Detailed information on CNT0001933 (Glycine max)


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Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0001933

Created with Highcharts 4.1.6Chart context menuExpression (RPKM)1.3981.0751.0511.0191.2222.6523.3321.7930.4570.5480.1990.3250.142.2380.905leaves (SRR924099)leaves (SRR924144)leaves (SRR926169)seed (SRR639168)shoot apical meristem (SRR824155)shoot apical meristem (SRR824156)shoot apical meristem (SRR824157)shoot apical meristem (SRR824158)shoot apical meristem (SRR824159)shoot apical meristem (SRR824160)shoot apical meristem (SRR824161)shoot apical meristem (SRR824162)shoot apical meristem (SRR824163)whole seed (SRR639162)whole seed (SRR639164)01230.250.50.751.251.51.752.252.52.753.253.5

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (40 aa)
MVRKLQARKMGWCRTEEVESGKFVRKCEKTEEILRNCIGK*

>peptide 2 (48 aa)
MDPSLFVCGCTSMFMCISACALIDSSFQALGVAQPFRGAPLEYFHMDF*

>peptide 3 (39 aa)
MEKVIRKGHDLVPFKFMIWTHLYLYVGALVCLCASVHVL*

>peptide 4 (88 aa)
MRYLKEGLFHLAHLTVVCLISLGYEMILKMGFLMFFLSLQASFDAESSSVPSVRRGIPIEEYRRPETYPKSNENESGDTDFVAMAKDV*

>peptide 5 (38 aa)
MAGLSNYCLSVTVVLLSLFFKCDSNFHLFFTFHTFQAC*

>peptide 6 (57 aa)
MLQSNKEYTEEDITDEVLKGRSVPFSSSDGGVFDFPGLRNDIENGFFDVFSKSPSIF*

>peptide 7 (74 aa)
LQKTLLNLISQVPRQIINPKSRYGAQVASAKNGVVQNRGGRIWKVRQKVRENRRDSQELHRKVILLFSSSFSLI*

>peptide 8 (29 aa)
MGEAQFILHFKCLWRRLFEKGMIWFHSNL*

>peptide 9 (41 aa)
MFCLGTWRERECFQSHLHTHTGFLQLNLSSVSWSILCTVDI*

Sequence

>CNT0001933
GATTACAGAAAACTCTACTAAATCTAATAAGTCAGGTTCCACGACAGATTATTAACCCTAAAAGCAGATATGGTGCGCAAGTTGCAAGCGCGAAAAATGG
GGTGGTGCAGAACAGAGGAGGTCGAATCTGGAAAGTTCGTCAGAAAGTGCGAGAAAACCGAAGAGATTCTCAGGAATTGCATCGGAAAGTGATACTTCTT
TTTTCCTCTTCTTTCTCACTTATTTAAAAAAAATAATATTTTGTCAATACTCTCAAATCTGATGCCCTATAAAATACGATTGATTGATTAGTTATTAGGA
AGAGATTTGCTATGAATTCTAGCCTACCGTGTGTGGATTTTTTTCCCTTAATGATAAACTAATTTGATGAATGTTTTGAATCAAAATCTGGGTTATAATT
GGTAACGGATGCACTGACATCTTTGCTCCGTTTAAGAATTAGTGTAAAGCCTCGAGGTATGGATTTTCAAGGGAAAAATGTCCAAAAAGTCTGTTGTATC
TTCTAGAGCTATCTATGGGCGTATGACAGTGGTATATATATCCTTTTCTAAAGGATTAAGATAAGTTGGTAAGTCACAAGGATTAAGATAAGTTGGTAAG
TCACAAGGTGCAGGTACTATTCGCTTAAAATCGACTTGTAGAAAATCTATAAAACTAACTGAATTGTTATGAAGCTTTCACAATGACCTTGACATGTATC
TAAGGCCATGGTTGAAAATTCTTAAAAGAGGCAAACTGAGTTTTATAAAAAGCCTTGAGAATGATTTGTAATGAAGGCCTTGTTTGTCAGTCCTGTTCTT
CTATTGATCAAAACAGAAGCTTAAATGTATAACCAAGATTGTCATAAAACTCAATTCAATATAAATAATAATTTGTCCTGAATCTCCTATTCTATTTCTC
TCCAACTTATTTTGATTTCATCTATCTGCATTCATGCAAAACCAGGTGAAAATGGCTTGTTATTTGATATGACTATGGTAAATGGGTGAAAGTGGGTAAG
AGTAAGACATACTATGTAAATATGTAATGGCCAGATTAGTTTTTTAAATCTAGTTTGTTTAGTCGTTTTAAGATATAATTTGAATGATTAGTTTTTTTTA
TCATGACAAACCATATAATCGCCTTCGTAATATTATAGAATAATGAATTGTTTCTTGTTACATTGTTGGATGTCAAATTATTTTCTTATCATGACTCACA
AATAGAGGACTTATAACCATATTAGAAGTGGAAGATTCAATTGATTTTAATTGTCTGTTCTTTCAACTGAAAATCAAATTGCTATAATGTTTTGTTTGGG
AACGTGGAGGGAAAGGGAATGCTTCCAGTCACACTTACACACACACACAGGATTCTTGCAATTGAACTTGTCATCAGTGAGTTGGTCCATACTATGCACA
GTTGATATTTGATGGCCAAGCAGCCCTAGTTATAAGAACCTTTGTACCCCACTTAGGCTTTGACTCAGAAGAAGAAATAAGAAGGTAAAATAAATTGAAT
TTCTCTCATTAGTTTAAATCAACTTATTCAATTAATTTTATAGAAGTTTTCCCATCCAACTTCTCCAAAAGCTGAGGAGCATAAGTTGATTTTAACTTAT
GCCTCATGGGTGAAGCTCAATTCATTTTACATTTTAAGTGCTTATGGAGAAGGTTATTCGAAAAGGGCATGATTTGGTTCCATTCAAATTTATGATATGG
ACCCATCTCTATTTGTATGTGGGTGCACTAGTATGTTTATGTGCATCAGTGCATGTGCTTTAATTGATTCCAGTTTTCAGGCTTTAGGTGTTGCACAGCC
TTTTAGAGGTGCTCCATTGGAGTATTTTCATATGGATTTTTAAAAGATTCTGTTCTTTATAGGTTGATTTTAATGTTTGGGCATTAAGAGATTATTTGAG
AATATGGCTGGACTATCCAATTACTGTCTCTCTGTAACAGTCGTATTACTTTCACTCTTTTTCAAATGTGACTCAAATTTTCATCTCTTTTTTACCTTTC
ACACTTTCCAGGCCTGCTGAATGTTGCAATCAAACAAAGAGTATACTGAAGAGGATATCACAGATGAGGTACTTAAAGGAAGGTCTGTTCCATTTAGCTC
ATCTGACGGTGGTGTGTTTGATTTCCCTGGGCTACGAAATGATATTGAAAATGGGTTTTTTGATGTTTTTTCTAAGTCTCCAAGCATCTTTTGATGCAGA
GTCATCCTCAGTGCCCTCTGTGAGGAGAGGGATACCTATTGAAGAATATCGTCGGCCAGAAACCTATCCTAAATCCAACGAAAATGAATCAGGAGATACT
GATTTTGTTGCAATGGCTAAAGATGTTTAAACTTTAAATATGCCCTGGATATAAAATAAGTTTTCTTAGTTTTGTATTAAATTGTTAACATCTGAACCAC
AAGCAAGTCCTCTAATATATGCTTCTCTGCATCGTTGGCAGCTGTTTAAAATGTTTCTTTACTCTTTTTCTTTAAGCTGTGGCTGATGGAGCGTGTGACC
CAATTTATATCTTCCCCTACACTCAGTTATAGGCGATATGAATGATTAAG