCATATATGTGGGAATAAAAAGAGAATGGTGGATTG
GAAGGGGTAACTGCAGTGTACCTATCTATCGTGTTCACTATTGTTATGTGCTTCATTTTACTCCATTCTTCTTGAGCTCTGTACACAAACAAGGGAAAAG
AGGGAATCACCTGATAAAATTGTTGCAATATCCCCACCATGGCAACCAACTTGTGAAGAGAGAGGCTCAACAAATTATTGTTGCAGACTCTGCTATTTAG
TTTCTGTTTTAGTTAATTATTGTAATCTTGATAAAATCTCATAGTTGTTGAGATTTTTAGCAAATTTCAAGTTGTTTGTAAATTGATTCTCATTTATGGA
ATATATTGCCTTTTGTTTTCAATT