Detailed information on CNT0001892 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P10978|POLX_TOBAC, E-value = 5e-17

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001892

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (57 aa)
MYLKILLTTFQISLPRSAMNLLTALTACAMPGLVQIMVYIRLPTSTRIKCRYAEDSH*

>peptide 2 (35 aa)
MQKIHTKDNLVDVMVNPMNANKFEWSQSSFGLSKT*

>peptide 3 (31 aa)
MLLVPCHFKFCMIFSDFHTADCPVDFDSTKL*

>peptide 4 (40 aa)
MGEIKTCQMKMERFTNEGQVFSWKIYSICLISNVKRKKLK*

>peptide 5 (65 aa)
MFLSDIDCWHTCLLYIKCILLVIKYDVQLNRCIYVLKNLGVICMLILPPLSYFTTKSHSSLFVFS*

>peptide 6 (29 aa)
MMLLSRCLANPNSKQLIELLKEHFLNYVM*

>peptide 7 (49 aa)
MQTSLNGVNPHLAYQKRKQQGNDKVERNLEAHKSSFKWEIVKLWTVKQL*

Sequence

>CNT0001892
CAATTACCCATTTCCTTATAGCACGTGATATTCCCCTTTTGTAAATCAGCAACCAGTACACCCCACACAACACTTATCACTTACGATCCTAAACACCAAG
CTTCCCTCACGAGTTTGATGGCTTAGCACCACTCTCTTTTCCTTAATTTCTTTCGTCGCAGTGGATGTTGTCGACACCCACAGCAACAAAAATCATCATC
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GTCCCATGTCATTTCAAATTTTGTATGATTTTTAGTGATTTTCACACTGCAGACTGCCCTGTTGATTTTGATTCTACGAAGCTGTGAGATAAAAAATAAT
AAACTGCATTGTTTGGCATGTATTGATGCTTGCTATGTATTTTTAGTGAGAAATAGACTTGATAAGGATCTTGAGGATTTGGAATCGGTGGATTTTCATT
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ATAGGTGTATATATGTGTTAAAGAACTTAGGTGTTATCTGTATGCTTATTCTCCCGCCTTTATCGTATTTTACTACAAAGTCTCATTCCTCCTTGTTTGT
GTTTTCTTGATTTTGCTTGGTTTTAAGCATTGAACAGGTGAGAAGGATCATAGGAAGGCCACAGTGGTAGGGCAGATGGTTGTTAATTAAACACAACAAC
CGAGGGTTGTGTGCTATTATATGTTTTGCTTGTGTTATGTTTTGTTTTGTATAGTGTATTTGTGGGAGCTAATGGCCTAGGCCTATTTCCTAATCCCCTT
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TCGTATTCTATTGTTCAAATTACTCAAATTCTTATTCGACACAAGGCACTTTGACTGTCACAATACACAGTAGTCTTATGCTGTAGTAGACAAAGACACA
GCAAGCTGTAATTTGGATAACCTGCTCACTGACCCTCCTTCCAAGTGTAAACACATAGTCAATAGTAGATTTTCTCTTATCAAGATCAGCTGCATACTGA
ATCAACATAGCTCCTAACAATAAATTCTGATCTTTCAAAACATAATGCAACACCTGAGGTTCCATTGATGTATCTAAAGATCCTCTTAACAACATTCCAG
ATCTCTTTACCAAGATCTGCCATGAACCTACTAACCGCTCTCACTGCTTGTGCAATGCCTGGTCTAGTACAAATCATGGTGTACATAAGGCTTCCCACCA
GTACAAGAATAAAGTGTAGATATGCAGAAGATTCACACTAAAGATAACCTAGTAGATGTTATGGTGAATCCCATGAATGCAAACAAGTTTGAATGGAGTC
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AGTTGTGGACAGTAAAGCAACTTTAAGTAAAAAAGGAACGGCTGAATATTTTGCCTCTACATAGCTAGGACTGTGAAATTAATTGGAAGGGTAGAAATTG
TGCCATGGCATTTAATGCATACGTTGCCATCTTTGCCTATAAATAGCTAGTCGTTTTGCTCATCAATTGTGGTATCCATTCTTAGAGAAAGTTCTTTGAG
TGAGA