Detailed information on CNT0001920 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9M8R4|DJ1D_ARATH, E-value = 6e-07

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001920

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (49 aa)
MSSKFPFIECFFIFCFENFHEQNAEDSLIFVFFLLGLLYMHDFFHVNIR*

>peptide 2 (57 aa)
MKSMYAASFCVTLSHGVFCVHEIITFVTQVYSYLSSFSLRQSSSFCIPCLLARIIGL*

>peptide 3 (39 aa)
MVYFVFMKSLLLLLRFILILALSHLGSLLAFVYLVCLLG*

Sequence

>CNT0001920
AAAAATGTGTTCAAAATGCACTCTTGTGCTCTAGTTTATTTGTCAACCTTGATCTCCTGATGTGATCAGTTTAAAGAAGTATATCTGATTTCCTTAATCT
TGGGCTGTATATGATTGAAAAGCTCAACATCAAAGAGTTGTAGGTTTAAAATTCAAATGTCTGGTTCCAACATGTTATTAAACTACTATGAGCTCTAAAT
TTCCTTTTATTGAATGTTTTTTTATCTTTTGTTTTGAAAACTTTCATGAACAAAATGCTGAAGATTCACTAATATTTGTCTTCTTTCTCTTGGGCTTGCT
GTATATGCATGATTTCTTTCATGTTAATATAAGGTGAATAAGCACAATTTTGGTGAGTTCTAGTTGGCTTTTCTTTCTCAAGCAAAGAAAGTTCTAAATT
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TGCTGATGGTGTTCTAAAGGTATTATTACTGTAAACTCAAAAGGAACACTGTTTGTTATGTTTCACATATGCTATCAACCAGTATTTGAATTGAATGGCT
ATTGATATAGTTTGTCAAAAAAAAGTTGAGGTAATCTTGAAGTAGATATTTTACTACTGTTTTCTTAGAACTCATGTTCATTCTACACTTGTTTCTATTA
GTCTTTCCTGTCAAGAATTGTTTTGTACCAACTAAGAAGACAAAATTCTTTTGAATTGTTGGGCTACAAAGCTGTAACTAATAAGGTTGAGCAAGTACGA
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CATATTCTGTGCAGGCTTACTTTCTAATTAGTCTGGATTAATGAAATCTATGTATGCAGCCAGCTTTTGTGTGACTTTGTCTCATGGTGTATTTTGTGTT
CATGAAATCATTACTTTTGTTACTCAGGTTTATTCTTATCTTAGCTCTTTCTCACTTAGGCAGTCTTCTAGCTTTTGTATACCTTGTTTGCTTGCTCGGA
TAATTGGATTGTAATCCTTAGTTCCTTGCCCTCTGTCTCCCATCAAGGAACATAAAGACTGATAATACGTAGAATTAAGCATAAAGAAATTAAATATATG
TGGAACATGAC