Detailed information on CNT0001838 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|O82782|HIS3_ARATH, E-value = 2e-06

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0001838

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (41 aa)
MSMMPFHILCYNNVIGTLLLHENATSITIVYMNLCLLTFKF*

>peptide 2 (42 aa)
MMISFYLVSLLIGFQCVKVYRLNDDGKWDDQGIGHVSIDYLE*

>peptide 3 (60 aa)
MYLLWFFMQKNPQVFVVIFLLKTICRNFPANFPVDIYLQVMFLRNFLSILFPRKIIVPTE*

>peptide 4 (29 aa)
MSIRWQEKLVNFCGMCSYNLCFYIAINCG*

>peptide 5 (46 aa)
MYMDKASCFLLKCTLIIRIVYSTWSAIMKTTFPFILVLCFFFSFQI*

>peptide 6 (36 aa)
MRCVSRSLPCISNFIGKPYQSLFSSSFVLNFLGFRF*

>peptide 7 (36 aa)
MVQFNLLMMCCYYLGGHYMYKAFSVSHGVLGCHLSK*

>peptide 8 (48 aa)
MIIHLLMNFCCFGKLILFNEALASVFVAFVFHDIIGYVYDAISYLMLQ*

>peptide 9 (53 aa)
MFQSNLCLQLSNSDQIISDQIIYSQLYVLLLMTAYDNSFANELLLLWQTHPFQ*

Sequence

>CNT0001838
TAATTTGGTTCCTCCTTAGAAGTGTAAGTGGCTTGGAATCTGATTTGAATTGATCACACTCATTTTCCAACTTATTTATGTTTTGTTAGGTAAACTTAAA
ACCGTCACAAGCTCACAACATTAGGCTTAAGTCAGTGTCTCTGTCTTTCTTGTGCACTGATATGGTATTGGAACTGAAATTAAATGACACTTGCTGCTTG
TATAGAACTCTGAGGCATTTACTATTAGAAATTTGCTAATTTCCTGCGGATTTTGTCGTGAAAAGAAAATCCACATGTATTTGCTGTGGTTTTTTATGCA
AAAAAATCCGCAGGTATTTGTTGTTATTTTTTTGTTGAAAACAATTTGCAGGAATTTTCCTGCAAATTTTCCTGTGGACATATATTTGCAGGTAATGTTT
CTGCGGAATTTTCTGTCAATTTTATTTCCTAGAAAAATAATAGTTCCTACAGAATAAAATCAAGATGCAAAAATGGTGCATAGGGGTGTAGTTAGCAAAA
TAGCGTGTAAATAGCAAGTGCCAATATCAGTATGCGTTGCGTCTCTCGTTCTCTCCCTTGTATATCTAATTTCATCGGTAAGCCCTATCAATCTCTCTTT
TCTTCTTCATTTGTTCTTAATTTTCTAGGGTTTCGTTTCTAACCCTTTCTTTTCTTCTAAAGTAAAAATTAGGTGAGAAGCTTCGTTGTGCTTCGAGGTT
CGTTCCTTTGGTGCTAAAAAGTGTTATGAGTTTGCTCGTTTGAAAAATGAGGTTGTAATTTGTCGTTTGCTCGTTGCTTCGTTTATCTCATTCTCGTTCG
GTGCTTTGCTGTTTCTCATTTGAATCTGCGAAGTACGCTCCTCAGTTGTATGTTTCGTGAAATTTCTGCACAGTGACATTATGTGCGTTTCGTGAAGGAG
TTTGCTTCGATAATTGTTATTATTATGATTCTCTATTTTCTCAATTGAATATTATTTGTATAATCTGATTATGATGGAGTTTGTAATTTAATTGTGTTCT
TAGACATGCAGTTTTTGCAGTGGTGCCTCAACTGAAATTGATTTGATTGTCATTTTTTTTAGCTTATAATTCCTTTCGCAACGAGTTATTACTTCTTTTA
TTAAGTGAAAATTTCAAACACAATTTGGAAAAGACTATGCAGTATTCTAGTATTCTATATTTTATCTGTTTGAATTTTATTACCGTTAATATGTGATGGT
AGAATTTGTGAAGTTGTTGTTGCGTCACTGGGCAGTGCATTAGTTATGGACTTATGGTTCAATTTAATCTTCTAATGATGTGTTGCTATTATCTTGGTGG
TCACTATATGTACAAAGCTTTTTCCGTTAGTCATGGGGTATTAGGGTGTCACCTATCTAAATAACAATTCAAAGCTTTCACTAATTATTATAAAGAAATA
AAAGTTTAGTTACTATAAAACTATAGTGATATAGTGCCTTTTGTTTCCTGCCTCTATAGTTTAATCGTGGATTGAATTTACACTCCAAAGTAGAAAAGTA
AAATGATACAGGACATAGATTATTTGGCTAATGTTCAATTGCATCTTGTTTTTTAATTGTCCTATTGGGTGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTG
TTTTGACCATTTTGTTGACACAAGACCATATGTATTGGTCTTCAAAGTGTCTATGCTATGCCTATATATATAACAATCACTATGTCTTTTATGGTTGATG
ATAGCTTTAAAACTTTTAGATCTTTCATCGGCTGAACTTAGCGTGGAGGACTGGTAAAATTTAGGCGGTCTGCAAGTTGGAGGGGGAATAAAATCTGATA
ATTGTTTGAGTTACATTGAGGAAGGAGCATGCCATGTCATTGTCACATTTGTAAGTCATATCTTTGAGTTGTTCAATGTTTTCATTCCATTATCTTCCGT
CAAATATTCATTGAGAAAAGAAAACATGTTTCGTTAAATGTATATGGATAAGGCTTCTTGCTTCTTACTTAAATGCACTCTCATTATCCGCATTGTATAT
AGCACTTGGTCTGCAATCATGAAGACCACTTTCCCTTTCATTTTGGTGTTGTGTTTTTTTTTTTCTTTTCAAATCTAGACTTTAAAAATGAAAACACAAA
AGGATCTATAATATGTCTATCAGGTGGCAAGAAAAGCTTGTTAATTTCTGTGGAATGTGTTCTTACAACCTTTGCTTCTATATTGCTATAAACTGTGGTT
AAGAGGCATATATGATGATTTCTTTTTACTTAGTCTCTCTTCTAATTGGATTTCAGTGTGTTAAGGTATATCGTCTGAATGATGATGGGAAATGGGATGA
CCAGGGTATTGGACATGTCTCTATTGATTATTTAGAGTAAATCTTTTTTATTTTTTATCTGAATGAAACTTTTATTTGTGACATGACAACTTGGGTAATG
TTATCATTTGATCTGTATAGCTTATTACACCTGGTGGAAAAAAGCTTTTGTATTGCTTCTTATTGAAGCCTACATTCTTATTTTTAGAATAATTACATTT
TAGTCCATATTGCTTTTTATCATGTTTCAAAGTAATTTATGTTTGCAATTATCAAATAGTGACCAGATTATATCAGATCAAATTATATACTCCCAATTAT
ATGTTCTGTTGCTGATGACTGCATATGATAATTCATTTGCTAATGAACTTTTGTTGCTTTGGCAAACTCATCCTTTTCAATGAAGCCCTTGCTTCAGTTT
TTGTTGCTTTTGTTTTTCATGACATAATCGGGTATGTCTATGATGCCATTTCATATCTTATGCTACAATAATGTTATAGGTACTCTTCTACTACATGAAA
ATGCTACAAGCATTACTATAGTATATATGAACCTCTGTCTTCTCACTTTCAAATTCTAGAGTGGTTGATATACACACTGAGATATACATGTTTATGAATC
TTGCCTTAATCTCTTGGAGCTGAGTTTCAAATTTTAGTTTGTCTCTATTGATGCCCGGATGATTTGTATTTGACTATTTGCAGTTGTTTGGAGAGATTCC
TGCACAGTAAGTATAAGTACCTTTCTGCATTCCCCCCTTTTATTTTATGCCTAAGTTCTTATAATTTATAGACTGATATGATCTAAATTCTACTTTTTTT
TTTCTTAGTTAATTTGAGTAGATTAATTTATAGATCTACATGGATAGATGTTCAAAATTTCTCTGGCAAACATAATTTGTGCCTTATTCATTGATTTGAC
CTACAATTTTTGTTTAGTTTGATTTATTTATCATGATCATTGTTAATCACAGGTTCAATCATACAGGGAAGGGTTTTTATTTATTTTTATCTGGAGTTAA
TGTTATGAAATATTAACCACGAGCTACGTTGTTCTACTTTACTGATCTAGTGACTTTTGTTGCACAGGAAAAATTACAATATTTTCACATAAAAGAGCTC
AAAGAAGCAAGGATTCTCAAAACAAAGCATGTAACTTTTCTAGAATGCATTTTCTAAGGACATAAGGATTTCCATTTTCTTTTGTTATGGATGAATAATA
TGTCTTTCCTTATTATATGAGGTATTAAATTGGTGTTTATAAAAACTGAAGGATTTTTTGTTGAATCTCTTCATTGGGAAATTCTCGTGCAACTCAGC