Detailed information on CNT0001787 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001787

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MLSLDLAVCKGVLEKKGCGLSCCRRCYPQTLISYI*

>peptide 2 (29 aa)
MCLLGKSIQCSCMVSGIIVLVRFMDSHFF*

>peptide 3 (106 aa)
RKIYLILYLVDNNWLQTDKKYVYRNPPQPQLLLRSHHKPPSTETEAEPKSREESENGNYDWCEPFMPQGFLQRIRLTAKRACCKVLFVMHVHLIVHRINF
SYDSMT*

>peptide 4 (67 aa)
MCTEILPSHSYSLDLIINPPLQKQKQNPRAEKNQRMATMTGVSLSCPRVFFNASGSPQNAHAVKFSL*

>peptide 5 (33 aa)
MFMHGEWHYCACQIYGLTFFLPIFATTFKSISC*

>peptide 6 (37 aa)
MVSGIIVLVRFMDSHFSYLFLQQLLNPFHVKFGSGSL*

Sequence

>CNT0001787
AGAAAAATATATCTTATACTGTACTTGGTAGACAACAATTGGTTGCAAACGGATAAGAAATATGTGTACAGAAATCCTCCCCAGCCACAGCTACTCCTTA
GATCTCATCATAAACCCCCCTCTACAGAAACAGAAGCAGAACCCAAGAGCAGAGAAGAATCAGAGAATGGCAACTATGACTGGTGTGAGCCTTTCATGCC
CCAGGGTTTTCTTCAACGCATCAGGCTCACCGCAAAACGCGCATGCTGTAAAGTTCTCTTTGTAATGCATGTGCATTTAATTGTTCATCGAATCAACTTT
TCTTATGATTCTATGACTTGACAGGACTGCAGAATGGAATTCTGAAGCGAGGGAGAGAGATTTTCCTCACTGGTTGCTACCTCCGAACTCCCACTGGAGG
TTCTGGACATTCACGTCTTTTGCCAACAGAGTATCTTGTGATTCTATTGGATGAAGTAATGGTCAAAGATTTTTTAATTTTAAATTTGTCCACTGTGAAG
TTTAATTGGGCTAACAAGAGGAGTGAGTGAGTAGGCTCAACATACATAAATGCCTGTTAGGAAGTCAAGCCCAATGATTCAATTTAATGAGAGGGACCTC
TGAGTATCTTTTTTCTTATCACGTCAATCATCTTGTTTTATATTCTCTCTTTTCATCTTTCTTTATTGCATAACATTTATCACGAAATTTTTGTACCAAT
ACAATTTCTCTTCTAATTTTTTTTAATTAAATAACTTTTATACTTTTGATACAATATTTTTTAAAAATAAAAACTTGATATTTTTGTATTTTTAACATGT
GTTGATGATCCATGAGTATACTTAAAATTCAAAAACAAAAGCTCTTTTAGATCTTTTTTGCACTTGGGAGAATTAAACGCAAGAGCTTTGCCTTAATTTG
AGCTTCAAGGAATTTCCTACTTCATATTGACTAAAAATAGAATGTTATGTGCTTATTAGGGAAGTCTATTCAATGTTCATGCATGGTGAGTGGCATTATT
GTGCTTGTTAGATTTATGGACTCACATTTTTTTTAGTCTATTCAATGTTCATGCATGGTGAGTGGCATTATTGTGCTTGTCAGATTTATGGACTCACATT
TTTCTTACCTATTTTTGCAACAACTTTTAAATCCATTTCATGTTAAGTTTGGATCTGGCAGTTTGTAAAGGGGTTTTGGAAAAGAAGGGGTGCGGATTAT
CTTGTTGCCGCCGTTGTTACCCCCAAACATTGATATCCTACATTTAACATTATATCTCTTGGAATACATATGGAAGGTTTATTTATCAGCTTTACCTAAG
TGATGTAGTGAGAGATGGGGAATGTATAAATTAACCCGGGGGTGGGGTTAACTTAAACATGACTGTGCAGCCTTTCTGAACCACAGTTGTAGTAGTTGTC
ATATAACATTCGTGAAAGAAATTTATCTTAAATGATTTGTCTTCTCATGCTGGTTCTGTTTATTGATGTGCATAAAACTATCTTCTGATCCAGGACTTCC
AGAAGGAAATTGTTAAAGCAGCAAAAACATTTACAGCTATAGGTTATAAGCATATTGAAACAGGAGCATTGTCTCTTGGAACTTCTACACCATTCTCAAC
AATATCAGTTAAATCTTGGAAGCCAAACAAGGCTTTCATCTAAACTTGCCACCTGCTGAAGTTCTTGCCAGTAAGAACTGGGAGATTCGCTGGAAAAGGG
CC